Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_013316_15                                                                                                                 top


Strain : Clostridium difficile R20291 RefSeq :NC_013316 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_013316_15
DR consensus (29 bp) : GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATNumber of repetitions :15
Begin Position : 1845528 End Position : 1846482

1845528GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTAATTTATCTATAATTTAAAACGGTGAATTACATAT 1845593
1845594GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTAAAGAGGGGTACTTCGTACTTTTACCACTCAAACTA 1845659
1845660GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAGGTCAAGCATAGATTTTGCAACTGGAAGATAAGAAGA 1845726
1845727GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGTTTTAGAACAGAAAAAATTGTATAAATTGTGGAATG 1845792
1845793GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTGTAAAATGTAAATAGCATATTAATTTTTCTTTCAC 1845858
1845859GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTGGAGCATTATGTTTTTAGGTTACGGAGCAACATTTA 1845924
1845925GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGGTGATAGTGGAAGTTTTACTTATACTTGGCGTGCTG 1845990
1845991GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTCAGAATACTTAGCTCCTGCGCCTATATCGTCTGAAT 1846057
1846058GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAAGTTTTGCGCATTGTATGTGTGCCTAGATTATCT 1846122
1846123GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATATGTCCCCACATCAATTTTCCTCCGCATGAAAAAATC 1846188
1846189GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTAGAAACAACAGAATAAACATAATATATAAGCATA 1846254
1846255GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTTACTTTTCCTTTCTATGTGTCCAATTCGGACACATT 1846322
1846323GTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAATCTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATAT 1846388
1846389GCTTTATATTAACTACATGATATATAAATTGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCGCTTGAAATTT 1846453
1846454GTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT1846482
Left flanking sequence : Till position 1845528 (length bp)
GGTGTATGATAAATGTTATCAATTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAGTTGTATGTGTGT
AAGTACTGAAAATACTTAGTTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1846482 (length bp)
TTGCAACAAGTATAGGTAAAATACCCCAATAATTTATACAGCATTTTCTACTTTAAAATATAATTATTTT
TTATCATTTGTAGTAAATAATTACCAGATA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp