Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_013315_10                                                                                                                 top


Strain : Clostridium difficile CD196 RefSeq :NC_013315 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_013315_10
DR consensus (29 bp) : GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGNumber of repetitions :15
Begin Position : 1294727 End Position : 1295680

1294727GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTCTCCATCTCCAATTAACATAAATAATTCATCCGCTG 1294792
1294793GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGCCGCTTGGCAAATCATAAGAAGGATTATTTTCTCCAAC 1294859
1294860GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAAAATAAAAGAGTTTGAATTACCCATTTTTTCATG 1294923
1294924GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTACGACATTGAATAAAATGGGTACAGAGACAATTTATAA 1294991
1294992GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTTATAAATCTTTTAATGACTGTCTCTGATGGTACAG 1295057
1295058GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAAAGGAATAGATGATATGATTGCTAATGCTGAACAACAA 1295125
1295126GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGGGTCTGACTTTAATATATATATATATATAAATT 1295188
1295189GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTATAAACTCCCACGACAAAATTAACTATAACCTCGT 1295254
1295255GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAGTTTTAAAGAGGGCAGACCTAAAAAATATACTAAAA 1295320
1295321GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGCAGAAGATTTAGCGACTGTTGTTGCTGAATGGGATG 1295386
1295387GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGATTAAATTGCTCAGTCTAGTACTTAAAGAATTATAAG 1295452
1295453GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTGCTATGATTTAATTATACGACGTTTTGTCTTTAAAG 1295519
1295520GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTGCTGTGCCACAATTTGATGCTTCTATAGCTAAATTC 1295585
1295586GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGCTTTTAAGTGCATCAAAGGAGTTACAAGCTATATTTA 1295651
1295652GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG1295680
Left flanking sequence : Till position 1294727 (length bp)
GGTATGTGATAAATGTTATCATTTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAATTGTATAGATGT
AAGTGTTGGAAATACTCAATTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1295680 (length bp)
ACAGATCTAATATCAAAATAAGGTTATGACTTTTAAAAGCATAGCCATATCAGTAAAAATTTAATTATCA
TTTAAAAAATAAATTTTTATTTAAAGAATA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp