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NC_015949_9
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NC_015949_9                                                                                                                 
top
Strain :
Caldicellulosiruptor lactoaceticus 6A
RefSeq :
NC_015949 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_015949_9
DR consensus (30 bp) :
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
59
Begin Position :
2612217
End Position :
2616136
2612217
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TAAGGGAAAACTAACGATTTAACAAGAGCAGGATGTCC
2612284
2612285
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
AAAAATCCGAGTATGAAGAAAAAATAAAGTCGTTTGT
2612351
2612352
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATTTTATTTGCATCTGCGGTTTTTAACCATGAATGAAT
2612419
2612420
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ACCGCCCCGATGATAATTCCCTCATCGGGAAAGTCA
2612485
2612486
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
CTGTTTAATGCATGCCATGTAGTTTCTATCCACAT
2612550
2612551
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATATTTACTTTTGCCTTTTCTGTCTCAGCTTTCAAAA
2612617
2612618
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATGAAAAACATTAATTACATTCTTGCAAGGGATGAA
2612683
2612684
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
AAGAGACGAGTATTGGACTTGCAAAGAAATTGTATCGT
2612751
2612752
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
AATAATTTCTAAATATTCTTAATCTATCTCAAAAGA
2612817
2612818
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATGAACTTCTTCAAAAATTTCTAAATACTTTCAAT
2612882
2612883
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATCTATACCCTTACTCTTCAATATGCTGAACTCATCT
2612949
2612950
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TGCTCAGATAGACGAAGCAGATTATATTTGTAAGC
2613014
2613015
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
GCTTTGAAATTGCCGTCTTTGTCTTTTTCGAGCTCA
2613080
2613081
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
GTACTTCAAACGTCCAAGCGATAATGTGAGCTTGCACAT
2613149
2613150
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TGTGATTGCAATTGCTCTTGTATCTTTGATTCAATCT
2613216
2613217
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
CCACCACGTACTAATGATTGATTGATAGTACGAAT
2613281
2613282
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TTTTTTCACCTCCCCTTGGACACGATGGCTACTAC
2613346
2613347
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATAAGTTCTCCACAGACAGGACAGGTGGCTAATTCCCG
2613414
2613415
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TACCACCGCCTTACGGTGTTAATTGTAGTTTACCACTTC
2613483
2613484
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
GTCATTGATGCGTGGTGGAGAACAGTTCGTTGTCTTT
2613550
2613551
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
AATGGCTGAAAAGGTAAGCAACAAGCCGTGGGGTGCC
2613617
2613618
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TGGCATTGTGGAGATGGACGTGGCAGATATGGTATAA
2613684
2613685
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TGTTTTCTTGCTTTATCAACTCTGCAAGCTTTCTATTA
2613752
2613753
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TTCTGAGAGTGAAAGGTGATTCAATGGAGCCAGAGATA
2613820
2613821
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
CCCTATCTGTTCAATTGTTAAAGTCTCATCTTCAAC
2613886
2613887
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATGAATGTTTCAAACACATAGCGTTCCCAGTCCTCAAG
2613954
2613955
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
AATTATTGTCCAAGATTTTAATAATTCATATTTTAT
2614020
2614021
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ACCTGAACTGCCAACGTTGCATACCCAGCTTTTTTA
2614086
2614087
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ACTGAATAATACACTGTCGCCCTTGTGCCTTCTATTA
2614153
2614154
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TATCTTATTCCATCATACTCTACCTGAACTGCCAACGT
2614221
2614222
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
AGAGGTAGACGACATATTTAGACTTGTATTGATGTTAG
2614289
2614290
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
CTACCACCATTATTACTACCTGCACTATAATTTGGT
2614355
2614356
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
GTCTCAGGTTGTGTTACAAGTATGTTATAAAAATCTTT
2614423
2614424
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ACAGTTGACCTTTTTTGATTGAAAAGAGGTGATGAA
2614489
2614490
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TTAATGCTTGATGGTGAGAAATCACGGTTTTTCAGTT
2614556
2614557
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
CACGATATCCTTTCAAACCTTCACCATCTGTTTTCAAC
2614624
2614625
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
GCAAGTATCTCATACAGGATAGTGCTCGCAGTGCGA
2614690
2614691
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATGATTTTTATGATAGAGTTGCGTTTGAAGATGTAAAA
2614758
2614759
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
TAATATATATTTTACACCATAATAGCTTTTTCCTGCTC
2614826
2614827
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
AAGTCTTCGCTATCATTGATACTGGTATCAGTGTTA
2614892
2614893
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
ACTCTATAATGTCTACTCAATACAAGTGCATCAAAAAG
2614960
2614961
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
GCAGGATGTGCCAGGTACCGTATGCACGGTACGCAGTA
2615028
2615029
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
TGTCTAAATCATCAGCAAGTTTTCTAAAATCATTTGCAT
2615097
2615098
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
TAGTCAGGATAATTCAATTGCGAATAAGCATAGTTT
2615163
2615164
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
TCCTGTTGGCAAACTTTTGCAAATCCCCATAATCGGCA
2615231
2615232
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATTATCCTTGCCATCCTATCAATTTCGAAATCTATT
2615297
2615298
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATTGAAGCACAAATTAAAGCCTGCAAAGAATACTGC
2615363
2615364
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
GCTTTTCCTAAATTCTAATGGGGACTCTGTCCCCATA
2615430
2615431
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
GTCAATTTCTGATCCCTTGGTAAACATACTGGTCTACTA
2615499
2615500
GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC
ACTACTTTAGAAATTATGAATTTTCTGTCATTGATAA
2615566
2615567
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
TTATAAATCTTGCGTGAAGTGTTTGGTGAATGCAT
2615631
2615632
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
GCTATAATGTCAAAATCAGGAATTTCTTTTTTAAGTTC
2615699
2615700
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
ACAACACAGAAGTGCCTGCAACAAACGTTTCAGTAG
2615765
2615766
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
ACAAGCACTTTCTTCATACCAATCTACCTCCAATTTT
2615832
2615833
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
TAAACTATGATTGCTTTTTCATATTCTCTTATTTCTTT
2615900
2615901
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
GCTTGTTAGAATATCAGCAAACAAGAGCAAAAATCA
2615966
2615967
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC
ATGAATAAGTATTTGGGTTTATTTTCTTTTTTTGGCTTTT
2616036
2616037
GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAT
ATTCCTCTTTTTGGTGATTTTTGTACTCTTCTTGAAGTTT
2616106
2616107
GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAGAA
2616136
Left flanking sequence : Till position 2612217 (length
bp)
TATGCAACTGGGTTTGTGTTGATTTTGAGGGAATGTATCAAAATAAAAACATTGACAGGGGTGCATAAAG
TTGATATAATAAAATCAGGCTTTTTAACCG
Right flanking sequence : From position 2616136 (length
bp)
AAGAAGAGAGTTTTTACCCTTTCCTTTGGGAATTGTGAAGAAAGGAATTGCAAATCCTAAACTTCGCAAA
AAATTTGACTTCAGCTTTTCTCTTTTTTGT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp