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CRISPRs details
NC_014222_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_014222_2                                                                                                                 
top
Strain :
Methanococcus voltae A3
RefSeq :
NC_014222 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_014222_2
DR consensus (37 bp) :
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
Number of repetitions :
28
Begin Position :
539822
End Position :
541857
539822
CTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
AATATCTTTTTTATGATATAGAAACTCTTGATATTGA
539895
539896
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
GGATATGACGTTTAAAAAGACGGACGGCACTATATCGTT
539971
539972
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
TACTACTAATTTCGGGAAATATACGCATATTGGAGA
540044
540045
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
TACAACTACCAGAAACACCAAATATCGAAACAAATTCGA
540120
540121
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
TTTATAGCTCCTGGAGCATCAGGGGGTTTAGATATTA
540194
540195
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
TATAAAACACAATGGGCAACGGATAATTGTTGAAGAAC
540269
540270
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
AGTTCAACACCTCATAATCGACATCAATTTGTTGATTAT
540345
540346
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
GGGGGGATTAGCACAGCACAGTTTGAATGTATTAGC
540418
540419
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
GAAAATAATGGTGGAAGATATTCACGTTATCTTAGA
540491
540492
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
TTCTAAACTATCGCAGTTTAGAAGCAAGGGCTGTCG
540564
540565
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
AAGATGCGTATATTCCCTTAAATATATGCATTGTAG
540637
540638
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
AGTGTAGTATACGATATTACAAAACAATTTAGTGA
540709
540710
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
TAAAAAGGTGGTAAAATGGACATAAGCGAATTAATGAAGT
540786
540787
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
TTGAAAACAGTTTCAGATTATGATTTCAGACAGTA
540858
540859
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
CTGAACGATTCAATTGATGAAGAATCTTCTCAAAAAT
540932
540933
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
AGATTATATGAAAAATCCCACGCCAAAAGAATCGATAAT
541008
541009
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
TTGAGCTATATCCTCAAACTAATAATGAGGTATATGC
541082
541083
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
AATGAAGTACAAACATTTACATTATTCTAAAAAAGGTGAT
541159
541160
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
AGACCAACCCCTTAGACGGGGAAAATCGCCAAAACCTC
541234
541235
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
TTTTCTAATATGAAGAAATCAAAATATGTATTCTT
541306
541307
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
TGGATATTCCAGATTGGATTACCAGACAAATAT
541376
541377
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
TGACCCCCAGTGGTTGGGGGAAAAACATTATAGCGAAT
541451
541452
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
ATAATGCAATATCTTTATTGATAGACACAAGTTTCGA
541525
541526
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
AATTGAATGAACTTTTCTAAGGGGGAGGTTAGTAA
541597
541598
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
AATGCAGTTCCATTTATTGCGTCAGTCAAAGGTTCTAA
541672
541673
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
CAATGTATACAATAATGGATGGGCAACCGGTGGAA
541744
541745
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
AAAGATATTGAAAGACGTGCAAACGTTAGAAATTCAAAT
541820
541821
GTTTCAATCCTTGTTTTAATGGATTATGCATTGTGAC
541857
Left flanking sequence : Till position 539822 (length
bp)
TATTCACTTCGTTCATAAAATCCTTTGATGGACATATTTTGTAATTAAAAATATCAAATCTTCGATTTGA
GTAAATGCCAATCGCCCAGAGGCAGTTGGG
Right flanking sequence : From position 541857 (length
bp)
ACGTAGTTAAATTATTACTCATCAATAAGTACAAAATAAGACTTATAGATTAAACAAAGCTCTATTTAAC
CGTATCACAAAATTTATTCAATCTGACAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp