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CRISPRs details
NC_014393_3
Flanking alignement tool
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NC_014393_3                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium cellulovorans 743B
RefSeq :
NC_014393 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_014393_3
DR consensus (29 bp) :
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
Number of repetitions :
41
Begin Position :
2748102
End Position :
2750748
2748102
CTTTAAATAATACAGTATTTAATATTAAC
GCTATTTTCTGTGATAGTAACTAAACTTAATGCGTA
2748166
2748167
CTTTAAATAATACAGTATTCTATATTAAC
TAGCATGGTAAAGTTTTCAGTCCTCTTTTCTTCACT
2748231
2748232
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
TTTTTGTGCTCTATCTTCTGCCTGCGAATGAACTGC
2748296
2748297
CTTTAGATAATACAGTATTCAATATTAAC
ATATCGATATAACTTGACTACTGTTAAAAATCCAAT
2748361
2748362
CTTAAAATAATATAATATTTAATATTAAT
TATAACCTCTGTATAAGTATATACATCATATTCAT
2748425
2748426
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
ATATATGATCTGCTCCATACTCTCTAGTAGTAGCTG
2748490
2748491
TTTTAAATAATATGGTATTCAATATTAAC
TTCCAATCTTGGCGCATCTTCATACACACTAAAATT
2748555
2748556
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
CATATTTGCATTTGGCTTTGTTCTTGGGGCAGTCAC
2748620
2748621
ATTTAAATAATACAGTATCCAATGTTAGC
CTGTAGTAAAATGTACTACTGACATACTTACAACTAC
2748686
2748687
CTTTAAATAATATAGTATTAAATATTAAC
AGTTTCAAAATAAGGTTAATCACAGAAAAACACTGTG
2748752
2748753
CTTTAAATAATATATTATTCAATATTATC
GTATAATGTTTACATTGGGATGGAGAAATGATGATCA
2748818
2748819
CTTTAAATAATACAGTATTCAATACTAAC
ATTCATGCAATTAATGAAACCGAGGATATTGTCAT
2748882
2748883
CTTTAAATAATACAGTATTGAATATTAAC
GAGTTATACGATCAATCGATAAATGGATTGTCATT
2748946
2748947
CTTTAAATAATACAGTATTGAATATTAAC
TGAATTTATACGTCAACTTCGTCAACATCGTCATGA
2749011
2749012
CTTTAAATAATACAGTATTTAATATTAAC
GCATTAGGACACAGCGTAGAAATGACAATGAATGTCTA
2749078
2749079
CTTTAAATAATGCAGTATTCAATATTAAC
TAAGCCAATACGATGATTGTTGTGGTGATGCTCCTTA
2749144
2749145
CTTTAAATAATATAGTATTCAATATTAAC
CCGATTCACTAGGCGTAACTATAGATGACATTATAAA
2749210
2749211
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
CAACAAAGCTAATTAAATCTACTTCAAATTCTATATT
2749276
2749277
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
CTGCATGGGATGGTACAAGTGATATAACAGCTACTAC
2749342
2749343
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
AAATCAAAGAGCATAAAGACAATATTGTTTTCTTAGA
2749408
2749409
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
AGTGACAAAGGTAAAAAATATAATTTTATTTTTAAT
2749473
2749474
CTTTAAATAATACAGCATTCAATATTAAC
TTACATACTTCAGAATTTATCCTTCTAACTAAATCAC
2749539
2749540
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
TAAAAAGAAGGAGTAGGGAATGAAAGATTTTGCTTT
2749604
2749605
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
GTGATAAAGCAGCCACATGTTCCTATCTTTATCACT
2749669
2749670
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
GCCAATTTTAACAACTCTTCTGCCTTTTTCAGTTTT
2749734
2749735
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
TTGATAGAAAAGTTGATTTTCGTACTTTGGCTGTTAC
2749800
2749801
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
GTTTTCCGTAGATACAATAAACAGTTATTCGCTAGTTG
2749867
2749868
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
TCAGAATCGTCTTGATAATCATCTAAGACTATAAGGT
2749933
2749934
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
ATAGTATCGCGTCCGCTACTTCGATCTGATAATCAAA
2749999
2750000
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
CATCTAACTCATCTAAAGGTATATCCTTAACTTGTAG
2750065
2750066
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
ATATACCAAATGAAAACCGTGGGCATACAACTATCTT
2750131
2750132
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
AGACCTTTTATTAGTTCTAATAATATTATTATTTCAT
2750197
2750198
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
AGATCATAAGTGAAAGACCGTCCGCCATAGCGTTATT
2750263
2750264
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
AAGAGATTTGGCTAATAAGAAAGCTGTAGCAATTTT
2750328
2750329
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
AGATAACCTTGGTACTCACACGTTGCGTAAAACGTT
2750393
2750394
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
GATTAAAAGCTTTAACAACTGAACCATTGTTTAGTAT
2750459
2750460
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
ACTACCAGTGGGACGATGCCAGGAGGAATTGCTTC
2750523
2750524
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
CTGAACTTATGTATAGCTCTTTTGCTTTATCTCTATT
2750589
2750590
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
CCAGTAATAACTGCTGCAGTCCCTAGTCCAATTAA
2750653
2750654
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
ATGGTGTTTTTACACCTAATGCAACAATATGTTCTTT
2750719
2750720
CTTTAAATAATACAGTATTCAATATTAAC
2750748
Left flanking sequence : Till position 2748102 (length
bp)
ATACAACTCTTAATAAATACCAAATGAATACACTTCTTATATATGTATATTAAGAAATATTAACATATCG
ATATAACTTGACTAATGTTAAGAATCCAAT
Right flanking sequence : From position 2750748 (length
bp)
CCTAAAGCTCTTCAAAAATCACCTCATTGCTCTTGAATTCTATCACTTGACACTTCTATGACACTATGCT
TTATATGATAATTGCAGTGAACCTATTTCC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp