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CRISPRs details
NC_014654_3
Flanking alignement tool
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NC_014654_3                                                                                                                 
top
Strain :
Halanaerobium sp. 'sapolanicus'
RefSeq :
NC_014654 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_014654_3
DR consensus (37 bp) :
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
Number of repetitions :
49
Begin Position :
1666592
End Position :
1670122
1666592
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
TTTCAATCTGTAAAGTATAATGTAACTAGGACTTAA
1666664
1666665
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
CCTGGCCCGGCTCTACTATTTGCTCTAGTTTACGAAA
1666738
1666739
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
CTAAAGATTTTAGCAGCTATGCAAATACAGATTACA
1666811
1666812
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
CCAAAATATCTTTTTGCGTTCTCGGCGTTTTTTTC
1666883
1666884
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
CCTTGAGAGTTTTCGAATTGACTTATCTGGTCTTTAA
1666957
1666958
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
TCATCATCTTGATCCTGATCGTCCATCTCATCCAGAT
1667031
1667032
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
GAATAACGATGAAGAGCAGACTGATCTCGATCCGAT
1667104
1667105
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
AAGTTCTCCATTTACATCTGGGAAATATCCATTTT
1667176
1667177
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
TTTTTGTAGGATTTTATAATGCAATTGGGAAATTTCG
1667250
1667251
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
CTATAACTTCTCGCTGGATAGTTCTACCTAATTCCT
1667323
1667324
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
TGTTTTATAACACTTGTCAAAATATTTAAGTTATTT
1667396
1667397
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
ATGATGGACAATTAAAAAAAACTTTTGAATCCTT
1667467
1667468
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
CCATTCGTAGTTGTTTTCTATGATAGGAGTATCACAC
1667541
1667542
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
TTATCCATAGACACATAGCCCTCATATGCACCAA
1667612
1667613
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
AGGGTTTATATCGTGGCGAGAGCTACTCAGATATGTC
1667686
1667687
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
TAATATACAGACACCTTTTGCTATGTTAACAAAATA
1667759
1667760
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
AAGCTAGATGTAGGCAGGGTTTTATACTTTAATGCAT
1667833
1667834
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
AATTAAGCAGTAAAGCATGGAATTCACTTTATATGTG
1667907
1667908
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
ATTGCCATCTGTTATTCCTCCTATATATTCAATATTT
1667981
1667982
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
TTAGTTGAAAATTCTTATGCAGCTTCACCTATAT
1668052
1668053
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
AAGATGTTTTAATTGAGAAAGGACAAATGCTAGAAA
1668125
1668126
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
CTACTTGACCTTTTTTCATAACTTAACCACCTCCT
1668197
1668198
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
TAACAAACATAAGAGGGATAAGGATAATTATGCTCC
1668270
1668271
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
AAGATAGCTGAAAGCCGAAAGCGTCTACGAGAACA
1668342
1668343
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
TCGCAACAAAGTCAGCCCAAACCACCAACAACCAA
1668414
1668415
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
TACTAACCACTCATCGCCGCCATTAACCTGATTGA
1668486
1668487
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
TCATCAAGTGGTTTGGCTTGTTGTGTAGCAGCGAA
1668558
1668559
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
TTTCTTTCATCTGGCATCATTTAATCTCCCTTCAT
1668630
1668631
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
AAGCCATGTGCTTATCCAGGATGCCCTAAATTAAT
1668702
1668703
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
CTAAGATTGGATATTGATGACGAAGAAATGCTAAT
1668774
1668775
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
TACCTCCCAGTCTTCTGGAAGGCTCATTATATAAGC
1668847
1668848
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
CAATGCAACAACTTCTCATCCATCTTATGTTGTGC
1668919
1668920
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
ATATTCCAAGAAATTAAGAGGATAACAGGAAAGGGG
1668992
1668993
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
TACTTTACCTACTTTGTTGTACTTTTTAAGCTCCTG
1669065
1669066
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
AGTGAGCCTCTCCGTCTTCCCCGACCTTGATAGCTT
1669138
1669139
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
AATGGTAGCTGCTTTTATTGATGATAACAAGCCTGA
1669211
1669212
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
CCTATCAGGTTCGCCTTGTTGATACCCTGGTTGCCA
1669284
1669285
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
TCAGTTTCCCAAACTAACCTCGTTACTCCTCCAGCCA
1669358
1669359
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
AATTAATTATGAAAAAGAATGGTGTTATTTATTTAA
1669431
1669432
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
TGATTCAGCATCGCCACGAAGCAATCCTTCAACAA
1669503
1669504
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
TAAGGTGGTGAAGGATTGATGAGATTTAAGTCTTTAA
1669577
1669578
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
TTTAATAATTCATTTTCAATTTTTCTTTTTAACTT
1669649
1669650
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
AGAGTGCTAATAACGGAGGAACTGTTGAGCTTACAT
1669722
1669723
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
CAAGCTCGTCCCTATTATCATCAAAACCACCTCTGA
1669795
1669796
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
TAATAGGGAGTCTTGTGTAGTCAAATACTTTTGAAA
1669868
1669869
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
AGCGAGCCGGCTAACTCATCTATTACTACAGGCAA
1669940
1669941
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
CAGATATGATGGCCTGGGCTATACTACACAGGATAT
1670013
1670014
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
CACGATTATAACTGCAGAGATCGCAATGGCAATCT
1670085
1670086
GTTTCAATCCTTATTTTAATGGATTAGTCATTGGAGC
1670122
Left flanking sequence : Till position 1666592 (length
bp)
TTGGGGGTTTTTGTTGTTTTATATTCTGTATAAATTGCAGCTTGCTGCATTAAATTGCAAAATCATACTT
TCACTGAATGAATAGTTTGATTTTCACGTG
Right flanking sequence : From position 1670122 (length
bp)
CCGTTACGACTTTAATTTATTGTTATGATAGGCATTAGAGCAATTACTTTAGAATTTTTAAAGCATATTT
TTTCTGAAAAATATTAATAAAATGATTAAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp