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CRISPRs details
NC_015474_2
Flanking alignement tool
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NC_015474_2                                                                                                                 
top
Strain :
Pyrococcus sp. NA2
RefSeq :
NC_015474 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_015474_2
DR consensus (30 bp) :
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
Number of repetitions :
86
Begin Position :
1688112
End Position :
1693859
1688112
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGGAAC
CTTCGTCGTCGGGCCGAGGAGGGTTGGAAAAACCCT
1688177
1688178
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TAATAGCTCCCATCGCTCAACTTAGTGTACATGACCG
1688244
1688245
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GGGTTAACGCCCAAAGGGCGCAAGGTCTGGATGTTTA
1688311
1688312
CTTTAAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AGTATTCAAGAGGGTAAGGTGAGGTGAGATGACTAGCA
1688379
1688380
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TTTATGTAGTTGATCCTAGCTATATACCTGACGACATA
1688447
1688448
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GCGGTAACCTCTGTTTTTATCTATTCTGCTCTTAACG
1688514
1688515
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TGATGATGAACTCATGAGGGCTATCGAGTTAGCGTAT
1688581
1688582
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TTTACCCGAAGTCGAAGTTCAAGGTGTACGTAACGC
1688647
1688648
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TAACTGCCACGCCCAATGCACCGTCAACAGGCGTGTG
1688714
1688715
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GTAGGCAATGACCTACGTCAGCAATTCCGTCAACATAA
1688782
1688783
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CTACGACAGCCCCTCGCCGAAGAGCGAGCTGTTCACGTTC
1688852
1688853
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GGGACTCGGCGAACGGGAAGGCCGTCGTGTGGGTGA
1688918
1688919
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GTAGACCACTTCCTCCCTGCTGAGCAGTTTGAAGAAGAC
1688987
1688988
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CCATGAGCCCGGCGAAAAGCCGGGTGAGGGGACAGT
1689053
1689054
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CTACGAGAGCGTCCTGACCTACATCTTCGCCCAGTAC
1689120
1689121
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TTCTACAGAGACTAACCAACACATCCGACGCAACAAC
1689187
1689188
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AGCTTTTCGATGTTCCCGTAATCCCTCAACGCCTCGTT
1689255
1689256
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AGATTAAGCCGATAATCCTCAACGAAGACCAAATAG
1689321
1689322
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TCTATCTTCGTCTGTTGGGAGGCTCATGAAGAATTT
1689387
1689388
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AGGTTATCCTTAGAGAGCATAGCCTCAGCCTTAGCCT
1689454
1689455
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CCTCTTACTACCATCCTCACCCTTACGCTCAATCTTT
1689521
1689522
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GACGCTATGGCCTGAGAAGGGGGGGCTCTTAGTATTGC
1689589
1689590
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GAAAATCTTCTATAGCTCCAATATTGCGTTTGAGGTT
1689656
1689657
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AGGGGAAGCAGGGGATGGCAGTTTATCAGAAATTTTA
1689723
1689724
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
ACGTCAAGAAGAATATAGAACTGATTCTAGAAAAGT
1689789
1689790
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CTGAATTCAAAGATGGGTTTTGGGTTTGCCCTGTGTG
1689856
1689857
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GTGCGTGTTACTCGTTATGAGGTTGTGCTCAAGCTTGA
1689924
1689925
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CGAGATGTTTTTTTCTTTATCTCTTACGTCTGGTGGCAA
1689993
1689994
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
ATAAAGTACATCGCAAAGAGGCACGGGATGTACGTGA
1690060
1690061
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CCGGTGTGAGCCCGGCCCGGGGGCCGGCGCCAAGGAT
1690127
1690128
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AGAGCAGGTTCTGAACCTGATTTCATTATTTTTTTGC
1690194
1690195
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TCACAACGTTCATTCCTCTCCCTCCTCGATCTCAACTTC
1690263
1690264
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TTTTTTCAGAACCTTGTAGGCTAGATATCTGTAAAA
1690329
1690330
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CTTCCAATTTCGAAAATTTTTCTGTTATCTACTTGCT
1690396
1690397
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CGCCTCTATCCTGATCAGGGCGTAGGAGCCGTATATC
1690463
1690464
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TCACCCCCCTCCTCGAGGCTGTCGAGCCACAAAATCA
1690530
1690531
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GCAGTCAGCTGGAGAAATGGTGAAGGGTACATAATGCT
1690598
1690599
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TTGAAACAAGCTCTTCATCAGAAGTGTAGAGCTGTGGT
1690666
1690667
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GGCAATGGCTCTTGGAACAGGGATACAGCGAGAAGA
1690732
1690733
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TTTCACCACCTTCCAACTCTTTTAAAATATAAAAAAA
1690799
1690800
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CTGGAGAGGATGAGGAGTGAAGATTGTAAAGGTTTTG
1690866
1690867
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GTAAGTGTGGACACACAAAAGCAACCACCCCCAAAAA
1690933
1690934
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TCACTTGGGAGCTACACCCGACAATATACGACAAGATC
1691001
1691002
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CTCTAAGATGCGTTTTTCGATAAGATACGAATGAGAT
1691068
1691069
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CGTTGAATACGAGGATGTCCCCCCTCTCCTGAAGCCTA
1691136
1691137
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CTCAACCTAACCACCCTGCCAATTACTTTCGACGAGATT
1691205
1691206
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
ATCTTTTAGACGAGAGAGAAGCTCACGCCGTAATGA
1691271
1691272
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TGGTCAAGGCGTGGGGCAGATTTGAGGTTCTACGATG
1691338
1691339
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GTGGCGAAAGCCAAGACCGTATCGTGGTTTTCCTCAA
1691405
1691406
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GCCAAGAGGGTCGTGAAGGAGGTCGGGTTAGATGCCG
1691472
1691473
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
ACCTGCGTGGCCTTGCCGGTCACGACGCTCGCCGTC
1691538
1691539
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CTGAGCCTGACCCTCATACCACCACCTCGAAGATCA
1691604
1691605
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AGCAGGTCGAGATGGCCAAGGACATGTTCGGCGTAGAC
1691672
1691673
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TCTAAGTGGAAGGTTATTGAGGAAGCGATTAAGCTTT
1691739
1691740
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CCCCTAAGCGAATTCATTAAGTTTGTAGAGAAAAGAGA
1691807
1691808
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CTCCGATCTTGTTAGTTGCTTTCTCTTTTTCTAGAAAT
1691875
1691876
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GTATTATGGGAACAGTAGTGCAGTGAGCGAGAGCGA
1691941
1691942
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AACATCCTTGTCTGCCTTTATGTCTGTCGGAGCCGT
1692007
1692008
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
ATGATGCTGTTGAGAAAATAGAGAAAATGCTGGACAAA
1692075
1692076
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CTGGTATGCCATAAAAGGCTTCATAGTTTGTGGGTT
1692141
1692142
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
ATAGCTAAACCAGCTTACCCAGCAGCTACGGTAATCTC
1692209
1692210
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TTGATGCTCCATCTAAGCCTGTTGAAGTTCATAAGAA
1692276
1692277
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GGAAGTCCTTGACAGGATGTACGTCTCGACCGACCAG
1692343
1692344
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CCATTTCAACCACCAGTCGAGGGTCGACTTGACCGC
1692409
1692410
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TTGATAAGAGAAATTGAGAAAAGGCTAGAGACCGCA
1692475
1692476
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CTCCGCTCTTCTTTTGACGTTTTTCCGAAAAATACCAG
1692543
1692544
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TCCATTCTACTGGCAATTGTATCACTGAGAGGTAGTT
1692610
1692611
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CTCCAACGGCGGAAGAAAGCCTGGGTGTCGTCTATTGT
1692678
1692679
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CCCCAATTGTCAACCTCCCCAACAAGTTCCAAAACTGAG
1692747
1692748
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AGTTAGCATATGAAGCAGAATTCATGGGTTGGGGTTCCC
1692816
1692817
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
ACCTTCCTTTGTTTCTCCCTGGGACTGGTTTTCTTCC
1692883
1692884
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TACTTTAGTTTCTCGACGAAGTCTATTTTCCACTCCA
1692950
1692951
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TGGAGACGGGTGAGATTGATAGTGATGTTGCGCCATTG
1693018
1693019
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CAATAATCCAATTGAGTTCGACGTTGCAGAAGGCTT
1693084
1693085
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TGAGAAACATTAGCGGAAGCGATAAGGCTCCAACCAG
1693151
1693152
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
ACAACCAAGGTGGGGGTCACGCAAAACCGCGGCATGT
1693218
1693219
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TGAGCCGAGTTCGACAAAAGAATTCGAGCTGGAGATTG
1693286
1693287
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
ATCCTACGTTCTGAAGTGGGCAGTTGAGGGACTAAGA
1693353
1693354
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TTTCAGAAGAGCTGATGAAGTTATAAGAAAAGAAAAC
1693420
1693421
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CCAAAGGCTATTTTGATTTTGAGAGGGGAATACACAAG
1693488
1693489
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
GCGCTGGGTCGTCAGGCTCATGAGGGACGAGGAGTTC
1693555
1693556
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TTTTACTTATGCGTTACTCATATTTAAGTGTTTCGGT
1693622
1693623
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
CCCTTCTTGTATAGCTCCAATTTCTGTTGATACTCCC
1693689
1693690
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
TTGTCCATCTACCGTAAAATATGGCAACTTTGAGCAATCCTAC
1693762
1693763
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
AGGAGTTTATACATAGGTATATACGAGGACATAAGTG
1693829
1693830
CTTTCAATTCTATTTTAGTCTTATTGGAAC
1693859
Left flanking sequence : Till position 1688112 (length
bp)
AAAAACCAAACAAACCTCCTCGTCCTAGCTCGATGAGGAGAGCAAAGTCGATGTAATCGGGATAACATTA
AAGCTCTAAAGCCCTCTATTTTTGATAATT
Right flanking sequence : From position 1693859 (length
bp)
AGGCGCGATTTTTGCTCTATTTTCTCTATAGAGGAATTACATTACTCCAATTTTATAAGCTTTTTGGATA
TCGATGGTTTCCCCCATTTAATATTGGTGA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp