CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_015571_6
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_015571_6                                                                                                                 
top
Strain :
Porphyromonas gingivalis TDC60
RefSeq :
NC_015571 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_015571_6
DR consensus (30 bp) :
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
Number of repetitions :
66
Begin Position :
296084
End Position :
300394
296084
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TGTCATATAGATATGACATCTTAGATATTGGTACTA
296149
296150
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TGTCATATAGATATGACATCTTAGATATTGGTACTA
296215
296216
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TGTCATATAGATATGACATCTTAGATATTGGTACTA
296281
296282
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TGTCATATAGATATGACATCTTAGATATTGGTACTA
296347
296348
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TGTCGTAACAGCAGGGATGAACTATGCGCTGCACG
296412
296413
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CGTTATACCTTCTATCGTCTTCAAATCTAAGGAT
296476
296477
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GGGTGGCGAGCAATGACGCGCTCCAGAACCCGACCG
296542
296543
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CCTTTGCCGTACGGGCGCGGCCGTAATGCGATCAAAG
296609
296610
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AATACGTAGGAGGCGGACTATGATAGTAGCGATTAT
296675
296676
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CGTCAGCGCTTCAAGTACTCCACCCGCTCCTACGAG
296741
296742
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TTGTAGAATCTTATGTTTTTAGAGAACTATTTAATCA
296808
296809
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ATGAAATAACCCCAAAGATAAATCCAACTACAGGCAAA
296876
296877
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TAAATAATCATTTAATTGTAACATTTTGTGAATA
296940
296941
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ATAGTATCACACAACATCAAATGTTAGATGGATAT
297005
297006
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TTAGTAGGAGATGAAGACGACTTTTTTAACGTGGTCAA
297073
297074
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CTTTGTAGATTTATCGGATTATTTCGATATTATAA
297138
297139
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TTAATGCAAAAACTATAGTCCTCAACGCTAAAGACGC
297205
297206
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AGTATGCCTGACACGCGAGATCGCACCTTGTCGAGG
297271
297272
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ACGGGCGTTGTTCAGTCGGTCGTTATCGGAGTAATCGA
297339
297340
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ACTATTCGGGAGGGAAGATATACAACGAGACCGAT
297404
297405
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ACGGGGATGGCTCAGCCCTCGATTAGCCGGTTTCTGGC
297472
297473
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CTTGCCTTTAGAGCTCTTTTTTTATCAAGCTCATTG
297538
297539
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GCATTCGCGATTTTTCCGACCTCGAACGAATCGTAT
297604
297605
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GACGCAGGCGCGGGCGGACGTGTATAAAAAGTACT
297669
297670
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TTCGGTGGCATCGTCTTCGTTCGCATACAGAACGT
297734
297735
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ATTTCTTACGCCCCATTCAAACTCATCCAGAAATTCT
297801
297802
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TGTTTCAGGATTTACCGTTGTGTACGTTCTGAGCT
297866
297867
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GTGAACGGAGCGTCGAAACAATGCCACGTTCCGAA
297931
297932
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CCGAGCGATAAGACCACATAAGGAGAAACGATCCGCT
297998
297999
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ACCTGCAATAGATATACGACATAATTTCGTATTGCA
298064
298065
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CCTCTAAAATCATGTACGATTTTAGGGGGTTGTTTA
298130
298131
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AGTAATTATTCAAATTTCTTGTTTATCGGATCTCT
298195
298196
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GAGGCCTCATTCGGCTCTATCTTCGCACCCGACAC
298260
298261
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TGTTGGCTTCCAACTTGTCGGCTTTGATCTCAACAT
298326
298327
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CCGACCTGCTTCCACCCTCTTCCGCCTTTATTCAA
298391
298392
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TCTTTTTTTGAAGAAAATTCATAGAAACAATGTAAG
298457
298458
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GCTTTTTCACCTTTCGCGCCAATCGCTCAAAGCTCA
298523
298524
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GCTTTTTCACCTTTCGCGCCAATCGCTCAAAGCTCA
298589
298590
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GTGATACGATTAATACGTTAGCGTTATTCTTCATG
298654
298655
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TTCTTTATCGTGATATTTTGTCCGCTCTTTTTGAC
298719
298720
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AGGTTGCGCATTTCTTCTCCATGCAAGATGTAAACA
298785
298786
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TTCATGTCTATTCCTCTTCTTTATAGGTTCCTAATTT
298852
298853
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TAAATGCGTTCTCAATCACACCAATCTTGCCGGC
298916
298917
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CGTTCAGTTGTTCGCATTCAGTCGCCGACTGCCCC
298981
298982
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ATCCACATTAGACGCATTCGCACTCGTCCAGCCCG
299046
299047
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CTGATGACATACAAAGAGTATATCGCGGCAATGGT
299111
299112
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TATCCTCGTACAGGTTTGCCACCTTGTCGGAGACGT
299177
299178
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ATGCTTATTCAAAGGTGGATCGCGTGGTGATTTCTCAG
299245
299246
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CCTTCTACGATTACTGCCATTTACTTTACTTTTTTT
299311
299312
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TAATAGTCCACACCCCAACGCCAAAGGATGAATCG
299376
299377
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CGGTAATCCTCCAGCGACGCCAGCCCGTCCGTGGCG
299442
299443
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AACGTCGATGTCTCAGGCGACTATGGCACAGCCACA
299508
299509
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CGACATGCCACCCGCAGGACACGATATGCCGCGAGA
299574
299575
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GCGGCCCTTGTCGGCCGCTCTCTCTTTCGTTATCGA
299640
299641
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GCGTACCCGCCTCTGCAGTTGCAAACACAGCTGCGA
299706
299707
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CCAGCCTTGTTTTTCGAACCCGAGGTGGCAAGGAC
299771
299772
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GTACAGGCGATTACGGGCGTGGTGGGTAAAGAGTTCG
299838
299839
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CCGCGTCGGACAAGTCCGCGGGCTGGAGACCCAGTA
299904
299905
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TTTCTCTGACATTAAAATAGAAATCATCGCTGAAGA
299970
299971
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CCTCCGCCCCCAGCCCGCTATCGACCCCCACCTGC
300035
300036
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AGGGCTGACGTGTATAAAAAATACCTGGGGGATAAT
300101
300102
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CTCAACCAGTTCGGGCTGGAGGCGTCGGAGGCGGCT
300167
300168
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ACTTCGCCGTCCGCGGTAATGTGACCAATACCGAC
300232
300233
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CACCCACCCACGCCAGCACCCTCTGCCACCAGCGC
300297
300298
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AACTCAAAAAAACTACAATAAATATGCCAACAGTAGT
300364
300365
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
300394
Left flanking sequence : Till position 296084 (length
bp)
ATAACTCCCTATTATACAATGAATTAACAAACAAAATACACACTAATTGCCATGCAAAGGTCTCTGTCAT
ATAGATATGACATCTTAGATATTGGTACTA
Right flanking sequence : From position 300394 (length
bp)
CCGTTACAAATATAGGCTTTTCTGTTTGAATGTGAGGAGTTTACGAGAAGGTGAAACCCAAAATTCAGAC
ATTCATAGTTGTCGATGTCTGATTCTATGA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp