Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_017178_19                                                                                                                 top


Strain : Clostridium difficile 2007855 RefSeq :NC_017178 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_017178_19
DR consensus (29 bp) : ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACNumber of repetitions :25
Begin Position : 3263982 End Position : 3265595

3263982ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGTGGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTTATTCTACAA 3264045
3264046TTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAATAAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCT 3264110
3264111ACTTATCTACCACTTAGTTGATATAAAACCTGACACTGTGTCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCT 3264176
3264177ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGATTAAGCCCAGTAAAAAGACTCGAATCTCTTATCGC 3264242
3264243ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGCAAAAAATGTTGATATTCCCAAAATTAATATTGATGA 3264309
3264310ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATTATAGAAGTACATATATTGCTGAAAAACCTCTTGT 3264375
3264376ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAGTTAGTGATATCAATATGCTAAGCAATATTTTTACA 3264441
3264442ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTATATTTCGTCGCACGGATTCGTGCGAAGGGTTGG 3264507
3264508ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAATTTAGTTATATCCATTTGTTTAACCCAATTAGT 3264572
3264573ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTTTCATTTTGCACTATATCAAGCTTAGTATACAATG 3264638
3264639ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTTATATTTAATTTTAAAGATTAAAGGTATAAACAA 3264704
3264705ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTACTAGAATTATTAAATGAAATGAACAATAATATTGT 3264770
3264771ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGATTTAAATGCAACACAAATTATAACATCTAAGAAT 3264835
3264836ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAGATTGAAATTTCAACACTTTCACCTTGTATATCT 3264900
3264901ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAGGTTAAAAAGCAATATAAAAGATTGCATGGAATTACT 3264967
3264968ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAGTCTCAATAACAACAGTCGAAGCAGAAAAATCCGG 3265033
3265034ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTAAAATGAGAAATAAAAGTAAACAAAAAGGTTTAGT 3265099
3265100ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTGAAACCCTCGGATTTAGTAACCGATTCTATGTCGAGTCT 3265169
3265170ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAATCTAAAATATGTTCGTTAAAAGGGAGTGTGTAATTA 3265236
3265237ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTTTCTTATACAACTCTTAACTCCAAGCCCATTTTGGA 3265303
3265304ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTATAAAAAAAGAGTTAGAAGCATTAGACAAATGGA 3265368
3265369ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTATAATTGGGATGGTCAGGTTTCTGATAAGGTTAATAA 3265435
3265436ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTGTTTTTTAGTTTTCGTGATTCAAATGGTTCTTTGTT 3265501
3265502ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAACTCATGTAACAAGTATTAAGACTTGCACCTTTAA 3265566
3265567ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC3265595
Left flanking sequence : Till position 3263982 (length bp)
TGATTTTATTTATGTCTTTATTGTTTAATTTCTTTATCATAAATTTTGTTTCACCTCATTTTTGTATTGA
TTTTATAATGTTTATAGGTAAGTGCATTTT
Right flanking sequence : From position 3265595 (length bp)
CCCAAAATAGGTATAATTGAATACATTGAAAATACTTCAATCAAGCAATTATAATTCAATAAAAACATCA
AAATTTGCAGTGAGCGAGCAGTAGTGCAAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp