CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_017481_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_017481_1                                                                                                                 
top
Strain :
Lactobacillus salivarius CECT 5713
RefSeq :
NC_017481 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017481_1
DR consensus (36 bp) :
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
Number of repetitions :
29
Begin Position :
121320
End Position :
123253
121320
GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATTAGGTTAAGACC
AGAGGCTAAGGGTGGTAATACTTTTACGCC
121385
121386
GTTTCAGAAGGATGTTAAATCAATTAGGTTAAGACC
TATCTATCGTATTTATCCGCCTTAGGTTTA
121451
121452
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
CTGCGATACTGTATATACCTTGAGCAACTT
121517
121518
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
AGAAAGCCAAATGAATAGTGGTTGGAATAA
121583
121584
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
TCTGATAGCCAGAGAAATGAATATTGTAAA
121649
121650
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
ACGTTTGACTAACGTAAGCAAAGTTAAAGC
121715
121716
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
AGTAATGAATAGTTAAGTATAAGCGTTTAT
121781
121782
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
TAAGCCCGTTAATAGTGGTGATACACAGCA
121847
121848
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
TTATCTCTATGAAGAAATTCAAGCTATTTA
121913
121914
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
TGGGTCAATTAACTACAATGTTATGACTAA
121979
121980
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
TTCACAAAAAGCTATCAAAGAGACTACTGA
122045
122046
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
TAACCGCTAATGTTAGATATGACGAAAGAT
122111
122112
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
TTAAAGCAGTTGGCAAGGTTGGAGATGCAA
122177
122178
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
GAAGTTTTACATTATGAAGCCCAAGCAAGG
122243
122244
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
AGCGTATGTTGACGCTTATGATGGTTGGTT
122309
122310
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
AAAATTATATTATAAGGAGTGCGGTTTTGT
122375
122376
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
AAGGCGGTGAGATTAGTTGCAATGGCTAAA
122441
122442
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
ACGGTATTAGTGGATCTAGTTCCGCTGGTA
122507
122508
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
AAAGGGCTTGAGAAACAAGTTTGGTCAGAT
122573
122574
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
ACAGCAATTTATAAGTTATCTCGCGATTGG
122639
122640
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
CAATTCACACCGCAGTTCAATCAGCTTACG
122705
122706
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
TGCTTTACCTTTTAATGTGTCTTTAAGCGA
122771
122772
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
AGAAATCACATACAAGCTGCTATATGTTGG
122837
122838
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
TAACGTTGTAGCGTTTCTATACCGGCCAGA
122903
122904
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
CAGATTCCATAATCTTTATCTACGTTCTCT
122969
122970
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACC
AAATTGATATTTTAACACGCTACCACCATC
123035
123036
GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGAAT
GGTTCTGAGCCTAGTTAGAATGACATAGGT
123101
123102
GTTTCAGAAGAATATTAAATTAATTAGATTAATATC
TTGACTTTGTCTCCACAGTTATATATTCTAATTTCAGAATATATTAATTKASTRWTTYACCGCTAGTTAAGTDGGTTTTT
123217
123218
GTTTCAGAAGAATGTTAAATTAATAGGGTCGAGGCC
123253
Left flanking sequence : Till position 121320 (length
bp)
AATGGTCAGAGATTCTTTGAAAGCTGTGATAATTACTACATTGATGAGGATTATATTGATTGGTACTAAC
GAATCGTTAAATTTTGATTATAAAGTAACG
Right flanking sequence : From position 123253 (length
bp)
TAAAATACAAAAAATATTTCATAATATTTATAAATCTATCAGAAATTTTCTGGTAGATTTTTTTAGTGTA
AAAATTTTTGAGTTTAAGATATATTATGGT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp