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CRISPRs details
NC_014533_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_014533_1                                                                                                                 
top
Strain :
Cyanothece sp. PCC 7822
RefSeq :
NC_014533 (plasmid Cy782201 )
CRISPR id :
NC_014533_1
DR consensus (36 bp) :
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
Number of repetitions :
30
Begin Position :
21043
End Position :
23249
21043
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
AAGGATTTGGTATCGATTTCTCATGTCCTCAATAGG
21114
21115
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
TCAATTATTTACTTACATTCACTTGTATCTATATTATGACTGAA
21194
21195
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
TATATTTTCAGCACCTGGCAATACCTTTAAGTTAGCAG
21268
21269
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
AAATCTACTCTAATTTCTGTGGGGATTGGAGTCACTAT
21342
21343
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
CGATCACCTCGCTGTTCGGGGACTCCGCCAAAGACCTC
21416
21417
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
AGGTTCGAGAAGCCCTTCTCCTCCATCCAGAGGGCGTA
21490
21491
GCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
AGGAACTCGGTCGCCCCCAGCTCGTCCCTGATCTCGAACCAC
21568
21569
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
CCGATGGCGGCATCGTGATGCGGGAGGTCGGCGGGTCGAA
21644
21645
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
GCTTAATTATAAGCTTTCGAGTCAGGTTAACTTGATATAGAC
21722
21723
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
GCAGTTTGAACTCCAGTCACCCCAACTACCTGGAATA
21795
21796
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
GTTGCGCACGGTGACCGGGACCAGCTCGGCGGCCCGTTGCCC
21873
21874
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
GAGTACCTCTGTTACTATGGCAATTCTTCCTTTTCT
21945
21946
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
AAGCATTTTTTCCCTCTACCACCTTAAGAACACCACTTGTGTA
22024
22025
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
TATGTCACCCATGCCAATTCACCCTATTATTACTTGTG
22098
22099
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
AGGTTCTCCTAGGAATTCATTCTTTTTAAAATTATTTA
22172
22173
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
CTTTCTGCCTTGCCAGAGTAAAAGTGTGTACTCTTTTTCT
22248
22249
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGAAATAGTTGGAAAC
TTTCTGTAATCCTTTCCCCGCCGCCTGTCCAACATC
22320
22321
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
CGCCGCCGACGTGAACGAACGCGCGATCTTCACGGAG
22393
22394
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
CGATCTTTACATTCGCGGTTGAATGACGGCAGAAAAACTCA
22470
22471
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
TGGAGGAAATAGACAGCGATGGAAGGCGGTATAAAATT
22544
22545
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
ATTGAATCGCTAGAACGCCCTTCCTGTCTCCATTCTC
22617
22618
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
GTCCTTAAACGACTTAAGGACTTTAGCCAGTTCTTAC
22690
22691
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
TTTCGTTTTACTTATTCATACGATATTTGCAACAATATCC
22766
22767
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
AATAATTAAAACATTTTGATGCTCGTTACAAAGAGCTAA
22841
22842
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
AACTCCTTCGCGCGCTTTGCCGTGCCGCCCGTCGCCGCGTT
22918
22919
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
GCATTCTTAACAAATGCTCTAATTTTCTGCAATCTGAT
22992
22993
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
AAGTAATCATCTGGCTTTTGATTATGGAATCTCCG
23063
23064
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
CGGGGTTTACAAAAAGGTTGGCATTTACCTTGATCCGCC
23138
23139
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
GGCGCGAGCGACCGAGGACATCGGCCAGCAGATCCGGGC
23213
23214
CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC
23249
Left flanking sequence : Till position 21043 (length
bp)
TTGTTGGTGGGGTGTTTTTGCTCGATCTGTGGTACAATTTAAGATGAGGTTCGCAAACCGCATCTAGACG
CTAGATGATATAAAGGTTCTGTGGGCAGCC
Right flanking sequence : From position 23249 (length
bp)
TATTTGTATTTTTGTATTACTGTTGTATTACCTAAATTGTATTACTTAAACGGAGGGGAAAAAAATGTTT
CACAACGTCCCATCGTCAAAACTTTAGCTA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp