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CRISPRs details
NC_013216_9
Flanking alignement tool
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NC_013216_9                                                                                                                 
top
Strain :
Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771
RefSeq :
NC_013216 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_013216_9
DR consensus (30 bp) :
GTTTTTAGTCTACCTATGAGGAATTGAAAC
Number of repetitions :
18
Begin Position :
3748348
End Position :
3749510
3748348
GTTTTTAGTCTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATGGTTCACGTACTTTTGGGTCCCTTTTCTCAAGTTC
3748414
3748415
GTTTTTAGTCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCAAGATTTATTCCTAACATTGATGCAGTAATAAAGC
3748481
3748482
GTTTTTAGTCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TCTTTGTCTTTAGGCTTTTCATCTTCATCGCCCCAGC
3748548
3748549
GTTTTTAGTCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CACAATCGGCATGTTTAAAATGCTAAAAGCGCATACT
3748615
3748616
GTTTTTAGTCTACCTATGAGGAATTGAAAC
GCAATTGCACAGCATCGGTGGTAAGTTTTCCATCAA
3748681
3748682
GTTTTTAGTCTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATTGTTTCGAAGGTATTTATTGTGTCTTTATCAAAAC
3748748
3748749
GTTTTTAGTCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTATATTCTAACCCTGATGAAACATCTTCATTTACTTT
3748816
3748817
GTTTTTAGTCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CGGCTTTAGACTTCTTAGGTCTATTAGCTTCGTATAA
3748883
3748884
GTTTTTAGTCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TATCTTCAAACACATTACAATTGTTAGGCATACGA
3748948
3748949
GTTTTTAGTCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TGATACCTGCAAGCGCTCCAGTAGTGACATCCTAAGC
3749015
3749016
GTTTTTAGTCTACCTATGAGGAATTGAAAC
ACTAACCAATGAAAACAACTGTAGTTAATGTTAACTTC
3749083
3749084
GTTTTTAGTCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCCGATCTTGTGGGCATGAAGAGGTCGTGTCTCTGG
3749149
3749150
GTTTTTAGTCTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATGCTGAAAGCATTAACTAAAGTTATTTTCATTTAT
3749215
3749216
GTTTTTAGTCTACCTATGAGGAATTGAAAC
GATAACTGGTTAGCTATCTCAGTAGCCAGTGCAGCC
3749281
3749282
GTTTTTAGTCTACCTATGAGGAATTGAAAC
CAGTGTCGGCTATCTCAGCAAGTTTATCTAATGTAG
3749347
3749348
GTTTTTAGTCTACCTATGAGGAATTGAAAC
TCTTGCTGACCTAGCACACCGGCAAACTGCCAGGA
3749412
3749413
GTTTTTAGTCTACCTATGAGGAATTGAAAC
AGTATATATAGGGGGATAGTGTCACGTATGTTACGCAC
3749480
3749481
GTTTTTAGTCTACCTATGAGGAATTGGTGT
3749510
Left flanking sequence : Till position 3748348 (length
bp)
ACTAATATATCTAACTTTTAATGATAATGCTAAGTATAATACTTGTTTTAACTGTTTATTTGATGTAGAC
TTAAAAGTAGACATTCTAAGGTTTTAGTGG
Right flanking sequence : From position 3749510 (length
bp)
GAAAATTAATTGCCTGTGGAATGCCTACATGCTTCGGTAAACGGTATAGGTTTTGTCGACATGGAAATAC
GATCAGGTAACTTTGAAGGGTTAAGTGTTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp