CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_014935_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_014935_2                                                                                                                 
top
Strain :
Nitratifractor salsuginis DSM 16511
RefSeq :
NC_014935 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_014935_2
DR consensus (31 bp) :
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
Number of repetitions :
60
Begin Position :
1062730
End Position :
1066682
1062730
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
TGTCGCCCCGCTTGAGATTGACAAAAGTCTCTGGA
1062795
1062796
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
CGCCGCCCCACGTCGCTAGGGCGATAACCCAGGCA
1062861
1062862
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
CAGTCTTGGGGTGGTAGAGGTCGCAACTATCCCA
1062926
1062927
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
CTTCGTGAGGGAATCCGCTCTGCTCGTGTGCTATGA
1062993
1062994
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
GCTCTCTTTGAAACGGTCTCCACAAATTCCTTCG
1063058
1063059
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
GTCTCATGCTGCCACCTTTTTCTTTTTCTGGATCATC
1063126
1063127
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
CACAGAAGAGAAGCTGAAGAGGATCAACCCGCTC
1063191
1063192
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
TTGAAGCGGTCCGCCTCGATGAGTTGGAGAGTAAAC
1063258
1063259
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
CCGTCAGCGGTTTTGGAGATCTTCCCGTCAGATGTCA
1063326
1063327
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
ACGTCGGCCATTGCGCTCTCGAAATCCATCGCTG
1063391
1063392
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
TCAAGATATGTGGTTTTCAAAACGAAAGCATCCGGAT
1063459
1063460
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
GGTTTTTTCAAATGCTCATGTCCGATAGCTCCAGCC
1063526
1063527
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
CAGTCTTTTTTGATAGCTCAGAATCTTCTGCTATT
1063592
1063593
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
TCGGGTACCCACAGATCAAGCACGCCCTGGTCA
1063656
1063657
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
CCTGATGGAAAAGGAGGCGATCGCTTCCAGCCGGG
1063722
1063723
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
CGGACCCACGAGCAGGAGATCGCGACGATGGGCGCG
1063789
1063790
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
ATTTGGGCCTTCTTCCCCTCGTCGATACCCCCAAT
1063855
1063856
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
TCCGTCACCCTTGGCGACGTTCCCGGCACACTTTG
1063921
1063922
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
GATGATGCAGCGCAGGACTTTGCCCACGATCTGAA
1063987
1063988
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
GCCTCGCCAATGTCGCTGGACTCGATATCAACAATG
1064054
1064055
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
TTTTGAAGAGCCAAAAGAAGGGGAATATATCGTGA
1064120
1064121
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
CCCAGATCGAGCTTGCAAAAAAGATGGGTGTCAG
1064185
1064186
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
TCAAAGTGAAGGTGTGCCTGTGAGCTTGATCGAA
1064250
1064251
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
CGCTAAAAGCTTTTCGATGAGCTCCTCATGCTGCTT
1064317
1064318
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
CAAAAGAGGCCAGCTCTCCCAGACGTTTGCCCACG
1064383
1064384
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
GGTTGATAGTACGCCCATGCACGGCAAATTCATACC
1064450
1064451
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
CCGGTCATTTTCCAGAATATTCAAAATCCCAATGAA
1064517
1064518
ATCTTGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
TGTGCTGCGTGCACTGTTTGAGGGGAATGCGGTGGA
1064584
1064585
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
GCCCACACTCTGATCTCTCTGCCATCCTCCTGCCTG
1064651
1064652
ATCATGAAGCAGTCCCTATGAGATTTGAAAT
ATCCAGATGAAAGGGGCGTTGTATAGCTCCAGGC
1064716
1064717
ATCACGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
ATGACAAACAGATAGATCCCATACCTGCGGGCCAGC
1064783
1064784
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
CCACTCCCTGGTAAAGCTCCTTTACCACCCTGGTT
1064849
1064850
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
GCATTACTTACGTCACTATTCAAGGAAGCAGTATG
1064915
1064916
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
CCGAAGCGATGGCAGAAGCGCGCCTTCTACGAAGGGG
1064983
1064984
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
CTCAAAGGATGAGTCAAAGGTATACGATGAACAGC
1065049
1065050
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
CCTCAATTTCTCTTACAATTTCATCGTAAGGGCGA
1065115
1065116
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
ACGCCGCTTGCCGTTCTTTTTCGATCTGCTCCGGAA
1065182
1065183
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
TTTTATTGTGCCAAAAGAAAGGCTCTACTGCTGAA
1065248
1065249
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
TGGGAATGTTTTCGTGGACGTCTCCTCCTCGCGGGT
1065315
1065316
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
TAGCGCATTTCGGCACTACGCGAGTCGATGAGAT
1065380
1065381
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
TCAATTATTTTGTTGACAAGTCCTATTGTAATTTC
1065446
1065447
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
CCGTGTCTATGCCCTTGGGGAGTGGGGCACACTCAA
1065513
1065514
ATCATAAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
TCTTGACATTCTACAAAAGTAGACGAAGATGTTGT
1065579
1065580
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
TCCGTTGATAGCTTCATCTCACCTTTGGCCGGTGGC
1065646
1065647
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
TATCGTTGTCGTCTTCATCATATACAGCATATGAGA
1065713
1065714
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
ACACTCCTTTTCTCCCAGGTTGACCTACTAGCCAAG
1065780
1065781
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
AAGTCGTAGGTATGCCACACCGTATCCCCGACTTTGG
1065848
1065849
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
AATTCCCCTACGGCATCTTCTGAATACCAAGATAT
1065914
1065915
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
GCTTTCCAAACTCTTGGAAGTTTCGCATTTCCAAAGCC
1065983
1065984
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
ATGGTTCCTGCCGCTGGAACATTATTGGACGCTGCAA
1066051
1066052
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
ATTGCATCGAGTGTCTCGATCTCCTTTGGAACATCGA
1066119
1066120
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
TTTGGTGCTCTATGGCGGGGCAGGTTCCGGCAAGA
1066185
1066186
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
ATGTCTATAATAGCCTGGGCGTATTCGCTGATCCCCC
1066253
1066254
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
TTGACGGTGCTTTCATTGTATTATGAAAAAGTCGA
1066319
1066320
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGAATTTGAAAT
TATCCAAATCCGAGAGGCGATATCAAGCCTGAT
1066383
1066384
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
ATTTCTACCTGTTCTATCTGTTTGCATGTGAACAAAT
1066451
1066452
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
GAATAGGCGCGGACCTTGCATTTGCAGTTGTAGCC
1066517
1066518
ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
CTTGCCCCCACACAATCAGGGCAGAGGACAAGACTG
1066584
1066585
ATTATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAT
ATATCGAGCCAGTAATTTTCAGGTTCGATAATGGGG
1066651
1066652
ATTATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAC
1066682
Left flanking sequence : Till position 1062730 (length
bp)
GCGTTTGTGCAAGTGAAAGAGAGGGTGTTAAGCTGTTTGAGAGGCGTAAAAAAAAGAGCATATTTTGCTA
AAAACACCTAAAATTGGGGATTTTTTTGCT
Right flanking sequence : From position 1066682 (length
bp)
GCCCGTGGCCTGCCCCAAGACGAGTGAGGATTGAAACATATGTGCGATGGCAAAGTGTCTGGCGGGGCTG
AGTCACACCCGTTCCGGATTGAGGCACAAC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp