CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_013891_4
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_013891_4                                                                                                                 
top
Strain :
Listeria seeligeri serovar 1/2b str. SLCC3954
RefSeq :
NC_013891 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_013891_4
DR consensus (29 bp) :
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
Number of repetitions :
28
Begin Position :
454307
End Position :
456081
454307
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
GAATACTGAAACGGCTGTTCAAGCTAATTATTTTT
454370
454371
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
CTTTTTAACTTAAATTATATTATACTAATTAAGTTTG
454436
454437
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
AAATTTAGGAGGAACTTAAAAATGAACAGATACG
454499
454500
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
CTCTTCCGCGAGTGCCTTTTGACTCTTGTAGCGCTTT
454565
454566
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
CAGGTAATCAAGCTGAAACGATTAAAGGAATTAAAGA
454631
454632
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
TTGGGAATTCGTGGTAATATTGTACTACGGGAATAAG
454697
454698
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
GCACGAGGCGAATCGGCAGGAATAGGTTCCTTCATT
454762
454763
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
ATACCCAATTGCCATTCTCATCTCGTTCATAGTCCC
454827
454828
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
GTATTTAGGTTGAGATTAACATACCCGAAATAACTATC
454894
454895
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
TTGGACTTTAGTTTGACTGTCTCTGGTACTTTAGTC
454959
454960
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
TCAGGCAACACCTTAAGCGCCTTGAATAGATTCA
455022
455023
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
CAGAAGCAATGCACCAGCCACCGCTAAAAATGTAATC
455088
455089
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
GCAGTTACAAATTTAATAATTTCATTTCTATATTTTA
455154
455155
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
TCTTGTATTGCTTCTTTAATACACATGCGCATAT
455217
455218
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
CCTCGAAAGTACGTATGAGCTTGTAACGGGATTCAT
455282
455283
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
CTACCTTGCAGCGACAGCGCGTAAGTCGCAACATC
455346
455347
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
TCTGTTGCAAACGCTATGCGTATTGCAGAAGTGCT
455410
455411
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
CGCTGTCATGGCATAAGTATGGACCGTGGAATTATA
455475
455476
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATATAAAT
ACGAGATGGTAAGAACGCATTGTTTGACTCGCTCCA
455540
455541
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
AAAAGTATTCGCTTCTTTGATAAATCAATTCCATCAA
455606
455607
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
GCAGGAAAGGGAGAAACTTCATTAGATGGGCTAAAG
455671
455672
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
AGATGTGCCGGACTTCACCTATGTGCCAGTTAAG
455734
455735
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
TTCAAAAACGGGCAAGGAGAACAAGAAGCTGATTTTA
455800
455801
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
ATAATTTCTTTTATCTTTTCATTCTTATC
455858
455859
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
CGAATAAGTAGAGCTGGGATTATAATAATTTCCTTCA
455924
455925
GTTTTAATTACTTATTGTGAAATGTAAAT
AAAAATGGATGAAGCAGGGTATGATGCAGAATGGGA
455989
455990
GTTTTAATTACTCATTGTGAAATATAAAT
AAAAGTTCGATTGCTTTTTAATCGTCCAAATATT
456052
456053
GTTTTAAACACTTATCATGAAATATAACC
456081
Left flanking sequence : Till position 454307 (length
bp)
GTTTAAGTCGAGAAAATAAGATAGATTTTACCTGCTTTTTACGGCGGTCGACAAAAACAAGCCCGTGAGG
TAAGATGGGAGTAGGGAAAGATATTGGCGG
Right flanking sequence : From position 456081 (length
bp)
CCGCCCACCCTCAAAGCCAATAATCTGTTTTAAGGATTTTTCATCTAAAAACCACACCACAATCCTCCCA
TTTTTTTCATCCAGCGAAAACCGTTTTTGA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp