Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_013316_10                                                                                                                 top


Strain : Clostridium difficile R20291 RefSeq :NC_013316 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_013316_10
DR consensus (29 bp) : GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGNumber of repetitions :15
Begin Position : 1292344 End Position : 1293301

1292344GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTCTCCATCTCCAATTAACATAAATAATTCATCCGCTG 1292409
1292410GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGCCGCTTGGCAAATCATAAGAAGGATTATTTTCTCCAAC 1292476
1292477GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAAAATAAAAGAGTTTGAATTACCCATTTTTTCATG 1292540
1292541GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTACGACATTGAATAAAATGGGTACAGAGACAATTTATAA 1292608
1292609GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTTATAAATCTTTTAATGACTGTCTCTGATGGTACAG 1292674
1292675GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAAAGGAATAGATGATATGATTGCTAATGCTGAACAACAA 1292742
1292743GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGGGTCTGACTTTAATATATATATATATATATATAAATT 1292809
1292810GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTATAAACTCCCACGACAAAATTAACTATAACCTCGT 1292875
1292876GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAGTTTTAAAGAGGGCAGACCTAAAAAATATACTAAAA 1292941
1292942GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGCAGAAGATTTAGCGACTGTTGTTGCTGAATGGGATG 1293007
1293008GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGATTAAATTGCTCAGTCTAGTACTTAAAGAATTATAAG 1293073
1293074GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTGCTATGATTTAATTATACGACGTTTTGTCTTTAAAG 1293140
1293141GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTGCTGTGCCACAATTTGATGCTTCTATAGCTAAATTC 1293206
1293207GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGCTTTTAAGTGCATCAAAGGAGTTACAAGCTATATTTA 1293272
1293273GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG1293301
Left flanking sequence : Till position 1292344 (length bp)
GGTATGTGATAAATGTTATCATTTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAATTGTATAGATGT
AAGTGTTGGAAATACTCAATTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1293301 (length bp)
ACAGATCTAATATCAAAATAAGGTTATGACTTTTAAAAGCATAGCCATATCAGTAAAAATTTAATTATCA
TTTAAAAAATAAATTTTTATTTAAAGAATA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp