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CRISPRs details
NC_014410_5
Flanking alignement tool
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NC_014410_5                                                                                                                 
top
Strain :
Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571
RefSeq :
NC_014410 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_014410_5
DR consensus (30 bp) :
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
Number of repetitions :
41
Begin Position :
2723692
End Position :
2726373
2723692
GTTTCAATTCCAGTATGGTTAGATTAAATC
GTGCAGGTGTGTCTTATATAGGGATTCAAATGTTGCC
2723758
2723759
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
CTGGCTGGAGCATTTTGAACATGAGCCCCTCTCTC
2723823
2723824
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
TTACGTTATTGATCGTACTAGTTACACCATTTTTCA
2723889
2723890
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
AATGGAACTCCAGTAACAAGCGGATTTACACTTGAA
2723955
2723956
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
ACAAAATCAAGTAGGACTGCATCAGGATTGATGGTAA
2724022
2724023
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
CTTGTCAGGGTAGACGGTAATTTTTTTTATATATGT
2724088
2724089
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
CCATAACCTGACCATTAGAACCATCTTCTTTGTATGT
2724155
2724156
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
CGTGAGGGCACAAAAGAGCCAACATTAGCAAACTTG
2724221
2724222
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
TCCTGCTTCATTAACAATTGCTAATTGAGTAATGTT
2724287
2724288
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
AGAACGTTAAAAACTTGTTATCAATTAATGGCGGA
2724352
2724353
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
TATCTTTTTCTGTGAGTTTATCCTGCACTATTTTTTC
2724419
2724420
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
TAATACAAGATGCAGCGCAAACAACATGGCAAGCTG
2724485
2724486
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
CAGCAAAAGCAGCTTTCCATTTCAATGCCCTAAAAGG
2724552
2724553
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
TAATGAAACGATAGATAAAACTAATACTGCATAGAA
2724618
2724619
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
CTGTTGGTGATGCAGCTATATTGATTTCCAATTTTC
2724684
2724685
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
TCTTTTTTATTGTTTTGAAAAATGTAAAGATATATAT
2724751
2724752
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
TTTGTTTTTTGCTCCGTTTATACGACAATTTGAACC
2724817
2724818
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
CGTCCAGAATATGCCATTGCCTTTCGTTTTTTTGTATA
2724885
2724886
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
TCCGCCGACAAGCTGCGCAACCACAAGAACGTCATC
2724951
2724952
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
CTCGAATTTGACAAACCTAATAATATCTCTACTTCA
2725017
2725018
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
CTCATGGTATTTTCGTTTCAGCCTTTCCGCATATTC
2725083
2725084
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
TTAGAATTAGAACTCTAAAGTTTTTTAATTGTGAAA
2725149
2725150
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
AACAAGTATGCAACAGACGAATTCTTGTCTAAACTG
2725215
2725216
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
CATTGACTACATCGAAGTACCGCCGGAAATAGACTA
2725281
2725282
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
TAACAGCAATTAAAGACTTTGAAACATCATTTTC
2725345
2725346
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
TGGCTTTGTTGCTTTGGTACTAAATTCTTTTTGTAT
2725411
2725412
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
AATACATGCTTCTGCTGTAGTTCCACTTCCTATAAAC
2725478
2725479
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
TACAAGCCGGCTCTATGCCGGCTGCTTTTTTCCTGCT
2725545
2725546
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
CATTAATTTCAATCATCTCCTTTTTTGCTATGTAATG
2725612
2725613
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
GCTGTTGTTGGTGCTCATGATGACCGTGTCATGTCTT
2725679
2725680
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
GAACCTGTAGTAGAAGATAACACAAGTACAAAAGA
2725744
2725745
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
ACATGTCAGATATCCGAATTGGATACCTACTATTGAAA
2725812
2725813
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
CCAGCTATGGCTTGTTGACTTGCTACGTCCTCGACCA
2725879
2725880
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
CAGGTGATGGAGATCAAAAGACGATCTCGTATTCTT
2725945
2725946
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
TCAATAGATTCAGTGATAAATTTAGTAAGAGCAAA
2726010
2726011
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
CCTATTCTATGTCCGTCCAATACACCTAATTCAACGTA
2726078
2726079
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
GCACTTTAAGGAATGCACCTAACCTCCACAGTGCCTT
2726145
2726146
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
GGGCGTATCGGAAATATTTCAAAGTGTATAAAATA
2726210
2726211
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
CAATTACGATTATTGGATTGGCTTTAATGAAATTGA
2726276
2726277
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
GGAAATTTTATTTATTCTCTCCCCCATCCCGATTTTG
2726343
2726344
GTTTCAATTCCACTATGGTTAGATTAAATC
2726373
Left flanking sequence : Till position 2723692 (length
bp)
CCCAATAATATTGAATTATCAAGGTACAGAGCTACTTTTATAAGTGCGAAGTTTGAGTTATATCATATTT
TTGATTCATGTCTATTATTTTCCCACACGT
Right flanking sequence : From position 2726373 (length
bp)
CCCCACGAAAATCGCATGAAAATACTTACCTACTTAAATTCAATTTAACACAACATCAGTTATTTTTCAA
TACTTTTCAAGAAATCCAGTCCGTTTATTG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp