Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_017274_7                                                                                                                 top


Strain : Sulfolobus solfataricus 98/2 RefSeq :NC_017274 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_017274_7
DR consensus (25 bp) : GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGNumber of repetitions :117
Begin Position : 2054517 End Position : 2061910

2054517GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTCACATCCCTCACAATCCATAATGAAAATGTCGGCAT 2054578
2054579GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGATTTTAGCAATGCAATAGATCAACAATTGAAAGAAACT 2054641
2054642GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGATTTTCATCTCTTGGATTGAAAATAAATGAATTTTCTTC 2054705
2054706GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTGTTTCACAAATTTCAAACTTGCAAACGCAACAATTAAATA 2054771
2054772GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGGTTTTTGGTCAAATATTTGGACAACACTTACAAGAATTGG 2054836
2054837GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTAGTCAACGACAAAGTGCTTAAAACCCGTGTTATACTC 2054899
2054900GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGGCTGTAATAGTCGCAATAGCAAAAGCCGAAACAATGAGT 2054963
2054964GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCAATAGAATTTTTCTTAGTTGGCATTGACAAGTATAATTCT 2055029
2055030GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCAAAATTCCAAACTTTGGGAATTTCTAGTTTCCAAATTTC 2055094
2055095GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTTTAAACGCCTTGCAATGGTAGAAACATCAGTAGAAGAC 2055158
2055159GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCGCTTTCGACTGCGACAACTGTCGTTTGGCTCATTTGTTGC 2055224
2055225GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTTATTTCAAATACTATTATCTCCGCCATATGTTTACAT 2055287
2055288GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGATTATCTGCAATTTTAGCAACTGAGAGGGCAATAATTT 2055350
2055351GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTTTTTTCTTTAAAAGCTCTAGGCAGTTCATTTCTATTTCA 2055415
2055416GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCATGCCAAATTTGTAATCCCTAGCTTGCTGAACAAAATA 2055479
2055480GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGAGTACTGATAATCTGAAGGTATTGGACTAGAACCCATGAAGTTC 2055548
2055549GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGGCTTTAACTTGGTACGCACTTTACGCCATGATAAACG 2055610
2055611GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGGAATTTTGTGTTACTGCAACGCCAAGATTTTCAAATGTT 2055674
2055675GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGGTTGAATTTTTGCAACTGGTATGTTGTATTTTTGCA 2055735
2055736GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGAATTTGTTACACGGCTAGGATTTTTTTTCCTAGATGTACAAT 2055802
2055803GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTTCTAATCTTTTGCCCATTACTGCATCATATCTACTAG 2055865
2055866GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGATCTTTACCTTTATATAAATCTTGTTCGTAACAAATAA 2055928
2055929GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGACAAAACGAGGAGTTTATAGTAAAATCAACTATGAAA 2055990
2055991GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGATTATTTGAAGAGAGGGTGAGAGAAGCATGAAAAG 2056050
2056051GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGAACTACAACGAGGTGAGAAACGATGACTAAACGTTT 2056111
2056112GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTTTAACCAGCATAACAGCATCTAAAAGAATGGGAATTG 2056174
2056175GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTAGATATATGGCGATGAATTGCATTAGTCAGTGGTG 2056235
2056236GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGATTTTTAACGCTATGACGCTAGCCCTCATGTTAGCTTTT 2056299
2056300GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGAAAGTTTGTTCTTCTGTTTCGTTTTGTTGTTCTGACT 2056361
2056362GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCCCCTTTTGCCGTCTTTTTAGTTACCACAATGCACCAA 2056424
2056425GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCCGTATCCAGAAATAATTAACCAATCGCTTGTTTGTGAC 2056488
2056489GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGAAATTAACGTAAAGAGGGAATTTCTCGCACCTATCAA 2056550
2056551GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGGAATAAACATTGGTACTGTACTTTGTAGTACTGCATACGGTG 2056617
2056618GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGGCATCTGTCGGCAACCTCACTTATTCACGTGGGGGTGCG 2056681
2056682GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTCTCTCAGAAACTCCCAACAAATTTGCTATTTGTTGA 2056743
2056744GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTGCAATTTGTTGAATTGAATAACCTTTTCTAATTAGTTG 2056807
2056808GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTTGAACTTGTAGAAATTGTTCATATGAAACAGCATAATTTTC 2056874
2056875GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTTTACAGTTAATGGAATTCCTTTTTGTGCATACAATAACG 2056939
2056940GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCTCATTATTTCATCATAAAGATTATCCACTGCAATT 2057000
2057001GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGATGCATTCCACCTCTGTTTCTTCCTCTTTACGCATTTCT 2057064
2057065GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCTCTATATTCTACTATCCTCCCTCTCTGCTCTGGCG 2057125
2057126GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGATCTCTGATTTCTCAGTTCTCTAATTCCGAATACTACAT 2057189
2057190GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTAAAACTGCTCAAAAATGCTAGAATTATAATTATGGCTATG 2057255
2057256GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGATTTTGAATGTTACGACTCTCGTCATTTTTCCACCTCTTCT 2057321
2057322GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGGGAGTAATCTTTCCAGTCAAAAGACTTTCAGCCCTC 2057382
2057383GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTTTATAAGCTTCAATAGAGCTTTATCTTGAGCAATC 2057443
2057444GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGATAAATGGTACGTCTTCAGGCGGAAAGCCTTCCATTTGT 2057507
2057508GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGATATTACCTTGCTGGATAAAGTTAATGATTTCAT 2057566
2057567GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGATCTTTAATAAATCCTCCTTTATTCTCATGTAATGCAT 2057629
2057630GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTTATATTACGATAAAAGTGCCAGATATGGTTGTTGGCATT 2057694
2057695GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCCCACCAGAAAAAAAGAAGGGTGGGGGGCAAGGGCCCCGG 2057759
2057760GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGGCATATATTATTGGCTGAGGTAAGGTCGGCATATCTGTCG 2057824
2057825GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCCATCCAAGCCTTGATTTGATATTCCTTTTAATGTCTGC 2057888
2057889GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTTCATTATCCTCAATTTTTTCTATACCCTTGTTGTTCATT 2057953
2057954GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCCCCACTGGAATGCACCATTTCTTGCAAGTAATACATTT 2058017
2058018GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGATGCAGTTTGGCCTAAAGGAATATATACGTTAATGTCTGC 2058082
2058083GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCCATTATTCGGCACTGCATTTAATTGAAGCACTATACT 2058145
2058146GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGAATATTTTGAATATTTGTACACCCATATGAAAAACGCAG 2058209
2058210GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTATCTCTTATTCGTAAGGGTTAAAACAAAATTATCTT 2058271
2058272GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTTTTTATTTAAGAACACTGATGGAAAGATCTATAG 2058331
2058332GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGACCCATATTGAAGAGTTTGAGCATAAAAATGATTCTA 2058393
2058394GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTGATTGCGTTACGTCACCATGGGGCTATTCGTTCTGAT 2058456
2058457GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTTAATGTGAAGAAAATTGTTAAACGCGTTTTGCGACATT 2058520
2058521GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCACTACATCTATTGTTTTTCCTTTTGTAAGACATTCCTCA 2058585
2058586GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCTGTTATTACGTCTCTAATTGCCACGGGCTTAAAAAGCGG 2058650
2058651GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGATCAATTTACGCCTTTTAGAAATCCAATTTCAATTATTC 2058714
2058715GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGGAAGCAATAGCCAACCCACAAAGCTGACACTATTCATTCGTC 2058781
2058782GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGGTATTCAAAAGAGAACTGGGGGATTCAAGGTAATACCT 2058844
2058845GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCTCCGTAAGGCCCCCATACAGTAAAGTAGCAGTTTT 2058905
2058906GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGATAGAAATATAAATCTCAGCAATTCTTGATATATTGT 2058967
2058968GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTCCGTTATCATGTTGACTGGAAATGCGTTTAATAGT 2059028
2059029GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGACCCACAGCACATTGCCATATCCACTAAAATTATACTGA 2059092
2059093GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGATAAATATGTTAACGAATGTTGTAAATTGGTATTCGTT 2059155
2059156GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGAAAGGAATAATAAGCATGAACCGGGGAGTTCACGCTTT 2059218
2059219GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTCAAACTCATGAAGCTACTGTAATCCATTTCACATAAA 2059281
2059282GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGATCATTTCGTGAAATTTTCGCAACAAACGAAAAAAATT 2059344
2059345GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGATTATATTGATAAATTGATAAGAATGCCCGAAAATGATTT 2059409
2059410GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGAAAAACTTTTCACATTCGACATTAAAAAATAAAATAATTTTG 2059476
2059477GATTAATCCCAAAAGAAATTGAAAGAATTCGTATACCTTAGTAGTATTATCATCAATATTGTAT 2059540
2059541GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTTCTCAATTGCCTTTCCCACGATAACCTCAATCCAGTAG 2059604
2059605GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTCTACGTTGTTAAATTCATATACAGCTTGGCTCATAT 2059666
2059667GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGACGTATTTAAATTTTTTGGTAGTACTTTCCTTGTGTAT 2059729
2059730GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGAGTATACAACAATGCAATAAGTGTTGATAGCTTTGCATCTT 2059795
2059796GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCGCTTCTCCGTCTTTTCAGTTATAATGCGTAAAAGCTTAC 2059860
2059861GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCAGCAAGAAGTTCACTCTCTACATCTTATGATTTCGG 2059922
2059923GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCGTTTTCGTCTGGATTATTTATTATCTCTAAGCCCT 2059983
2059984GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGACCTTTATTTTAAGTCCTAGCCTCTTCCCTATCCAT 2060044
2060045GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTTGTTTCACCTCCTTATTAAAAGCGACAGACGGTCGAC 2060107
2060108GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTCATTTCACTGTGTAGAGGTTGAACACCTAATTTTTT 2060169
2060170GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCTTTGATTGTCCGCTCTCGTTCTTTTCCACACTGAAGATG 2060234
2060235GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGAGCTTTATGACACTCATTATCATATACTCAAAATTATA 2060297
2060298GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTCGATTTTTTTCGAGGATGGATTTGTTTCATGAAAGAGCC 2060362
2060363GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCAGCTCGACGATGACGAATACAAGATGCTGTATAATGCG 2060426
2060427GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTTTCTCAACTGATCCACGGCTTCAGAGAAGATGTTTGGAT 2060491
2060492GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGGAACGAACATGGTAAGCCCTGAGGACCTTGAAAACGATG 2060555
2060556GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCTCAGCAGATTTAAACTAACGATATTAATTGTACACACTG 2060620
2060621GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTTAAGTTGTTTTGCTCTATTTAAAACAAAAATAATCCAA 2060684
2060685GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCAAGTGCAATAGCAAACTACTACTAAATATAACATATAT 2060748
2060749GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCTATATGGGGTCAGGGTGGAACTAAAATCGTGGCTTTA 2060811
2060812GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCTTACTTAAGCCTAATATCTCCGCAACTTCATCAATAGT 2060875
2060876GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGGAACTCTCTATTGCTGACGAACTAAGAGAAAATTGTTTCAA 2060941
2060942GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTCTAACAATGAATCTGTCATAAAGTGCCCGCAACTCTT 2061004
2061005GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGAGATTATCAATCAAGTGATAGAGATATTGCAATTTT 2061065
2061066GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTGTTAGATACGGCAAGGCAAAGATTACAAACAAGGATGT 2061129
2061130GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGAAAATGGTGCTTATCGCTATTAGGTAGTCGGCGTTGTTT 2061193
2061194GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGACTACTCTTACTTTTTGCATTCCTTTTGGAGTAGGC 2061254
2061255GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTATTTACGTGCATAAAGAACATACCTCCAGCGCCTCCTC 2061318
2061319GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTCGTAAACTTGAAACTGACCCGTATATCCGAATTTAC 2061380
2061381GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGGTATTATTCTCATAATAGGAACCGCCCTAGTGTATGCTA 2061444
2061445GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGCGTGATTACATGGAACATTACTTTTCCACCGAATATT 2061506
2061507GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTTTATGTTTTCGAGTTCTTCTGGTCTTAACATCACTCTA 2061570
2061571GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGGTCAGTTATACGCTACATATGAAAAGATAAATGAAG 2061631
2061632GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGATCTCTCTTAGTTTTGTCAAAGCTTCTGACCCGCTCCT 2061694
2061695GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTCTATCTTTATTGTTACAACTTTTGCATACGACATAATTT 2061759
2061760GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTCCTCTATCATCTCCTTTAAGCACTGTGTAATCTCACTT 2061823
2061824GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAGTAATACTGCAGTAACGGTACAAGTCATTGACAGCGCT 2061885
2061886GATTAATCCCAAAAGGAATTGAAAG2061910
Left flanking sequence : Till position 2054517 (length bp)
TAATTACAACTAAAATTGGTCGCATGAAGAGTAAAGGGTAGTCATGAAGATTTATAAGTAAGAAAAGAGA
AAGAAAGATAGGAAGTATAAAAACACAACA
Right flanking sequence : From position 2061910 (length bp)
ATATGGTATTCAGTAAATTCATGCTATAGTCAATTTCTTAGTAAGTGCGAAGAGAAATAGCTTTTGTCTA
TACAAAGAATACCAGTTAAATCCCTTAACC
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp