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CRISPRs details
NC_014734_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_014734_2                                                                                                                 
top
Strain :
Paludibacter propionicigenes WB4
RefSeq :
NC_014734 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_014734_2
DR consensus (36 bp) :
GTTGTAGTTCCCTTCAATATTGGGATAATCCACAAG
Number of repetitions :
27
Begin Position :
223908
End Position :
225657
223908
GTAGTGTTACCCTTCAATTTTGGGATAATCCACAAG
AGAAAAACATGTGGGTATGTGCATGTCCTT
223973
223974
GTTTTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCACAAG
TATTACTGCTGCAATGCAGATTGGCGTAT
224038
224039
GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCACAAG
TATTACTGCTGCAATGCAGATTGGCGTAT
224103
224104
GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCACAAG
GAAAACGAAAATTATAACTTCAATAAATTC
224169
224170
GTTGTAGTTCCCTTTAATTTTGGGATAATCCACAAG
AGTAAAACCGTACAATGGAGAAGATAACGT
224235
224236
GATGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAGTCCACAAG
AGCGGTGCGGATTTGAGCGATGCGAATTTG
224301
224302
GTTGTAGTTCCCTTCAATATTGGGATAATCCACAAG
GAATTAGGATTATGAGTTTATATAGTTTGA
224367
224368
GTTGTAGTTCCCTTCAATATTGGGATAATTCACAAG
TAAACATTAAAACAATAAACGGAAGTTCGA
224433
224434
GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCATAAG
AAAGCAAAAATGAACACAAAACAATTTGAA
224499
224500
GTTTTAGTTCCCTTCGATTTTGGGATAATCCACAAG
TACAGCAGTAAGCGGAAACACTCAGGCAAT
224565
224566
GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCACAAG
GCCGTAAAAAATCCACACAACGATAAGATG
224631
224632
GTTTTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCATAAG
CTCTTACTGGCTGGTGCCGGGCTTGCTGCA
224697
224698
GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATTATCCACAAG
AGAAAGAGTGATGAACGACGAGCAGGATAT
224763
224764
GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATTATCCACAAG
TTACACCTGATCAATGGAAATTGCTTAGTG
224829
224830
GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCACAAG
TGTGATTAATGATATTACCGTAGCTAACGG
224895
224896
GTTGTAGTTCCCTTCATTATTGGGATAGTCCACAAG
AAAACAACCTGCATGGATAAATTATATGAC
224961
224962
GTTCTAGCTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCACAAG
TAAAAACATATTTGCTGAAGACTATGGAAG
225027
225028
GTTGTAGTTCCCTTCAATATTGGGATAATCCACAAG
TGCTATTCGGAATAGATTTTTACCCCACCA
225093
225094
GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATTCACAAG
TGGGATTATGAAATAACCGATTATAAACTA
225159
225160
GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATTCACAAG
AGAAATCAAAAATTGATTCTTCAGTAGCTT
225225
225226
GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATTCACAAG
CGAATCCTAATGGTTATATTACTGCTTCAT
225291
225292
GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATTCACAAG
TAAATTGAAAATTTCTGGACAAGCTCCAGT
225357
225358
GTTGTAGTTCCCTTCAATATTGGGATAATCCACAAG
AAACGAATCACAGAACATGTGAACCTGGTA
225423
225424
GTTGTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCACAAG
AGATGATAACGTAGGCAACATCCCTGATAA
225489
225490
GTTTTAGTTCCCTTCAATTTTGGGATAATCCACAAG
CGTTATTCAGGAGAGAGTTTCAAAGAGTAT
225555
225556
GTTTTAGTTCCCTTCAATATTGGGATAATCCACAAG
TAAAACATTGGCTAATAACAGAACTAGGGC
225621
225622
GTTTTAGTTCCCTTCAATATTGGGATAATCCACAAG
225657
Left flanking sequence : Till position 223908 (length
bp)
AGTGATTTGCTGTAGGACTGCAATTAGCTAAGCTAACCTTTATAAAAACAACCCCGAATGATGAATTTCA
TTCGGGGTTGTTTGTGCTTTGATGTCAGCT
Right flanking sequence : From position 225657 (length
bp)
ATAGTATCTGTATTTATCAGTAACCTAACTACTTTTACGCTTAAAAGCTATGCAAAGCTACGATAATACA
GCGTATATACAATCCCATCTGCTATTTTTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp