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CRISPRs details
NC_017178_15
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_017178_15                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile 2007855
RefSeq :
NC_017178 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017178_15
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
Number of repetitions :
19
Begin Position :
1841322
End Position :
1842537
1841322
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTAATTTATCTATAATTTAAAACGGTGAATTACATAT
1841387
1841388
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TAAAGAGGGGTACTTCGTACTTTTACCACTCAAACTA
1841453
1841454
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
AGGTCAAGCATAGATTTTGCAACTGGAAGATAAGAAGA
1841520
1841521
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
GTTTTAGAACAGAAAAAATTGTATAAATTGTGGAATG
1841586
1841587
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTGTAAAATGTAAATAGCATATTAATTTTTCTTTCAC
1841652
1841653
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TGGAGCATTATGTTTTTAGGTTACGGAGCAACATTTA
1841718
1841719
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
GGTGATAGTGGAAGTTTTACTTATACTTGGCGTGCTG
1841784
1841785
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTCAGAATACTTAGCTCCTGCGCCTATATCGTCTGAAT
1841851
1841852
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
AAAGTTTTGCGCATTGTATGTGTGCCTAGATTATCT
1841916
1841917
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
ATGTCCCCACATCAATTTTCCTCCGCATGAAAAAATC
1841982
1841983
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTTAGAAACAACAGAATAAACATAATATATAAGCATA
1842048
1842049
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
CTATATCGCATATTCTTTTATCTAGGTCTTCTTTTC
1842113
1842114
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
ATAATCTTGTTATAGACTTTACTATTGTTGTAATAGA
1842179
1842180
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
CTTACCAGACCCTGCAACACTAAATGACTTACATA
1842243
1842244
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TCATCAGTATTTGTAAAATGCTTTAACTTATCATAAT
1842309
1842310
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTTTACTTTTCCTTTCTATGTGTCCAATTCGGACACATT
1842377
1842378
GTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAAT
CTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATAT
1842443
1842444
GCTTTATATTAACTACATGATATATAAAT
TGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCGCTTGAAATTT
1842508
1842509
GTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT
1842537
Left flanking sequence : Till position 1841322 (length
bp)
GGTGTATGATAAATGTTATCAATTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAGTTGTATGTGTGT
AAGTACTGAAAATACTTAGTTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1842537 (length
bp)
TTGCAACAAGTATAGGTAAAATACCCCAATAATTTATACAGCATTTTCTACTTTAAAATATAATTATTTT
TTATCATTTGTAGTAAATAATTACCAGATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp