Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_015571_6                                                                                                                 top


Strain : Porphyromonas gingivalis TDC60 RefSeq :NC_015571 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_015571_6
DR consensus (30 bp) : GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATNumber of repetitions :66
Begin Position : 296084 End Position : 300394

296084GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGTCATATAGATATGACATCTTAGATATTGGTACTA 296149
296150GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGTCATATAGATATGACATCTTAGATATTGGTACTA 296215
296216GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGTCATATAGATATGACATCTTAGATATTGGTACTA 296281
296282GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGTCATATAGATATGACATCTTAGATATTGGTACTA 296347
296348GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGTCGTAACAGCAGGGATGAACTATGCGCTGCACG 296412
296413GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCGTTATACCTTCTATCGTCTTCAAATCTAAGGAT 296476
296477GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGGGTGGCGAGCAATGACGCGCTCCAGAACCCGACCG 296542
296543GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCTTTGCCGTACGGGCGCGGCCGTAATGCGATCAAAG 296609
296610GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAATACGTAGGAGGCGGACTATGATAGTAGCGATTAT 296675
296676GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCGTCAGCGCTTCAAGTACTCCACCCGCTCCTACGAG 296741
296742GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTGTAGAATCTTATGTTTTTAGAGAACTATTTAATCA 296808
296809GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATGAAATAACCCCAAAGATAAATCCAACTACAGGCAAA 296876
296877GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTAAATAATCATTTAATTGTAACATTTTGTGAATA 296940
296941GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATAGTATCACACAACATCAAATGTTAGATGGATAT 297005
297006GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTAGTAGGAGATGAAGACGACTTTTTTAACGTGGTCAA 297073
297074GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCTTTGTAGATTTATCGGATTATTTCGATATTATAA 297138
297139GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTAATGCAAAAACTATAGTCCTCAACGCTAAAGACGC 297205
297206GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGTATGCCTGACACGCGAGATCGCACCTTGTCGAGG 297271
297272GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATACGGGCGTTGTTCAGTCGGTCGTTATCGGAGTAATCGA 297339
297340GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATACTATTCGGGAGGGAAGATATACAACGAGACCGAT 297404
297405GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATACGGGGATGGCTCAGCCCTCGATTAGCCGGTTTCTGGC 297472
297473GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCTTGCCTTTAGAGCTCTTTTTTTATCAAGCTCATTG 297538
297539GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGCATTCGCGATTTTTCCGACCTCGAACGAATCGTAT 297604
297605GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGACGCAGGCGCGGGCGGACGTGTATAAAAAGTACT 297669
297670GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTCGGTGGCATCGTCTTCGTTCGCATACAGAACGT 297734
297735GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATTTCTTACGCCCCATTCAAACTCATCCAGAAATTCT 297801
297802GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGTTTCAGGATTTACCGTTGTGTACGTTCTGAGCT 297866
297867GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGTGAACGGAGCGTCGAAACAATGCCACGTTCCGAA 297931
297932GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCGAGCGATAAGACCACATAAGGAGAAACGATCCGCT 297998
297999GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATACCTGCAATAGATATACGACATAATTTCGTATTGCA 298064
298065GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCTCTAAAATCATGTACGATTTTAGGGGGTTGTTTA 298130
298131GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGTAATTATTCAAATTTCTTGTTTATCGGATCTCT 298195
298196GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGAGGCCTCATTCGGCTCTATCTTCGCACCCGACAC 298260
298261GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTGTTGGCTTCCAACTTGTCGGCTTTGATCTCAACAT 298326
298327GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCGACCTGCTTCCACCCTCTTCCGCCTTTATTCAA 298391
298392GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTCTTTTTTTGAAGAAAATTCATAGAAACAATGTAAG 298457
298458GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGCTTTTTCACCTTTCGCGCCAATCGCTCAAAGCTCA 298523
298524GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGCTTTTTCACCTTTCGCGCCAATCGCTCAAAGCTCA 298589
298590GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGTGATACGATTAATACGTTAGCGTTATTCTTCATG 298654
298655GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTCTTTATCGTGATATTTTGTCCGCTCTTTTTGAC 298719
298720GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGGTTGCGCATTTCTTCTCCATGCAAGATGTAAACA 298785
298786GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTCATGTCTATTCCTCTTCTTTATAGGTTCCTAATTT 298852
298853GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTAAATGCGTTCTCAATCACACCAATCTTGCCGGC 298916
298917GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCGTTCAGTTGTTCGCATTCAGTCGCCGACTGCCCC 298981
298982GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATCCACATTAGACGCATTCGCACTCGTCCAGCCCG 299046
299047GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCTGATGACATACAAAGAGTATATCGCGGCAATGGT 299111
299112GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTATCCTCGTACAGGTTTGCCACCTTGTCGGAGACGT 299177
299178GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATATGCTTATTCAAAGGTGGATCGCGTGGTGATTTCTCAG 299245
299246GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCTTCTACGATTACTGCCATTTACTTTACTTTTTTT 299311
299312GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTAATAGTCCACACCCCAACGCCAAAGGATGAATCG 299376
299377GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCGGTAATCCTCCAGCGACGCCAGCCCGTCCGTGGCG 299442
299443GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAACGTCGATGTCTCAGGCGACTATGGCACAGCCACA 299508
299509GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCGACATGCCACCCGCAGGACACGATATGCCGCGAGA 299574
299575GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGCGGCCCTTGTCGGCCGCTCTCTCTTTCGTTATCGA 299640
299641GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGCGTACCCGCCTCTGCAGTTGCAAACACAGCTGCGA 299706
299707GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCAGCCTTGTTTTTCGAACCCGAGGTGGCAAGGAC 299771
299772GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATGTACAGGCGATTACGGGCGTGGTGGGTAAAGAGTTCG 299838
299839GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCGCGTCGGACAAGTCCGCGGGCTGGAGACCCAGTA 299904
299905GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATTTTCTCTGACATTAAAATAGAAATCATCGCTGAAGA 299970
299971GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCCTCCGCCCCCAGCCCGCTATCGACCCCCACCTGC 300035
300036GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAGGGCTGACGTGTATAAAAAATACCTGGGGGATAAT 300101
300102GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCTCAACCAGTTCGGGCTGGAGGCGTCGGAGGCGGCT 300167
300168GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATACTTCGCCGTCCGCGGTAATGTGACCAATACCGAC 300232
300233GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATCACCCACCCACGCCAGCACCCTCTGCCACCAGCGC 300297
300298GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAATAACTCAAAAAAACTACAATAAATATGCCAACAGTAGT 300364
300365GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT300394
Left flanking sequence : Till position 296084 (length bp)
ATAACTCCCTATTATACAATGAATTAACAAACAAAATACACACTAATTGCCATGCAAAGGTCTCTGTCAT
ATAGATATGACATCTTAGATATTGGTACTA
Right flanking sequence : From position 300394 (length bp)
CCGTTACAAATATAGGCTTTTCTGTTTGAATGTGAGGAGTTTACGAGAAGGTGAAACCCAAAATTCAGAC
ATTCATAGTTGTCGATGTCTGATTCTATGA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp