Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_017174_12                                                                                                                 top


Strain : Clostridium difficile M120 RefSeq :NC_017174 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_017174_12
DR consensus (29 bp) : CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACNumber of repetitions :33
Begin Position : 3266657 End Position : 3268778

3266657ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAAACTTATCCATTCGCTTTAAAAAATCCCTTGCGAAACGT 3266721
3266722CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACACTAACTCCAGTCCACTGTAATTACTATTCCTTAAT 3266786
3266787CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCATTGCATATAAGATAAGCTGCATTGATTTTTTAGGT 3266852
3266853CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTGCATTGTAAACTAAAATGCTTTATTCTATATTTA 3266917
3266918CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTCTATTAATAAAATTATCTAATAAAGATGCAAACCC 3266982
3266983CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACACACATATTGCCTTCCCTTAAATCTCCAAAATCTATG 3267048
3267049CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTGCTTATACTTCTTGCAACCTGCTCCTATAACATAA 3267114
3267115CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAATCTTGCTCTGCTTCGCTTTTACTCATTGTGTCAACTG 3267179
3267180CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACACTACAATAATAGTGCCTTTTAGCAAAATTTACTAG 3267244
3267245CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACACTTTTCACATAACCATGATACATTGCTCTACTTAA 3267309
3267310CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAATCGGAGCTAATTTAGAAATTAAAGAGCTTACAAT 3267374
3267375CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAAATTATCTGCGTATCTTCCAGTCGCAAAAGCTA 3267438
3267439CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCCGTATATATACCCATCGAAAACAAAACATTATTTCG 3267504
3267505CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTGTCAGTAGAAGCTATTTTTGAAGGTATTTTATGC 3267568
3267569CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTCTCTATCATATTGTATATTATCTCTATCACATG 3267633
3267634CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTATCAATCTTAAGCCAAGTACCAGGTTGTCTACCAA 3267699
3267700CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGAGAACATGCCCAACCAGATTTTAAGGGTGCTTTAAA 3267765
3267766CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTATAAGACTTTTCTTCTGATTTAGTTTTAAACTGTCTCT 3267833
3267834CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTATATTGAAATTTATTATGCCTTCATTTTACCATT 3267898
3267899CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTGCTTTACCTGCCTTTCCCTGGTCTCTTGATACTC 3267963
3267964CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTGGAGAAATGGCAAGACTTACGGAGTTTGGAGTTA 3268028
3268029CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTGCCACATCCCTCTTATATTCTTCTTTTTCATCAAA 3268094
3268095CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTTCTCTTAAAAATCCGTTATTTTCTTAGTAAACCA 3268160
3268161CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAGAAAATACAATTACAGGAGTTGTGAGGATATTTTAGA 3268227
3268228CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAGAAGATAGAAGAAGCAATATAAAAGCAAAAATGCG 3268293
3268294CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGGAATTACTTGGGACTAAAAAAGTAGAAACAGTTTT 3268358
3268359CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATGCTACAGCAGAAAAAGTTGTAAGTATAAGCAA 3268421
3268422CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTGTTAATCCAAAGAAAGTATCTCCCATTTTACCATC 3268487
3268488CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACACTTGATGGTATTAAACTCTCTAATATTATGCAATT 3268552
3268553CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTATATCAAAGCTGGAAAATCAAGAGTACAAAGATAT 3268617
3268618CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTGTAAATAGTATCGTGTTTCTCTGTATAAAGAAT 3268681
3268682CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTGTAAAGCTCCTAAATCTGCTCCTGCTAGAATATATTG 3268749
3268750CTTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC3268778
Left flanking sequence : Till position 3266657 (length bp)
TGATTTTATTTATATCTTTATTGTTTAATTTCCTTATCATAAATTTTGTTTCACCTCATTTTTGTATTGA
TTTTATCATGTTTATAGGTAAGTGTATTTT
Right flanking sequence : From position 3268778 (length bp)
CCCAAAATAGGTGTAATTGAATACATTGAAAATACTTCAATCAAGCAATTATAATTCAATAAAAACATCA
AAATTTGCAGTGAGCGAACAGTAGTGCAAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp