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CRISPRs details
NC_013316_10
Flanking alignement tool
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NC_013316_10                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile R20291
RefSeq :
NC_013316 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_013316_10
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
Number of repetitions :
15
Begin Position :
1292344
End Position :
1293301
1292344
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TCTCCATCTCCAATTAACATAAATAATTCATCCGCTG
1292409
1292410
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
CCGCTTGGCAAATCATAAGAAGGATTATTTTCTCCAAC
1292476
1292477
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AAAATAAAAGAGTTTGAATTACCCATTTTTTCATG
1292540
1292541
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TACGACATTGAATAAAATGGGTACAGAGACAATTTATAA
1292608
1292609
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TTTATAAATCTTTTAATGACTGTCTCTGATGGTACAG
1292674
1292675
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AAAGGAATAGATGATATGATTGCTAATGCTGAACAACAA
1292742
1292743
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
GGGTCTGACTTTAATATATATATATATATATATAAATT
1292809
1292810
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TTATAAACTCCCACGACAAAATTAACTATAACCTCGT
1292875
1292876
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AGTTTTAAAGAGGGCAGACCTAAAAAATATACTAAAA
1292941
1292942
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
GCAGAAGATTTAGCGACTGTTGTTGCTGAATGGGATG
1293007
1293008
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
ATTAAATTGCTCAGTCTAGTACTTAAAGAATTATAAG
1293073
1293074
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TTGCTATGATTTAATTATACGACGTTTTGTCTTTAAAG
1293140
1293141
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TGCTGTGCCACAATTTGATGCTTCTATAGCTAAATTC
1293206
1293207
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
CTTTTAAGTGCATCAAAGGAGTTACAAGCTATATTTA
1293272
1293273
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
1293301
Left flanking sequence : Till position 1292344 (length
bp)
GGTATGTGATAAATGTTATCATTTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAATTGTATAGATGT
AAGTGTTGGAAATACTCAATTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1293301 (length
bp)
ACAGATCTAATATCAAAATAAGGTTATGACTTTTAAAAGCATAGCCATATCAGTAAAAATTTAATTATCA
TTTAAAAAATAAATTTTTATTTAAAGAATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp