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CRISPRs details
NC_013894_4
Flanking alignement tool
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NC_013894_4                                                                                                                 
top
Strain :
Thermocrinis albus DSM 14484
RefSeq :
NC_013894 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_013894_4
DR consensus (29 bp) :
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
Number of repetitions :
36
Begin Position :
389627
End Position :
392006
389627
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
GGTATTTGCTGGCTGGTCTAAAAGCATGTTTAAAGTCT
389693
389694
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
GGTTTTGACTTCATACACTAAGCGCTCGTGGTAATAT
389759
389760
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
GTCATGCTTTGAAATTTTACTTCTTCCTGCTATAATTGT
389827
389828
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATATACTGGTTTAACTCTACAGGTTTTACTGGGCGACCCTTGCTGT
389902
389903
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
GTAAACATCTTCTACTATTATTTCCATTCCTGAAGCTA
389969
389970
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
TGATATGGGTATATCCCCCCTATACTCAGGAAAATC
390034
390035
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
GATGGGAACTTTTTTCATTGTGCCATCCTTTACCAGC
390100
390101
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
GATGGGAACTTTTTTCATTGTGCCATCCTTTACCAGC
390166
390167
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
GCACATGTGTATAGCCGATAGTGGCTTTCAAGCCC
390230
390231
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
GAGGAGTGTCTCCTGGCTCTCGGAAGAGAACGGCTGGA
390297
390298
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
AAAGAAGTTTGTAAGGAAGAGCTTTCACCTCTTCTTCGC
390365
390366
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
CTATAGCGATTTATGTGCTCCTCTGTAAGTTCGTAGAG
390432
390433
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
TCATCTATGAGATAGATGGCACTCTCATACACGGACATCTT
390502
390503
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
TGAGGGCGAAGAAGCTCAATCCTGTATTTCCGTAAAA
390568
390569
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
GACGGGCGTTCACTGAAAGAGTGTTCTTTTGTGGCT
390633
390634
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
TGTTAGCTAAAATGCCTGACCTGTAAATTGCCCTAATTTG
390702
390703
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
ACTATCTGCTGATAGAGGTAGCATCTAGGGCATACAG
390768
390769
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTCATATAAGGATGTGTGCTTCTGTTTGTGATAGGGAC
390835
390836
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTTGTCCCAGTTGAGAAAAAAATTTTTTTTGTCGGAAA
390903
390904
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATGTAGTTAACATGCTTGAGATACTCAAAAGCATAGGG
390970
390971
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
TCTGCTTTCCATTTACGCCCTATATCGTAGTATTCAT
391036
391037
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
AGACCATTCTTGAGAGAGCAGTAAAGGTAGAAATAGC
391102
391103
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATGGACATCAGGAAAGGTGTCGGCTTTGCTAATGTATGG
391170
391171
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
AATAGTGTGCTTAGGATCCTTGCGGTGGACTCGTGACCCACCG
391242
391243
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
GCTATCTTTTCTATTGTTTCATCCTACCAGTAACGAG
391308
391309
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
TCTGATACGAGCTGGTCAGCTATCTGATAAGCCATTCTG
391376
391377
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTAGTCAATGAAATGATGACACGGTTGATGAAGTCCTC
391443
391444
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
TCTTGGTTCTGTCTGGATAAACCTTTGCTCAAACTCTAT
391511
391512
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTCTCAGCCTGCATAAAGGCTTTGAGGAGAAGCCCGGG
391578
391579
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTAGGATCTATGCTCATTATCCCAAGCCCCTTGTCAA
391644
391645
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
TGTCTTTCAAAGCTTTCCTAAAATCACCACTCTCAAA
391710
391711
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
TCTTGGTTCTGTCTGGATAAACCTTTGCTCAAACTCTAT
391778
391779
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATGGGGATAGTGCTGACGAGAGGTCTTCCTACGCTGGG
391845
391846
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTCTGTATCTATTTTTTCGTCTGTCCAGTACTCCCG
391910
391911
GTTTCTAATGTACCGTGTGGAGTTGGAAG
CAGGCTTATGATAAATCGGTAAAAATCCTTTGCTCAAA
391977
391978
GTTTCTAACGTACCATGTGGAGTTGAGAG
392006
Left flanking sequence : Till position 389627 (length
bp)
GAGACATCTGGAGTTTCCGAAAATAAACTTCATTTTGCGAAGGGTACCCCCTCTCTAAAGTTATTGATTC
TGTAGGATAAGATTAATATGATGAGTTGGG
Right flanking sequence : From position 392006 (length
bp)
ATTAGGTCTTTCTCCAAATCTCTGTACACTCCAAGGTGCATCTTAACCACTTTACCGTTTCTGTCTATAA
GGTAAGAGGTGGGAAGACCCATTAAGCGCA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp