Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_017173_6                                                                                                                 top


Strain : Clostridium difficile CF5 RefSeq :NC_017173 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_017173_6
DR consensus (29 bp) : GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATNumber of repetitions :11
Begin Position : 1649491 End Position : 1650177

1649491GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTTGTCATAGTAGCGACTTATTACAAAGTATTTTTCTA 1649556
1649557GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTACATCCTCATTAATTTCTTTGCTATCCCAAACAGCA 1649622
1649623GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATCTCTTACGCTTTTCAATCACTTTTTCCTTGCTAAAATT 1649689
1649690GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTTGGAAATAAGTATAAAGACAGTGATATGGAAATGG 1649754
1649755GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTATCCATTTCATATTTAGATAAAATCTCTTTAAATGC 1649820
1649821GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATATGTTATTACATAAAAATTCTTCATCTATAACTTTAA 1649886
1649887GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATAAAATAAGGGTTTAATTTCCCTGGTGTCGAGGAATA 1649951
1649952GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTTTAAATGAAACTCTTGAAATAGTTGACGTAGTAGC 1650016
1650017GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAATTATATATTAGATGTCAATGTCAAGGATACAAAATTT 1650081
1650082GTTTTATATTAACTATATGGAATTTAAATCCATCTTTTGTTGCTTTACATAAATTTATATTACTTAC 1650148
1650149GTTTTATACTAACTATACAGAATATAATT1650177
Left flanking sequence : Till position 1649491 (length bp)
AGTGCATGATAAGCGTTATCAATTGCACTATTGCTCGTTCACTGCAAATTTAAGAGAGTTGTATACGTGT
AAGTATTGAAAATACTAAGTTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1650177 (length bp)
TTCTTTTAATGTGTTATCTTATGATTATCTAGTTATATTAGCATACAAAAATATAATAAAATTACACTAT
ATTATAAAAACCAAAAGGTAGTATAGAAAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp