Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_014935_2                                                                                                                 top


Strain : Nitratifractor salsuginis DSM 16511 RefSeq :NC_014935 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_014935_2
DR consensus (31 bp) : ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATNumber of repetitions :60
Begin Position : 1062730 End Position : 1066682

1062730ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATTGTCGCCCCGCTTGAGATTGACAAAAGTCTCTGGA 1062795
1062796ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATCGCCGCCCCACGTCGCTAGGGCGATAACCCAGGCA 1062861
1062862ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATCAGTCTTGGGGTGGTAGAGGTCGCAACTATCCCA 1062926
1062927ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATCTTCGTGAGGGAATCCGCTCTGCTCGTGTGCTATGA 1062993
1062994ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATGCTCTCTTTGAAACGGTCTCCACAAATTCCTTCG 1063058
1063059ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATGTCTCATGCTGCCACCTTTTTCTTTTTCTGGATCATC 1063126
1063127ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATCACAGAAGAGAAGCTGAAGAGGATCAACCCGCTC 1063191
1063192ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATTTGAAGCGGTCCGCCTCGATGAGTTGGAGAGTAAAC 1063258
1063259ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATCCGTCAGCGGTTTTGGAGATCTTCCCGTCAGATGTCA 1063326
1063327ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATACGTCGGCCATTGCGCTCTCGAAATCCATCGCTG 1063391
1063392ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATTCAAGATATGTGGTTTTCAAAACGAAAGCATCCGGAT 1063459
1063460ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATGGTTTTTTCAAATGCTCATGTCCGATAGCTCCAGCC 1063526
1063527ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATCAGTCTTTTTTGATAGCTCAGAATCTTCTGCTATT 1063592
1063593ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATTCGGGTACCCACAGATCAAGCACGCCCTGGTCA 1063656
1063657ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATCCTGATGGAAAAGGAGGCGATCGCTTCCAGCCGGG 1063722
1063723ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATCGGACCCACGAGCAGGAGATCGCGACGATGGGCGCG 1063789
1063790ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATATTTGGGCCTTCTTCCCCTCGTCGATACCCCCAAT 1063855
1063856ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATTCCGTCACCCTTGGCGACGTTCCCGGCACACTTTG 1063921
1063922ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATGATGATGCAGCGCAGGACTTTGCCCACGATCTGAA 1063987
1063988ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATGCCTCGCCAATGTCGCTGGACTCGATATCAACAATG 1064054
1064055ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATTTTTGAAGAGCCAAAAGAAGGGGAATATATCGTGA 1064120
1064121ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATCCCAGATCGAGCTTGCAAAAAAGATGGGTGTCAG 1064185
1064186ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATTCAAAGTGAAGGTGTGCCTGTGAGCTTGATCGAA 1064250
1064251ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATCGCTAAAAGCTTTTCGATGAGCTCCTCATGCTGCTT 1064317
1064318ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATCAAAAGAGGCCAGCTCTCCCAGACGTTTGCCCACG 1064383
1064384ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATGGTTGATAGTACGCCCATGCACGGCAAATTCATACC 1064450
1064451ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATCCGGTCATTTTCCAGAATATTCAAAATCCCAATGAA 1064517
1064518ATCTTGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATTGTGCTGCGTGCACTGTTTGAGGGGAATGCGGTGGA 1064584
1064585ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATGCCCACACTCTGATCTCTCTGCCATCCTCCTGCCTG 1064651
1064652ATCATGAAGCAGTCCCTATGAGATTTGAAATATCCAGATGAAAGGGGCGTTGTATAGCTCCAGGC 1064716
1064717ATCACGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATATGACAAACAGATAGATCCCATACCTGCGGGCCAGC 1064783
1064784ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATCCACTCCCTGGTAAAGCTCCTTTACCACCCTGGTT 1064849
1064850ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATGCATTACTTACGTCACTATTCAAGGAAGCAGTATG 1064915
1064916ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATCCGAAGCGATGGCAGAAGCGCGCCTTCTACGAAGGGG 1064983
1064984ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATCTCAAAGGATGAGTCAAAGGTATACGATGAACAGC 1065049
1065050ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATCCTCAATTTCTCTTACAATTTCATCGTAAGGGCGA 1065115
1065116ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATACGCCGCTTGCCGTTCTTTTTCGATCTGCTCCGGAA 1065182
1065183ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATTTTTATTGTGCCAAAAGAAAGGCTCTACTGCTGAA 1065248
1065249ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATTGGGAATGTTTTCGTGGACGTCTCCTCCTCGCGGGT 1065315
1065316ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATTAGCGCATTTCGGCACTACGCGAGTCGATGAGAT 1065380
1065381ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATTCAATTATTTTGTTGACAAGTCCTATTGTAATTTC 1065446
1065447ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATCCGTGTCTATGCCCTTGGGGAGTGGGGCACACTCAA 1065513
1065514ATCATAAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATTCTTGACATTCTACAAAAGTAGACGAAGATGTTGT 1065579
1065580ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATTCCGTTGATAGCTTCATCTCACCTTTGGCCGGTGGC 1065646
1065647ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATTATCGTTGTCGTCTTCATCATATACAGCATATGAGA 1065713
1065714ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATACACTCCTTTTCTCCCAGGTTGACCTACTAGCCAAG 1065780
1065781ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATAAGTCGTAGGTATGCCACACCGTATCCCCGACTTTGG 1065848
1065849ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATAATTCCCCTACGGCATCTTCTGAATACCAAGATAT 1065914
1065915ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATGCTTTCCAAACTCTTGGAAGTTTCGCATTTCCAAAGCC 1065983
1065984ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATATGGTTCCTGCCGCTGGAACATTATTGGACGCTGCAA 1066051
1066052ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATATTGCATCGAGTGTCTCGATCTCCTTTGGAACATCGA 1066119
1066120ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATTTTGGTGCTCTATGGCGGGGCAGGTTCCGGCAAGA 1066185
1066186ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATATGTCTATAATAGCCTGGGCGTATTCGCTGATCCCCC 1066253
1066254ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATTTGACGGTGCTTTCATTGTATTATGAAAAAGTCGA 1066319
1066320ATCATGAAGCAGTCCCTATGGAATTTGAAATTATCCAAATCCGAGAGGCGATATCAAGCCTGAT 1066383
1066384ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATATTTCTACCTGTTCTATCTGTTTGCATGTGAACAAAT 1066451
1066452ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATGAATAGGCGCGGACCTTGCATTTGCAGTTGTAGCC 1066517
1066518ATCATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATCTTGCCCCCACACAATCAGGGCAGAGGACAAGACTG 1066584
1066585ATTATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAATATATCGAGCCAGTAATTTTCAGGTTCGATAATGGGG 1066651
1066652ATTATGAAGCAGTCCCTATGGGATTTGAAAC1066682
Left flanking sequence : Till position 1062730 (length bp)
GCGTTTGTGCAAGTGAAAGAGAGGGTGTTAAGCTGTTTGAGAGGCGTAAAAAAAAGAGCATATTTTGCTA
AAAACACCTAAAATTGGGGATTTTTTTGCT
Right flanking sequence : From position 1066682 (length bp)
GCCCGTGGCCTGCCCCAAGACGAGTGAGGATTGAAACATATGTGCGATGGCAAAGTGTCTGGCGGGGCTG
AGTCACACCCGTTCCGGATTGAGGCACAAC

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp