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CRISPRs details
NC_013315_10
Flanking alignement tool
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NC_013315_10                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile CD196
RefSeq :
NC_013315 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_013315_10
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
Number of repetitions :
15
Begin Position :
1294727
End Position :
1295680
1294727
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TCTCCATCTCCAATTAACATAAATAATTCATCCGCTG
1294792
1294793
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
CCGCTTGGCAAATCATAAGAAGGATTATTTTCTCCAAC
1294859
1294860
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AAAATAAAAGAGTTTGAATTACCCATTTTTTCATG
1294923
1294924
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TACGACATTGAATAAAATGGGTACAGAGACAATTTATAA
1294991
1294992
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TTTATAAATCTTTTAATGACTGTCTCTGATGGTACAG
1295057
1295058
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AAAGGAATAGATGATATGATTGCTAATGCTGAACAACAA
1295125
1295126
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
GGGTCTGACTTTAATATATATATATATATAAATT
1295188
1295189
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TTATAAACTCCCACGACAAAATTAACTATAACCTCGT
1295254
1295255
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AGTTTTAAAGAGGGCAGACCTAAAAAATATACTAAAA
1295320
1295321
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
GCAGAAGATTTAGCGACTGTTGTTGCTGAATGGGATG
1295386
1295387
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
ATTAAATTGCTCAGTCTAGTACTTAAAGAATTATAAG
1295452
1295453
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TTGCTATGATTTAATTATACGACGTTTTGTCTTTAAAG
1295519
1295520
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TGCTGTGCCACAATTTGATGCTTCTATAGCTAAATTC
1295585
1295586
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
CTTTTAAGTGCATCAAAGGAGTTACAAGCTATATTTA
1295651
1295652
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
1295680
Left flanking sequence : Till position 1294727 (length
bp)
GGTATGTGATAAATGTTATCATTTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAATTGTATAGATGT
AAGTGTTGGAAATACTCAATTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1295680 (length
bp)
ACAGATCTAATATCAAAATAAGGTTATGACTTTTAAAAGCATAGCCATATCAGTAAAAATTTAATTATCA
TTTAAAAAATAAATTTTTATTTAAAGAATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp