Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_014392_7                                                                                                                 top


Strain : Caldicellulosiruptor obsidiansis OB47 RefSeq :NC_014392 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_014392_7
DR consensus (30 bp) : GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACNumber of repetitions :23
Begin Position : 2460383 End Position : 2461878

2460383GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACGATCGCCTTCACACACTGTAAACGAGATTATACCC 2460447
2460448GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACGGTCAACGATCAGTATTTTATTTCTATTCTTGACCC 2460513
2460514GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTCACAGACTACATAGGTAGCAAATATTATTCAAGC 2460578
2460579GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACGAATCATAATTAGCAAAATCATCAAGTTCATTATTAT 2460645
2460646GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACACATACTGGTTAGATCCTCCAGCAAGTCCTAACAT 2460710
2460711GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACATACTTAATTTTAAGCAAAATACTAACAAAATCATC 2460776
2460777GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACGCCTGCATATAAGAACCATGATGAACAACTGATACAAC 2460844
2460845GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTGTCATCAGGTTGTTTATATTCTACTTCTTTTACA 2460909
2460910GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACGGGTACAGGAGATTATTGGCATGTGCTAAGTTAGGAA 2460976
2460977GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTGTCAATAATCTCTTTAGCCCTGATTAATTTGGTAT 2461042
2461043GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCTATTATTTGATATATATCCAAAATCCTTTAAAGTA 2461108
2461109GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTCCTCAAAATTAAATCTTCTTGAATTATTCCTAGTA 2461174
2461175GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACACCTCTTTCTCTACTTTTTTTACCCTTAACATCTTATA 2461242
2461243GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTCCTCAAAATTAAATCTTCTTGAATTATTCCTAGTA 2461308
2461309GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTTGTATAAACCATAAAAACTTTTGTCTCGTTATAAT 2461374
2461375GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCCTCTAATCGTCGAAACTTCTCTTACTTCAAAATATC 2461441
2461442GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTCATTACCCGAAGATAAACCATCATTACCATCAACATA 2461509
2461510GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCCAACTGTTTTTACTCTTTCTCGCCCTTCATGATAG 2461575
2461576GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCTTATTTTTGTTGTGTCACCGTTAACTAAGTATCGT 2461641
2461642GTTTGTAGTCTCCCCTTTGGGGATTGAAACACTCATACTGGCATTCTTCGTAACGCTTTAAAATTTC 2461708
2461709GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCCTATGTTATATGAATCTGGACCTTCATCGATGACGGG 2461776
2461777GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAGGAGAGGGGAGAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAGGTGGGAGAGAGG 2461848
2461849ATTTGTAGCCTTTCCAGTGGGGATTGAGAT2461878
Left flanking sequence : Till position 2460383 (length bp)
GATTCTTCTGGGTTGATTTGAGTTTTTCACAAATGTTTTAATATAAAAACATTGACAGGGGTGTATAATC
TTGATATAATAAAATCAAGCTCTTGAACGT
Right flanking sequence : From position 2461878 (length bp)
ATGATCCTTCTCCGAAAAAAAGCTTGGAAAAGCCATTTTGTGGCTCCCAAGCCCTTTTAGAGTGTTGTCA
GAAGCTATTATTCCTTTGCAAATACATTAA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp