Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_014152_3                                                                                                                 top


Strain : Thermincola sp. JR RefSeq :NC_014152 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_014152_3
DR consensus (36 bp) : GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACNumber of repetitions :27
Begin Position : 2078344 End Position : 2080300

2078344ATTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACGCAAACCCGCCGGAACAGGCCGCCGGGGGATGGGACC 2078416
2078417GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACTAAATTCCGAATGGATACTATTTCTTGTCCAGATGCTG 2078490
2078491GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACTTTGAAGCCGATGTAGCCTACTACGAAATTTACGCTTC 2078564
2078565GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACAATCAAAAATAATCCCCCGCCTCCCGGCGGGTAGA 2078635
2078636GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACGCAGGGCCGGGACTAAAATTGGCTATAGTACTC 2078704
2078705GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACGATATTATACGAATTATTGTAATTCGTTCTGGTC 2078774
2078775GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACTATGACATAGCTACGTATAATGCCAGAAGAATAAC 2078845
2078846GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACAAATAATGGACGACACGGGACTATATTCGCCTAAAG 2078917
2078918GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACTGGCTTTGCAACTTCAGCTGGTGAAGTTGTGGTCATA 2078990
2078991GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACTTATATGACCCCTTATGACTATTCATGTTCTGGTAGTAT 2079065
2079066GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACGTAGTAGCACATAGAAAAGCAATGTCAGCTAGCTTTTCT 2079140
2079141GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACTGCTACATGTTCACAGTCCATTGTCCCCGCTGCGCCAGTGA 2079217
2079218GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACATTGATAATAATGGTACTTTAGAAGAATTATATCAAAA 2079291
2079292GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACTTATCATCAATCCATTTCAAAAAATATTCTACCGTAC 2079364
2079365GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACTTATATGACCCCTTATGACTATTCATGTTCTGGTAGTAT 2079439
2079440GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACGTAGTAGCACATAGAAAAGCAATGTCAGCTAGCTTTTCT 2079514
2079515GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACTGCTACATGTTCACAGTCCATTGTCCCCGCTGCGCCAGTGA 2079591
2079592GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACATTGATAATAATGGTACTTTAGAAGAATTATATCAAAA 2079665
2079666GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACTTATCATCAATCCATTTCAAAAAATATTCTACCGTAC 2079738
2079739GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACAGTACAGAGCCATTTCTTGGTTCTGCCATCAAGCAATTC 2079813
2079814GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACGAATTAACACTTGTTTCTTCGGACAGTTCGACGAGGTG 2079887
2079888GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACTGCTCCGGGGTCACGGAGGGAGATTATTACTTTCCCCCTCCGC 2079966
2079967GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACAAGCCATTTTAGCACGTTCTTACAGAATCGAAAAAGCACAA 2080043
2080044GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACAAAAATGCAAATCAAGACAAATTGTGTTTGGACAAAA 2080116
2080117GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACGCTGTTATTTCCTGCGCTACGTGTGCACCCATAGCGTAGG 2080192
2080193GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAACATGAATTAAGGATGGAATAGTTAATTCCTGCACAGT 2080264
2080265GTTTCCGTCCCCTTACGGGGATAAGGAAGATTAAAC2080300
Left flanking sequence : Till position 2078344 (length bp)
AAGGCAAACATCAGTTGACAGTTGACAGTTAACAGTTAACAGTTGAGATAAGGAAGATCAAACTTTGGCA
AAGGCAAATATATCATTTTCGGCAACCCAA
Right flanking sequence : From position 2080300 (length bp)
CCTAGCTGCGAAATTGCGCATGGGAGTAAGGCCGAAAAACGGCTTTGCGGCTTATGCACCCATTGTATAC
AACCACACCGCAATTTTGCATAATAAACCC

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp