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CRISPRs details
NC_012726_2
Flanking alignement tool
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NC_012726_2                                                                                                                 
top
Strain :
Sulfolobus islandicus M.16.4
RefSeq :
NC_012726 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_012726_2
DR consensus (24 bp) :
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
Number of repetitions :
61
Begin Position :
861534
End Position :
865382
861534
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTAGTTCCAGAAAGCGTAAAAATGAAGCTACTAGACGAA
861596
861597
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTGAGTTATTGCGTAATATCCTTGTCCGCTTGTGTGTGT
861659
861660
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTACGACAAAGTTACCTAGACTTTGAACTGCATTTGTTAAT
861725
861726
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACTTTTCTGATATTCTGAGAAATAATGGAATGTCCCACAT
861789
861790
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTTTGCTGCACTGTTGGAATTTGAAATACATTCATTATTT
861854
861855
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TGTAACTTTACAGTAAGAAGCTGGATTAGGATTTCTTCTACAT
861921
861922
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AACCGGGCCTCTCTCATTTAGAATGACGGATGCTTCTTT
861984
861985
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TGTATCGTGAAGGTCAGGATTATTTCGTTAGGCTCACAT
862047
862048
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CCTCATCTTCATCAATATTATATTCTTCCTTAGCTGCATA
862111
862112
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTTGATTCTTTCTTCTCCCTTTAGATTATCTAGTTTT
862172
862173
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTGACCCAACCCTAAAATAACGTATAAGTTCGCTCTCAT
862235
862236
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGCCATCCAGGTCTGAAAATGACTAAGGGGATTATTTG
862297
862298
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCTTTTCATTCATTCTGCTTTCCCCTGATTTTATAGTAG
862360
862361
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGTATGTCCCTATCAATTACATCTGGTATATCCTCAACCT
862424
862425
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATATCTCTCTATGAAATTGTACTACTACATCTTCCTCACT
862488
862489
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCCCATCCCCCACGCTAACTCGATATTACCATCATCTAA
862551
862552
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTTCCTCCAAAAGAAGCACCCTTGGTATTATTGTACGAT
862614
862615
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGGGTACTACCAGCGTAAATTCCGCCTACAATTGATATT
862677
862678
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTCTGTTCTGTGTTGTTCTGTTCTATACTCTGTTCTCTG
862740
862741
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTAAACCAAAATGTGCCTTGAGCCAACTTTATTACAAT
862803
862804
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TACACCCCTCGCGGGGGTCATCGCCATCCGCTTTTA
862863
862864
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TATTCTGTCTCTCAAGATTCAAGATTTGCAAAACACTTA
862926
862927
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATAACAATTCCTAGCTCTTCATCCTATATACCGTCTGTT
862989
862990
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATAAATGCTTTTGTTGAAAATTTTCTTGAAAATTCGCTACATCG
863057
863058
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TACAATTTCGCTAGTTGTATCTACGTTGTTAAACACTAC
863120
863121
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CATTCTTTCCCGCCTTCTCATCTTCTATCTTTTTCCTTACTG
863186
863187
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTTCGCTCTCTAACTCTATTGTTCCAGTTGAGGAAACA
863249
863250
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTTTTAGGCTATAAGACTCATGCAAATATACAGAGAAGA
863312
863313
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AACTTATTATGTATTGTTACCATGTGTACATTTCTAGCG
863375
863376
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACTTTCGTTTAGATTTACCTAGGGAGATTCAAGAAAAGT
863438
863439
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TATCGGTGCCTTAGCGTCAAACGTTGAAACAATATTAGC
863501
863502
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTTCACAGAATCCCGAGCAGTTGGCAATCGCAGCAGCT
863564
863565
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AATATCTGGATCATATATGCCTTAAGTTTTGGATTATATCT
863629
863630
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATAGAATGAATATTGCACCGTCTTTACAACATTACCAAA
863692
863693
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTAACACTTAAACTTGAGTTATCATCATCAATTGATAAA
863755
863756
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CCTATACTAACAATTATTGACAACGACACATTACAAGAAGA
863820
863821
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTGAACGCTTGCCAATTTGCGATACCACTTGCTTGAGTTCCA
863886
863887
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACTCTCAATAGAAAACTCCCTACCCTGATTTGTTCATCA
863949
863950
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TGCACATGTCTCAAGACTATTGTACTTTTGCTTGCAAAGAT
864014
864015
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCTAAGATTTCCCCTATAGTATCTTGCAGTTCTTCTAATTC
864079
864080
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTTTCACTTCCTCCAGCTTGGCTTCTAATTCTCTGACAC
864143
864144
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTTAGTTACTGTAAACTCCCCAGTTTACGAAATAATTAAT
864208
864209
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TACTGCCTGGAAAATATATATGACATTCAAGAAAACATT
864271
864272
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACAAAAACATGAGCCAAATTCCACTCGATTTGGATATA
864333
864334
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTTCAATAAACTTAAAAGTTCTTTATCCAGAATCGATAA
864397
864398
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATGACATATTTACAGCACTAAAAGAGGCATTATCAGAGTTAA
864463
864464
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TAGGAACACTAATAGGTGAGTAAGTATCGAACCCTACAT
864526
864527
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCGTAAGAACGATCCTAAAGTTTGTTATCGTAAATCCA
864588
864589
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CACTTCCTCAATCTCCTTTACATTATAAGTGACCTTG
864649
864650
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCATGGGCTTATCACCTCATTCTTCCTCCTCTTCGTCTT
864712
864713
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACAATTATTGTGCCGGGTTTAGCATATTCTTCAACTAT
864774
864775
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACAAGTGTTATTGATATCGGTGCATATGTTGGCGATACTGC
864839
864840
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CAAACAGCTGTTCAACAACAAACAGTAACGCAACAAGCCTCGT
864906
864907
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATCCCAATAGCTCGAAAAACCCCTCACTTTCGTTAAACTT
864970
864971
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTTAATATAGTCCTCGACCATAAGTAGAATCTCAGCAAT
865034
865035
GATAATTTACTATAGAATTGAAAG
CAATATAAAATAATAATAAAATTGAAAGGAAGTAAGTGCG
865098
865099
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTCTCTCTATGTCATTTGTTCCTTATAAATGTTTCTCTCT
865163
865164
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACTAGCTCTAGCTCTGCTGGAGGATTTAGTGGCTCAACGCTAT
865230
865231
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TAAAATTCCTAAATTTTGCAATGCTTCTTGCAATAACAAA
865294
865295
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CATGAACATTAATGTAGTTGAGGCCGACCTAACATACAAG
865358
865359
GATAATCTACTATAGAATTGAAAT
865382
Left flanking sequence : Till position 861534 (length
bp)
AGTGAAAGGATGAGGAGAAAAATTGAAAAGATAATACAGAGTAAAGCTTATAAATAACGAAGAGAGAACA
AGATATTAGATAAAAGTTAATAAACCCTCA
Right flanking sequence : From position 865382 (length
bp)
ACTATAATGTAAGTTAGATTTTATAAGTAGAGTCTTTATTTACAATAGTTATAATGGAGTAAGAGGACTA
GTTTTAGCTTAAGATGTTGAAAATGAGCGA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp