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CRISPRs details
NC_017179_15
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_017179_15                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile BI1
RefSeq :
NC_017179 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017179_15
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
Number of repetitions :
19
Begin Position :
1857676
End Position :
1858891
1857676
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTAATTTATCTATAATTTAAAACGGTGAATTACATAT
1857741
1857742
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TAAAGAGGGGTACTTCGTACTTTTACCACTCAAACTA
1857807
1857808
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
AGGTCAAGCATAGATTTTGCAACTGGAAGATAAGAAGA
1857874
1857875
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
GTTTTAGAACAGAAAAAATTGTATAAATTGTGGAATG
1857940
1857941
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTGTAAAATGTAAATAGCATATTAATTTTTCTTTCAC
1858006
1858007
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TGGAGCATTATGTTTTTAGGTTACGGAGCAACATTTA
1858072
1858073
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
GGTGATAGTGGAAGTTTTACTTATACTTGGCGTGCTG
1858138
1858139
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTCAGAATACTTAGCTCCTGCGCCTATATCGTCTGAAT
1858205
1858206
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
AAAGTTTTGCGCATTGTATGTGTGCCTAGATTATCT
1858270
1858271
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
ATGTCCCCACATCAATTTTCCTCCGCATGAAAAAATC
1858336
1858337
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTTAGAAACAACAGAATAAACATAATATATAAGCATA
1858402
1858403
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
CTATATCGCATATTCTTTTATCTAGGTCTTCTTTTC
1858467
1858468
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
ATAATCTTGTTATAGACTTTACTATTGTTGTAATAGA
1858533
1858534
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
CTTACCAGACCCTGCAACACTAAATGACTTACATA
1858597
1858598
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TCATCAGTATTTGTAAAATGCTTTAACTTATCATAAT
1858663
1858664
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTTTACTTTTCCTTTCTATGTGTCCAATTCGGACACATT
1858731
1858732
GTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAAT
CTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATAT
1858797
1858798
GCTTTATATTAACTACATGATATATAAAT
TGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCGCTTGAAATTT
1858862
1858863
GTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT
1858891
Left flanking sequence : Till position 1857676 (length
bp)
GGTGTATGATAAATGTTATCAATTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAGTTGTATGTGTGT
AAGTACTGAAAATACTTAGTTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1858891 (length
bp)
TTGCAACAAGTATAGGTAAAATACCCCAATAATTTATACAGCATTTTCTACTTTAAAATATAATTATTTT
TTATCATTTGTAGTAAATAATTACCAGATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp