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NC_017179_19                                                                                                                 top


Strain : Clostridium difficile BI1 RefSeq :NC_017179 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_017179_19
DR consensus (29 bp) : ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACNumber of repetitions :25
Begin Position : 3252448 End Position : 3254061

3252448ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGTGGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTTATTCTACAA 3252511
3252512TTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAATAAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCT 3252576
3252577ACTTATCTACCACTTAGTTGATATAAAACCTGACACTGTGTCTTGTGTGAGTCTTTTCTTTATCCT 3252642
3252643ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGATTAAGCCCAGTAAAAAGACTCGAATCTCTTATCGC 3252708
3252709ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGCAAAAAATGTTGATATTCCCAAAATTAATATTGATGA 3252775
3252776ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATTATAGAAGTACATATATTGCTGAAAAACCTCTTGT 3252841
3252842ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAGTTAGTGATATCAATATGCTAAGCAATATTTTTACA 3252907
3252908ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTATATTTCGTCGCACGGATTCGTGCGAAGGGTTGG 3252973
3252974ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAATTTAGTTATATCCATTTGTTTAACCCAATTAGT 3253038
3253039ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTTTCATTTTGCACTATATCAAGCTTAGTATACAATG 3253104
3253105ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTTATATTTAATTTTAAAGATTAAAGGTATAAACAA 3253170
3253171ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTACTAGAATTATTAAATGAAATGAACAATAATATTGT 3253236
3253237ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGATTTAAATGCAACACAAATTATAACATCTAAGAAT 3253301
3253302ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAGATTGAAATTTCAACACTTTCACCTTGTATATCT 3253366
3253367ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAGGTTAAAAAGCAATATAAAAGATTGCATGGAATTACT 3253433
3253434ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAGTCTCAATAACAACAGTCGAAGCAGAAAAATCCGG 3253499
3253500ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTAAAATGAGAAATAAAAGTAAACAAAAAGGTTTAGT 3253565
3253566ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTGAAACCCTCGGATTTAGTAACCGATTCTATGTCGAGTCT 3253635
3253636ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAATCTAAAATATGTTCGTTAAAAGGGAGTGTGTAATTA 3253702
3253703ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTTTCTTATACAACTCTTAACTCCAAGCCCATTTTGGA 3253769
3253770ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGTATAAAAAAAGAGTTAGAAGCATTAGACAAATGGA 3253834
3253835ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTATAATTGGGATGGTCAGGTTTCTGATAAGGTTAATAA 3253901
3253902ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTGTTTTTTAGTTTTCGTGATTCAAATGGTTCTTTGTT 3253967
3253968ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAACTCATGTAACAAGTATTAAGACTTGCACCTTTAA 3254032
3254033ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC3254061
Left flanking sequence : Till position 3252448 (length bp)
TGATTTTATTTATGTCTTTATTGTTTAATTTCTTTATCATAAATTTTGTTTCACCTCATTTTTGTATTGA
TTTTATAATGTTTATAGGTAAGTGCATTTT
Right flanking sequence : From position 3254061 (length bp)
CCCAAAATAGGTATAATTGAATACATTGAAAATACTTCAATCAAGCAATTATAATTCAATAAAAACATCA
AAATTTGCAGTGAGCGAGCAGTAGTGCAAT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp