Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_017221_2                                                                                                                 top


Strain : Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 RefSeq :NC_017221 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_017221_2
DR consensus (36 bp) : CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCNumber of repetitions :33
Begin Position : 454101 End Position : 456189

454101CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCCTCACGCCAATACGTACCCGCCGGGATC 454164
454165CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCGAATTGGCGCAATCGTATACGATTGAGG 454228
454229CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCTCGTAGTCCCCCCAGAATAGTCCGTGAT 454292
454293CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCCAAGTGGAACTTGTGTACTCACTGCATA 454356
454357CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCATTGTAGCCGGGTCACGTATGCATTTAG 454420
454421CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCTATTCGTTGCCGATGATGTTGCGGAGCT 454484
454485CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCCGTGCCTATGCGTTGTTTGCCGCCTTCC 454548
454549CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCCTGAGATGCGCGCTGGAACACGCTCAGT 454612
454613CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCAATGCGCTGAAATACGGGTTGGCCAACG 454676
454677CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCCCGAGGCCGGTAGGGTTGCGTGTCTGGT 454740
454741CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCGTTGTAATCGGTCATAATAGTTTTCAAT 454804
454805CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCTCTCCCAGTTGCTGCCCCTTGGCGTCGA 454868
454869CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCCGTATTCATCGTGGCCTCTTCGCGGTTT 454932
454933CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCCGTACATGATGGGGTCCTTGACCTTGTA 454996
454997CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCTTGGTGGTGTTGGGCGTCCGGCGCAGAA 455060
455061CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCAGGTCGAGCGCCTCCTGCCATCCGGCCT 455124
455125CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCACAGTATTATTGTCCTGATATTCATGTC 455188
455189CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCTCGTCGTCCATCTCTGTACCTCGGTTTCT 455253
455254CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCTCCATGACCGCGTCCATCACCTCATGCC 455317
455318CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCCGTTCCCCAGTGGGGTGAGTGTGATGCC 455381
455382CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCACCGATTGCAACGCGAATATCCCGGGTAT 455446
455447CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCTCCTGCAACTCCTCCTTGCGGGCCTTCA 455510
455511CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCGTTGTTCCGGGAACAACTGGGAACAACT 455574
455575CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCCTTGCCTCCGTTCTGCATCCAGCTGTCG 455638
455639CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCGTCGCACGTGGCATGGCATGTTGGCGAAC 455703
455704CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCTGTTGAGGGGAACCGTATCAAACCTGATT 455768
455769CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCTGGTTTCCGTGCCGCATTGGTCGCAGTA 455832
455833CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCTCATGGGACTGTGAGCGGCGGCGGCGTGA 455897
455898CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCTAGAAGTGCAGATTCCGTTCCTGCAAAC 455961
455962CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCAGGACGTGCAACGCAAGTATTTCAAGAT 456025
456026CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCTCGTCGATGTGTTCCAAGAGGTTTGGTG 456089
456090CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTCCCAGCTATTGTTCGGGTGCGATGGTGATGATCA 456153
456154CAAGCTTATCAAGAAGGGTGAATGCTAATTTTGAAT456189
Left flanking sequence : Till position 454101 (length bp)
ACCAAAGTGCGCAAAAACTCGGGCACTACCTGACTTTCTCACGCTTTTTTGAACGTAGGAGAGTCTGAAA
AGATTGAAATAGCCCTTCTTGATAGGCTAT
Right flanking sequence : From position 456189 (length bp)
GCTGGAATGCTTGGGTTGATTTGGCTGATTTAGCTGTGATGGCCGCTGCGGGAATGGCCCTTGCGCGGTT
GGCGGCAGAGGTTGCGGCGCGGATTGCGGC
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp