Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_013769_2                                                                                                                 top


Strain : Sulfolobus islandicus L.D.8.5 RefSeq :NC_013769 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_013769_2
DR consensus (24 bp) : CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACNumber of repetitions :107
Begin Position : 785731 End Position : 792627

785731AGGGCGTTATTATAGTAGATTAACAAATATGTGAAGACGAAGCAATTGCAAGGGTAATATACACTAA 785797
785798CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTAATTCCCATGGATTGTAGATATTTTTCGACATATTTGGA 785862
785863CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTGAAACAACATACAAGGAAATTACATGTGCTAAACAAGTGCC 785929
785930CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATGTTATATCCGGCATCTCTCAACAGCTTTTCCTGAGC 785991
785992CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCTGAATTTCGATTGAAAATGCCGATGCATATATTTCCCCCAT 786057
786058CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCTCTTGAAAGCTTTCTTCTTGTAAAAAATCCTATTAA 786118
786119CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAAACTAAAGAAGCCGTGAAGACTATCGCGGGGATCT 786179
786180CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTAATTTTCTAAGCTCACTTTCAGCATTTCCTAGATTTAT 786242
786243CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTCCGCAGAAAGTGAAACATCAGACTTATGCACTTCTTCTTC 786307
786308CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTCCGTTATTGATAAAGCATTATCGCTAGCAGTGAGAAT 786369
786370CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTCTGCACCTAATCCTCCCGCCTGATTATTCATATCTATTAC 786434
786435CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAGGAGATTTGCCTTTTGCTGACCCTCCTTTTATACAAAT 786497
786498CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTGAAGAGAGGGGTATTATACCTAAGGATTGGGAGCCGAAAG 786563
786564CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATAAAGTCGTAAACCTTAAGCTTCCACACCTTACGGTAATAAT 786630
786631CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTGAAGAGATTAGTGGTACAATTAAATGCAATTCCTGAAAA 786694
786695CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTCTGATAGGAGTAGCACTTAGTCCTAACCTTATCGAATT 786757
786758CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTGAAATTTATAACGCCATATAATAATTCATATTTATG 786818
786819CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAGCAGATGCGTTATTCGATCCCAATTTCAAGCCCTACAGTAAG 786885
786886CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACACAACAATATCCCTATCTGCATACGTACATAACACTATAT 786949
786950CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCTTCTTAGTCAAACTTACACCCCTTGTACTTTTACTCTAATTT 787016
787017CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATACTAGTTTTTACACATAGTCTAATTGGTGATAAAGAATGA 787082
787083CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCACCTCCTCCTACTTGTCCATTTGTACCGACATAACCTAG 787146
787147CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTGTAGGCTCAAACAGCCTCACCGCATTTCTGTTCAATAAG 787211
787212CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATACACATGGTCATTCTAACATCATCAACCAAGAAATATGCTT 787278
787279CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATATTTACATCGGTAATCCATGCCCTAATGCTTTCGATT 787341
787342CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGAAATGTGGTACCAAAATTAAAATCGGGAGCGATGGTCGT 787405
787406CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTGGGCTGAGCAAAGAGGAATTATGAACCGTAAAATGGTAGA 787470
787471CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTCGTGGAGGGTACTATTTGCCTACCCTTACAGAAAGAGC 787534
787535CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGATATACTTAAATGCACACGGTTATAAGGAGAACCTCAT 787597
787598CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTCAGGGTTCAGAGGATCTGTTACAACAGAAGTAATTTC 787659
787660CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAGAAATTGACAATTGAAAAATTAATAACTAATAACTCTC 787722
787723CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAAGGAAGAACACCTAGATCATACAGTCAAAGATATGCAAAA 787788
787789CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAGTTTGAAAAAGGAATAAATGAAATTTATATGGATCT 787849
787850CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTAATGTCAACTATGGAATACATAGAACTTCCAAATGATGTTA 787916
787917CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAACAATTACATTCAAAGCCTACCAGAAAGTGTTAAAGAA 787979
787980CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTAGAAATTAATAAAAAAACTGTAGCGGTGATATATGAAAGAAT 788046
788047CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAGTATAGTCTTAGCTAAATGTGACTGTTGTAATCCTCAAAGAAT 788114
788115CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAAAGCAAGACAATAAGTATATCTTAGTTTTTCATAGTAAAGA 788181
788182CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCTATTATGAAAAGGGGGGCGAAGGGGTCGGGCTTGTAAAC 788245
788246CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCGCGGGACTAAGAGAACTTTAAGATGTCCTTGTTCTGAGACTAA 788313
788314CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAGGCTTGTGATGGTACGCCGTACCTTGTTTCTAGGAAT 788376
788377CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAGATTGAAACTAATTTCCCGACCATAATCATATCTGGCGT 788440
788441CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATGTAGAAACTCCAATATTATTAGCATGGCAAAATAA 788501
788502CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAGGTATAAATGTTGTGTATGCTATAGATGTATGTAG 788562
788563CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATTAGCTTGCATATGACTTCATTAACAGAATAAATTATGGTGT 788629
788630CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACACTTGACCTTGGGTGGTGTTGATATAGTATGCAATATTACC 788694
788695CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCGCGAAATTCGTGAAATGCAAAAAGATAGGGATTTAAAGA 788758
788759CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAACGTTAATAAAATATACAATAATTTCAGCAGTGTGAGA 788822
788823CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTACGTCTAAAGCAAATCCGCTATTAATTATAGAATTTAAATT 788888
788889CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTATAATAATACTTTACTTTCTTATTAGCTGGATAATAAGA 788952
788953CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTAGAATTTAAGCAAAAAGATTATGCGATATTGGGATTCAT 789016
789017CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTGTATTTTGCAATGGTAACTGTGAATTTAAGTACTTGATAAC 789082
789083CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATAATTCATATCTGTGCGGAATTGACTATAAAAATTCGATT 789147
789148CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGTATTTTTTTCATTAATCTGCACGAAACTAACGTATTTTAA 789212
789213CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAGACATTCCAGAAAAGAGAATTTGCGATAAAACCCAAA 789275
789276CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATTTCATTAAAAGATAATAAATACCCATTTTTTGAAGATA 789339
789340CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACACGATAAACCTAAGTGCTAACGCTTTTGTGAAGAGTATATAC 789405
789406CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTGGACATCAGGCTACTGCTGAAGCGTTATCAAATATATT 789469
789470CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAGTAGCGAAATTATTGCCTCTTTGCCATGCTAATAAAAT 789533
789534CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAGAAACTATCAAAAAAGCTATCTCAAAATTAGCAGAATATGT 789600
789601CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTCTTTGCTTCTTCTTGTAGCTCTATCTTCTGTGTTTGGGCTTCT 789668
789669CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTACGCTTTCATGAATTAATGAACCTTGTAGTGTTGA 789728
789729CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCAGGTTCAACTACCACCATATCGCATTCTGGAATTGA 789789
789790CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGATATTGGCAGAAAAAAAATAGAAGTGATATATGAACGTCT 789854
789855CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAGTTTTGTAATTTGTTCCAATTGTGTTAATAATAACTGAT 789918
789919CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGCTCATTATTTAAACAACATTTGCATGATCCTTCTCTAGG 789982
789983CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTCAAAGTCACAGAAAGAAATAGAGTGTTTTTTTACCA 790044
790045CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCTATAATTGCTATTAGGAATATCGGCTATTTCACCGTAAGT 790109
790110CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTCGTTCCGTTACGACGAATGGAGCCATCCCTTATTCGTGGA 790174
790175CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAGACTTTAAACGTGAGACATTTCACCCAAGAGTAATATACAA 790241
790242CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATACATAGATTAAATTAGTGATAAAAGATGAAAACAGTTGAAGT 790309
790310CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTTCCGTCAATAAGTCTTAACCAGTACCTGTAACTGGGTTTA 790375
790376CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAGAAGAACAAGAAAATGAATTAAAGAAAATGCTAGAGGAAA 790440
790441CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCCTTGTTATCTTTTTTGTTGCTGCTGTATAAAACAGAGCGC 790505
790506CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTCAAATAACATCATCAGATCATGATTCAGTGAGTTTTCAAT 790571
790572CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTAGATATATTCAAAACTTGCAGTAATGTCGACACTTGTGTATAA 790639
790640CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTATATGATATATTTGTGAAAGGAAAGACATTAGAATTTCCATTGA 790708
790709CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATAAATGGTGTCTCACTTGATTTAGTACCTGAGACTGTCTCTGTT 790777
790778CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTATTATGACAAGGTAAGTGGGAAATTTGTGGATTACAAAG 790841
790842CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTGGTCTTTTCTACCTTATATTTGAAGTCTGAAAGTTTAA 790905
790906CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTGAGGACTCTTTAGAACAACTCCTTCAATATTTGTTGGTAAATT 790974
790975CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAGGAATGACGTTCGTGTTTTCTAAGATACTTGTTAACCCACCTAT 791044
791045CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACACGGTTAAGATACCTTTTTGGCGATGGTATTGGAATTTTATTT 791111
791112CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGGAATAGGAATTATCCTACCTCAGCCTCAACAACAAAATTCGTC 791179
791180CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGTATCTCATCGGCAATAACATAAATATGTATTCCACCATG 791243
791244CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAGTTCCCCTTAAAGGAAGAACAAGGGCATTTGAAAATAATA 791309
791310CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATTTTTTAAAAGCATTTGCTGACCATTCAGAATTTACAATTAT 791376
791377CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATATAAATTGTATTATTTCTTAGATCATAATTAATTGTAAT 791441
791442CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAATTTATATGTCAGATTCTTAGAGTAATAAAGGTGGAAAAA 791507
791508CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATAGCTCATTTTTTCACCCCGCCAATATTATTGTTTTCTG 791571
791572CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGATCTCCCGCTGGTTCACTAGGAGAGGTAAAGCATCTA 791633
791634CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAGAGCTATCAAATCATCTTTGCTTTGCAAATAATATCT 791695
791696CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTAACGCTCTACTCTATCTTATTAATAGCGTAAATACTCTAAGG 791762
791763CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGACAAAGTAAAGAACGTTAAAGGAATTTATTATACACTGAA 791827
791828CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTCAGGATCTTCTACCTTCCCTTCTTTATTTTTCACGCAT 791890
791891CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGTGAAGAATTTCAAGAATATTTAAGTTTAGTAAAAACAAT 791954
791955CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTAAAATTTGCAGGCAATATGGCAGATGTGTATAAAGAGTTAAA 792021
792022CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACACCTAGTTTTGGGGTTCTCTACATAATCCGCTACCCCTC 792084
792085CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACACTTCTCTTTACCAAAGCCTAACGGTTACGGTTTAATTG 792147
792148CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATGCCGTACTCATTGTTGATGAGAGGAGCGGGCTACCGGTAA 792213
792214CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAGAATTATTGGCACAGCTAGCAAAGGTCAAAAAGATGATCAC 792279
792280CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGTCGACGGTGCCATATTTGTAGCAATCTCTGCTATTCCTATCGT 792347
792348CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTGTCGGAAAAGAGTATGTTGAGGAAATTAGAGTAAAAAAC 792411
792412CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTGCGAATATAATCAAGAAACCGATAGAAAATGGAGTTGA 792475
792476CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTGAACCACACCCTGCTGTAAGACAAATCACTATAAGAAA 792539
792540CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATACCAGTTTTACATATCTATCCTTTACATGATCTAGATG 792603
792604CTTTCAATTCTATAGTAGATTAAC792627
Left flanking sequence : Till position 785731 (length bp)
AGAATAGCGAGAAAAAGACTGAAAATTCCCTACATAAAATCCTACAAGATCGACAAGAAGAGACCAATAG
ATGCCGACAATATACTTAGGGAGAGGTTGA
Right flanking sequence : From position 792627 (length bp)
TGAGGGTTTTTATAACCCTCTATTCTATCTTTTATTCTCCCTTTCTTATAAGTTTTTCTTCTCTACTCTT
TCCATTAGTATTATATTACTTTTATCTTTC
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp