Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_013974_11                                                                                                                 top


Strain : Clostridium difficile BI9 RefSeq :NC_013974 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_013974_11
DR consensus (29 bp) : GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATNumber of repetitions :8
Begin Position : 1530358 End Position : 1530849

1530358GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATACGGGAAAGCTAGAGGGTGTTTGGACTTTAGAGGAAA 1530423
1530424GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCGTTCTTGGAATGATAAATATAGAATTGGTTGGATA 1530488
1530489GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTTTTAAGCTCCACCTTGTCTTAAAAGTTTAAGCAATA 1530554
1530555GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTATACTTATAGGAGTTGGAATTATAATATTAACTACAA 1530621
1530622GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATATTTGATTTTAATGGTACGTTTTCGCTTTCTCTAAG 1530686
1530687GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTACAACGACTTATATTCTAAAATAAAAATGTAAACTTC 1530753
1530754GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCTATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAT 1530820
1530821GTTTTATATTAACTATACAGAATGTAAGT1530849
Left flanking sequence : Till position 1530358 (length bp)
AGTGCATGATAAGCGTTATCAATTGCACTATTGCTCGTTCACTGCAAATTTAGGAGAGTTGTATACGTGT
AAGTGTTGAAAATACTAAGTTTATTTTGGT
Right flanking sequence : From position 1530849 (length bp)
TTTCATAATTTTCTTTTAATGTGTTATCTTATGATTATCTAGTTACATTAGCATACAAAAATATAATAAA
ATTACACTATATTATAAAAACAAAAAGGTA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp