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CRISPRs details
NC_014652_3
Flanking alignement tool
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NC_014652_3                                                                                                                 
top
Strain :
Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108
RefSeq :
NC_014652 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_014652_3
DR consensus (30 bp) :
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
21
Begin Position :
2686105
End Position :
2687448
2686105
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
AAAAACTTTGTGGAAAACTAAGTATTTACAAAAGTG
2686170
2686171
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
CACATCGAAAATGCGGGTAATATTTTTATACTACC
2686235
2686236
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
AGAATCGAAGTCATGAAACTTGCAGCTTTGTTTCCTA
2686302
2686303
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
CACTTGCTACAGCACTTGTTATGTCACTGCCTGCATG
2686369
2686370
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATGCATATCCCTCTCCGAGCACCCAATTATTA
2686431
2686432
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
ACGTTGCAAAGCGGTATAGGGGACATGGGCTTGAAT
2686497
2686498
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
AAATTATAAATGCTATGGGCCAAATTAAGGTAAG
2686561
2686562
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATGTTAACTCAATGTATCCTTTTGTTATGAGAAATA
2686627
2686628
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
TCATTACCATCTCTTAAAGTAAAAAGCAAACTTA
2686691
2686692
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
TCATTACCATCTCTTAAAGTAAAAAGCAAACTTA
2686755
2686756
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
TATAATCTTAGTTTTATCTTCTAATGTTTGTGCTTG
2686821
2686822
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
TAATATCTGATTTGGAGACTATTACCTTCTCTTTGG
2686887
2686888
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
TTACACCATTATCGTTAATTACTAACTCATAAGTTT
2686953
2686954
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
CTATTTTACTCGGTATTAATTTTCACCATTTTACTC
2687019
2687020
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
TCTAGACGAAAATATTGAAGCTATTGTAGAATATGA
2687085
2687086
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
TTACGCAATGAGAGTTCAAACCATCAAGACTATGACT
2687152
2687153
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAT
ACCCTTCGTCAAAATTATTGATTTTTTTCAATTCA
2687217
2687218
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
GGGTAGGGGCCCCAAACGAGCCCTTTGGGCGAGCTTG
2687284
2687285
GCTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATCAATATGTTTAGTTGTCGTTAGAAAAGGCGGTG
2687349
2687350
GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC
TTGATATCAACAAGTGCTTGAATTCTGTGGAAACCATTG
2687418
2687419
GTTTGTAGCCTACCCTTTGAAGATTAAAAA
2687448
Left flanking sequence : Till position 2686105 (length
bp)
TGTTGACTTTCAAGAGCTTGTGGAGTATAATAGAAATAACATACAGCAGCTTGAAAACTTAACCATTTGT
TCCTTGTAAGATTTCTCAAGCCATCTACGG
Right flanking sequence : From position 2687448 (length
bp)
AATGAAACTGTGAGACCGCTTTTGTGGTATAATTAAATTGGACAAAAAATAAAACAAACTCAGCATCTTT
GGCTGCAGAGTGTAGAATTTTATTCTGAAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp