Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_017173_10                                                                                                                 top


Strain : Clostridium difficile CF5 RefSeq :NC_017173 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_017173_10
DR consensus (29 bp) : GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATNumber of repetitions :25
Begin Position : 1887965 End Position : 1889572

1887965GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTCTATGTCTTCTACTGTTATATATCTTTCAATTTT 1888030
1888031GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCTCTGCGCAAAAGAGTGGTTGGGAATTTGATTTGAAAA 1888097
1888098GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATATACTTGGTCAATACATTTCAAAAGTTGCAACAGAACA 1888164
1888165GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCGGCAAACTTGAACTGTTTTTTCTTTTGCTTTTAAAA 1888230
1888231GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATACTTTTGAACTAAAAAAAATTATTTATTTTTTATATG 1888296
1888297GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTTTAGCACCCGCATACGAGTCAAAAAAAGATGA 1888360
1888361GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTGGAAATCTATTTAAAAACTGCATCAAAGTATTGATA 1888426
1888427GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCAAATTTTGTTTACACTGGATAGAAAAAACTGTTCT 1888491
1888492GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATACGGGCAAAGAAGGATTCTCAACTTTAGGAACTGTA 1888556
1888557GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCAAAATTCTGTTATTTCTTGAATTTTATCGCTTAAA 1888621
1888622GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTCATTTTCTCCAAATTTATCACTCCCGCATTTGGGG 1888686
1888687GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTGACTTTTTTCTTACTATACTTACTATCATTGCAAC 1888751
1888752GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAGAAATATCAGAATTTTGTGGGCTTGGTTGGGAGATA 1888817
1888818GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAATATGGTAAGTAAAGTTGATGATATTGAACTAGGA 1888883
1888884GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTAAGCACTAAGACATTCTTGTAAGCATTCTTCTGCTT 1888949
1888950GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAAACATGATTCTTATTTGTTCGAGCGTATTCATATA 1889015
1889016GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAAACATGATTCTTATTTGTTCGAGCGTATTCATATA 1889081
1889082GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCAACATTAGGATTATTATAATAAAATCTTTCAAGAATA 1889148
1889149GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATACATCTGCGTCATATCTAAATAAATTATCTCCAACTT 1889214
1889215GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGCATATTTAGTTCCTTTTGTAGCATCTAATAAAGAC 1889279
1889280GTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAATAGGGTTTCTGATAAAATCTTCAAACATGTAAAATATGT 1889346
1889347GTTTTGTATTAACTATGTGGTATGTAAATTCTATTTTAGTGTATATTTCGTTTAAATAAGCTTTT 1889411
1889412GTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAATCTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATAT 1889477
1889478GCTTTATATTAACTATATGGTATATAAATTGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCGCTTTGAAATTT 1889543
1889544GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAT1889572
Left flanking sequence : Till position 1887965 (length bp)
GGTATGTGATAAATGTTATCAATTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAGTTGTATGTGTGT
AAGTACTGAAAATACTTAGTTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1889572 (length bp)
TTGCAACAAGTATAGGTAAAATACCCCAATAATTTATACAGCATTTTCTCCTTTAAAATATAATTATTTT
TTATCATTTGTAGTAAATAATTACCAGATA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp