Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_014533_1                                                                                                                 top


Strain : Cyanothece sp. PCC 7822 RefSeq :NC_014533 (plasmid Cy782201 )
CRISPR id : NC_014533_1
DR consensus (36 bp) : CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACNumber of repetitions :30
Begin Position : 21043 End Position : 23249

21043CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACAAGGATTTGGTATCGATTTCTCATGTCCTCAATAGG 21114
21115CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACTCAATTATTTACTTACATTCACTTGTATCTATATTATGACTGAA 21194
21195CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACTATATTTTCAGCACCTGGCAATACCTTTAAGTTAGCAG 21268
21269CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACAAATCTACTCTAATTTCTGTGGGGATTGGAGTCACTAT 21342
21343CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACCGATCACCTCGCTGTTCGGGGACTCCGCCAAAGACCTC 21416
21417CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACAGGTTCGAGAAGCCCTTCTCCTCCATCCAGAGGGCGTA 21490
21491GCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACAGGAACTCGGTCGCCCCCAGCTCGTCCCTGATCTCGAACCAC 21568
21569CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACCCGATGGCGGCATCGTGATGCGGGAGGTCGGCGGGTCGAA 21644
21645CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACGCTTAATTATAAGCTTTCGAGTCAGGTTAACTTGATATAGAC 21722
21723CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACGCAGTTTGAACTCCAGTCACCCCAACTACCTGGAATA 21795
21796CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACGTTGCGCACGGTGACCGGGACCAGCTCGGCGGCCCGTTGCCC 21873
21874CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACGAGTACCTCTGTTACTATGGCAATTCTTCCTTTTCT 21945
21946CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACAAGCATTTTTTCCCTCTACCACCTTAAGAACACCACTTGTGTA 22024
22025CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACTATGTCACCCATGCCAATTCACCCTATTATTACTTGTG 22098
22099CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACAGGTTCTCCTAGGAATTCATTCTTTTTAAAATTATTTA 22172
22173CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACCTTTCTGCCTTGCCAGAGTAAAAGTGTGTACTCTTTTTCT 22248
22249CCCTACCTATTGGGTTAAATAGAAATAGTTGGAAACTTTCTGTAATCCTTTCCCCGCCGCCTGTCCAACATC 22320
22321CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACCGCCGCCGACGTGAACGAACGCGCGATCTTCACGGAG 22393
22394CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACCGATCTTTACATTCGCGGTTGAATGACGGCAGAAAAACTCA 22470
22471CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACTGGAGGAAATAGACAGCGATGGAAGGCGGTATAAAATT 22544
22545CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACATTGAATCGCTAGAACGCCCTTCCTGTCTCCATTCTC 22617
22618CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACGTCCTTAAACGACTTAAGGACTTTAGCCAGTTCTTAC 22690
22691CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACTTTCGTTTTACTTATTCATACGATATTTGCAACAATATCC 22766
22767CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACAATAATTAAAACATTTTGATGCTCGTTACAAAGAGCTAA 22841
22842CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACAACTCCTTCGCGCGCTTTGCCGTGCCGCCCGTCGCCGCGTT 22918
22919CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACGCATTCTTAACAAATGCTCTAATTTTCTGCAATCTGAT 22992
22993CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACAAGTAATCATCTGGCTTTTGATTATGGAATCTCCG 23063
23064CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACCGGGGTTTACAAAAAGGTTGGCATTTACCTTGATCCGCC 23138
23139CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAACGGCGCGAGCGACCGAGGACATCGGCCAGCAGATCCGGGC 23213
23214CCCTACCTATTGGGTTAAATAGGAATAGTTGGAAAC23249
Left flanking sequence : Till position 21043 (length bp)
TTGTTGGTGGGGTGTTTTTGCTCGATCTGTGGTACAATTTAAGATGAGGTTCGCAAACCGCATCTAGACG
CTAGATGATATAAAGGTTCTGTGGGCAGCC
Right flanking sequence : From position 23249 (length bp)
TATTTGTATTTTTGTATTACTGTTGTATTACCTAAATTGTATTACTTAAACGGAGGGGAAAAAAATGTTT
CACAACGTCCCATCGTCAAAACTTTAGCTA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp