Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_017179_15                                                                                                                 top


Strain : Clostridium difficile BI1 RefSeq :NC_017179 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_017179_15
DR consensus (29 bp) : GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATNumber of repetitions :19
Begin Position : 1857676 End Position : 1858891

1857676GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTAATTTATCTATAATTTAAAACGGTGAATTACATAT 1857741
1857742GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTAAAGAGGGGTACTTCGTACTTTTACCACTCAAACTA 1857807
1857808GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAGGTCAAGCATAGATTTTGCAACTGGAAGATAAGAAGA 1857874
1857875GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGTTTTAGAACAGAAAAAATTGTATAAATTGTGGAATG 1857940
1857941GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTGTAAAATGTAAATAGCATATTAATTTTTCTTTCAC 1858006
1858007GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTGGAGCATTATGTTTTTAGGTTACGGAGCAACATTTA 1858072
1858073GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATGGTGATAGTGGAAGTTTTACTTATACTTGGCGTGCTG 1858138
1858139GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTCAGAATACTTAGCTCCTGCGCCTATATCGTCTGAAT 1858205
1858206GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATAAAGTTTTGCGCATTGTATGTGTGCCTAGATTATCT 1858270
1858271GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATATGTCCCCACATCAATTTTCCTCCGCATGAAAAAATC 1858336
1858337GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTAGAAACAACAGAATAAACATAATATATAAGCATA 1858402
1858403GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCTATATCGCATATTCTTTTATCTAGGTCTTCTTTTC 1858467
1858468GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATATAATCTTGTTATAGACTTTACTATTGTTGTAATAGA 1858533
1858534GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATCTTACCAGACCCTGCAACACTAAATGACTTACATA 1858597
1858598GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTCATCAGTATTTGTAAAATGCTTTAACTTATCATAAT 1858663
1858664GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAATTTTTACTTTTCCTTTCTATGTGTCCAATTCGGACACATT 1858731
1858732GTTTTATATTAACTATGAGGTATGTAAATCTTATACTTAGTTAGAACTATATATCGACACAAATAT 1858797
1858798GCTTTATATTAACTACATGATATATAAATTGCAATTTTTATTCGTTGTCCAATCGCTTGAAATTT 1858862
1858863GTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT1858891
Left flanking sequence : Till position 1857676 (length bp)
GGTGTATGATAAATGTTATCAATTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAGTTGTATGTGTGT
AAGTACTGAAAATACTTAGTTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1858891 (length bp)
TTGCAACAAGTATAGGTAAAATACCCCAATAATTTATACAGCATTTTCTACTTTAAAATATAATTATTTT
TTATCATTTGTAGTAAATAATTACCAGATA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp