Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_017481_1                                                                                                                 top


Strain : Lactobacillus salivarius CECT 5713 RefSeq :NC_017481 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_017481_1
DR consensus (36 bp) : GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCNumber of repetitions :29
Begin Position : 121320 End Position : 123253

121320GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATTAGGTTAAGACCAGAGGCTAAGGGTGGTAATACTTTTACGCC 121385
121386GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATTAGGTTAAGACCTATCTATCGTATTTATCCGCCTTAGGTTTA 121451
121452GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCCTGCGATACTGTATATACCTTGAGCAACTT 121517
121518GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCAGAAAGCCAAATGAATAGTGGTTGGAATAA 121583
121584GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTCTGATAGCCAGAGAAATGAATATTGTAAA 121649
121650GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCACGTTTGACTAACGTAAGCAAAGTTAAAGC 121715
121716GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCAGTAATGAATAGTTAAGTATAAGCGTTTAT 121781
121782GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTAAGCCCGTTAATAGTGGTGATACACAGCA 121847
121848GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTTATCTCTATGAAGAAATTCAAGCTATTTA 121913
121914GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTGGGTCAATTAACTACAATGTTATGACTAA 121979
121980GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTTCACAAAAAGCTATCAAAGAGACTACTGA 122045
122046GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTAACCGCTAATGTTAGATATGACGAAAGAT 122111
122112GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTTAAAGCAGTTGGCAAGGTTGGAGATGCAA 122177
122178GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCGAAGTTTTACATTATGAAGCCCAAGCAAGG 122243
122244GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCAGCGTATGTTGACGCTTATGATGGTTGGTT 122309
122310GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCAAAATTATATTATAAGGAGTGCGGTTTTGT 122375
122376GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCAAGGCGGTGAGATTAGTTGCAATGGCTAAA 122441
122442GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCACGGTATTAGTGGATCTAGTTCCGCTGGTA 122507
122508GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCAAAGGGCTTGAGAAACAAGTTTGGTCAGAT 122573
122574GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCACAGCAATTTATAAGTTATCTCGCGATTGG 122639
122640GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCCAATTCACACCGCAGTTCAATCAGCTTACG 122705
122706GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTGCTTTACCTTTTAATGTGTCTTTAAGCGA 122771
122772GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCAGAAATCACATACAAGCTGCTATATGTTGG 122837
122838GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTAACGTTGTAGCGTTTCTATACCGGCCAGA 122903
122904GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCCAGATTCCATAATCTTTATCTACGTTCTCT 122969
122970GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCAAATTGATATTTTAACACGCTACCACCATC 123035
123036GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGAATGGTTCTGAGCCTAGTTAGAATGACATAGGT 123101
123102GTTTCAGAAGAATATTAAATTAATTAGATTAATATCTTGACTTTGTCTCCACAGTTATATATTCTAATTTCAGAATATATTAATTKASTRWTTYACCGCTAGTTAAGTDGGTTTTT 123217
123218GTTTCAGAAGAATGTTAAATTAATAGGGTCGAGGCC123253
Left flanking sequence : Till position 121320 (length bp)
AATGGTCAGAGATTCTTTGAAAGCTGTGATAATTACTACATTGATGAGGATTATATTGATTGGTACTAAC
GAATCGTTAAATTTTGATTATAAAGTAACG
Right flanking sequence : From position 123253 (length bp)
TAAAATACAAAAAATATTTCATAATATTTATAAATCTATCAGAAATTTTCTGGTAGATTTTTTTAGTGTA
AAAATTTTTGAGTTTAAGATATATTATGGT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp