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CRISPRs details
NC_014721_10
Flanking alignement tool
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NC_014721_10                                                                                                                 
top
Strain :
Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B
RefSeq :
NC_014721 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_014721_10
DR consensus (30 bp) :
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
32
Begin Position :
2720576
End Position :
2722684
2720576
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGTTTAATTCTTT
CTATAATGCATTTGATATCAATTATT
2720631
2720632
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
TGTACCACTTTGTAAAAGTCGTCTACAGTCTTGCAA
2720697
2720698
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
ACTCAGAATAATCCCGTCGAAATTATGCGGGATTAC
2720763
2720764
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
GCTTATGTTATTCCCAATACCGAAATAATTTACACTTA
2720831
2720832
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
TTTACCTTTTGCTTCAAGATTTCTTTGTCTATGTCTTCT
2720900
2720901
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
TTTTTTATAACCTCCTTTTTGTTTTACAATTATAATT
2720967
2720968
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
AGTGTTTCATCACTCATCTGTTGAACATCTTTTAGC
2721033
2721034
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATCCCCTTTCACCGTTGAATCCTTAGCCCGCCACTCCC
2721101
2721102
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
TCTGCACTCCTTTCTTGATATCTTCAAACGGGTAAAATT
2721170
2721171
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
TTTCATCGAGGAGTATGACGCTGTATGCAAAAACTGCTA
2721239
2721240
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
GTCCTCAGCGGTGGAACAAGTCCGCAGTACACAACGAG
2721307
2721308
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATCTGTAGAGGCTGTAGACACATTGGAGTACTTGA
2721372
2721373
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATCATTCTATCTTGCTGAGCTACAAGGATTATATCATAA
2721441
2721442
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATCAATTCGTTAAATGTACTATTCAATCTTTCATACTG
2721509
2721510
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
GGTAGTACAATAAACCTATACGACTCTGTCAATGCAA
2721576
2721577
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TGTATCTTTTTTAGCAGTTACCTGTTGCCCAGTCTTTA
2721644
2721645
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TTTGCATCATCGTTTTATACTGTTGTGGAGACAGAAAA
2721712
2721713
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TGCTTTATATCAACTGGCTGGCACACCTGTTGGTCTTG
2721780
2721781
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAT
ATCTCTACAAGGTAGTATTCGATTACTGCCCCCTCAG
2721847
2721848
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TTTTCCCATTTCTTCTTTGCAGCTTCAAGCCTTAAGGCTA
2721917
2721918
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TCTTGTAGTTTAGCTAATTCTTCTTCATTTGTGCTGG
2721984
2721985
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
CTTTGTAAAAGATATTATCATGATGCTTTTTATAAAA
2722051
2722052
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TGTTTCATAGCACCTACAATTAATATGTTCCCTGTT
2722117
2722118
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TTTTCTGCTCCTAAGTCGTCTAAAACAAGCAATGATG
2722184
2722185
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATTTCTACACCTCTCTTTTTGCAATATTCAATAAAACC
2722252
2722253
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TGGTCTTTGTCGAACAGAAGCCATGTAAACGCGTCAA
2722319
2722320
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATTGTTGATTCTGGACCAAAGCTTATCTCTCTTACAA
2722386
2722387
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TTTTAAAAGCTTCTCAAGTTCTTTTTGCAGTTCGCT
2722452
2722453
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
CCCTTATTTTAATTCTGTATATCATTTTTATTTTTCC
2722519
2722520
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
CAATTTGTTGAATGATAACAGCATTGCTACCTATTAC
2722586
2722587
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC
GTTGGAGTGCAGAAGAGGCAATTGCTTTTTTAAAGTGG
2722654
2722655
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAGAA
2722684
Left flanking sequence : Till position 2720576 (length
bp)
TGATGCAACTGGGTTTGTTTGATTTTGAGGGGATGTATCAAAATAAAAACATTGACAGGGGTGCATAAAG
TTGATATAATAAAATCAAGCTTTTCAACCT
Right flanking sequence : From position 2722684 (length
bp)
AAGAAGAGAGTTTTTACCCTTTCCTTTGGGAATTGTGAAGAAAGGAATTGCAAATCCTAAACTTCGCAAA
AAATTTGACTTCAGCTTTTCTCTTTTTTGT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp