Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_014734_2                                                                                                                 top


Strain : Paludibacter propionicigenes WB4 RefSeq :NC_014734 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_014734_2
DR consensus (36 bp) : GTTGTAGTTCCCTTCAATATTGGGATAATCCACAAG Number of repetitions :27
Begin Position : 223908 End Position : 225657

223908GTAGTGTTACCCTTCAATTTTGGGATAATCCACAAGAGAAAAACATGTGGGTATGTGCATGTCCTT 223973
223974GTTTTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCACAAGTATTACTGCTGCAATGCAGATTGGCGTAT 224038
224039GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCACAAGTATTACTGCTGCAATGCAGATTGGCGTAT 224103
224104GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCACAAGGAAAACGAAAATTATAACTTCAATAAATTC 224169
224170GTTGTAGTTCCCTTTAATTTTGGGATAATCCACAAGAGTAAAACCGTACAATGGAGAAGATAACGT 224235
224236GATGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAGTCCACAAGAGCGGTGCGGATTTGAGCGATGCGAATTTG 224301
224302GTTGTAGTTCCCTTCAATATTGGGATAATCCACAAGGAATTAGGATTATGAGTTTATATAGTTTGA 224367
224368GTTGTAGTTCCCTTCAATATTGGGATAATTCACAAGTAAACATTAAAACAATAAACGGAAGTTCGA 224433
224434GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCATAAGAAAGCAAAAATGAACACAAAACAATTTGAA 224499
224500GTTTTAGTTCCCTTCGATTTTGGGATAATCCACAAGTACAGCAGTAAGCGGAAACACTCAGGCAAT 224565
224566GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCACAAGGCCGTAAAAAATCCACACAACGATAAGATG 224631
224632GTTTTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCATAAGCTCTTACTGGCTGGTGCCGGGCTTGCTGCA 224697
224698GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATTATCCACAAGAGAAAGAGTGATGAACGACGAGCAGGATAT 224763
224764GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATTATCCACAAGTTACACCTGATCAATGGAAATTGCTTAGTG 224829
224830GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCACAAGTGTGATTAATGATATTACCGTAGCTAACGG 224895
224896GTTGTAGTTCCCTTCATTATTGGGATAGTCCACAAGAAAACAACCTGCATGGATAAATTATATGAC 224961
224962GTTCTAGCTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCACAAGTAAAAACATATTTGCTGAAGACTATGGAAG 225027
225028GTTGTAGTTCCCTTCAATATTGGGATAATCCACAAGTGCTATTCGGAATAGATTTTTACCCCACCA 225093
225094GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATTCACAAGTGGGATTATGAAATAACCGATTATAAACTA 225159
225160GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATTCACAAGAGAAATCAAAAATTGATTCTTCAGTAGCTT 225225
225226GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATTCACAAGCGAATCCTAATGGTTATATTACTGCTTCAT 225291
225292GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATTCACAAGTAAATTGAAAATTTCTGGACAAGCTCCAGT 225357
225358GTTGTAGTTCCCTTCAATATTGGGATAATCCACAAGAAACGAATCACAGAACATGTGAACCTGGTA 225423
225424GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCACAAGAGATGATAACGTAGGCAACATCCCTGATAA 225489
225490GTTTTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCACAAGCGTTATTCAGGAGAGAGTTTCAAAGAGTAT 225555
225556GTTTTAGTTCCCTTCAATATTGGGATAATCCACAAGTAAAACATTGGCTAATAACAGAACTAGGGC 225621
225622GTTTTAGTTCCCTTCAATATTGGGATAATCCACAAG225657
Left flanking sequence : Till position 223908 (length bp)
AGTGATTTGCTGTAGGACTGCAATTAGCTAAGCTAACCTTTATAAAAACAACCCCGAATGATGAATTTCA
TTCGGGGTTGTTTGTGCTTTGATGTCAGCT
Right flanking sequence : From position 225657 (length bp)
ATAGTATCTGTATTTATCAGTAACCTAACTACTTTTACGCTTAAAAGCTATGCAAAGCTACGATAATACA
GCGTATATACAATCCCATCTGCTATTTTTT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp