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CRISPRs details
NC_017581_1
Flanking alignement tool
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NC_017581_1                                                                                                                 
top
Strain :
Streptococcus thermophilus JIM 8232
RefSeq :
NC_017581 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017581_1
DR consensus (36 bp) :
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
Number of repetitions :
43
Begin Position :
712332
End Position :
715137
712332
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
ATGAGGTCGAGAAGGAAAAACGATATGCAG
712397
712398
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
ATCCTCAATAGCATTGACAAAGTCTTTTCT
712463
712464
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
TCAATCTTCCTGTCTTTGAAATATTTCTTT
712529
712530
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
TTGGAATTTAACGTTTGAAGAACGGAAGAA
712595
712596
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
GTGGTCTTTCGTGGGTGCTGCGCTCTGGTT
712661
712662
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
ACTAAAATCATTTTCAACGAGTTGAGAGAC
712727
712728
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
TATATTCGCGAGGGTGATATAGTCGTGGTG
712793
712794
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
CATATATGATAGTTTGTCAACACCTTTTAT
712859
712860
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
TAAATGGGTTATGCTGTTCAATATGCGTCC
712925
712926
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
AAACTTGCCAGCAATCGGAATGTAAAGGCC
712991
712992
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
TTAGACCCTAAAGAGGTAGAGCGCCATATA
713057
713058
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
AAAAGGTTGGCTAGTGTAATAAGTTCGTCA
713123
713124
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
TACCATTGTTTCTCTCCACCGTGGAAGGTT
713189
713190
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
GGCATTAGACAGATACATTGATAGCCAACT
713255
713256
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
AAGAAGCAGCAAGATGCATCAAACACCGCA
713321
713322
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
TGAAAATCTCACTAGTCCATTAGTGCGGTT
713387
713388
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
ATCACCCAACTTTCTTGTGCTTTCTAAGTG
713453
713454
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
GCTTAGCTGTCCAATCCACAAACGTGGATG
713519
713520
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
GCTAACTTAAGCAAGCAGTACGAAAAGCAG
713585
713586
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
AAAAAAGATGGTATCAATTATCTAGAATTG
713651
713652
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
CTCTTAAGGTCATTTCAGTGTCTTGGTTA
713716
713717
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
ATTGTCTATTACGACAACATGGAAGATAGT
713782
713783
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
TACACTAGTAGTTGTGTCCCAAATTTTAGA
713848
713849
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
ACTAAAATCATTTTCAACGAGTTGAGAGAC
713914
713915
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
TATATTCGCGAGGGTGATATAGTCGTGGTG
713980
713981
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
TAGGGATATGAAGCCCAAATTGTTGCAATG
714046
714047
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
TTTCCCGGTGTATAGATTGGCTCTATAGTCT
714113
714114
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
TATATATAAGTTTCCGAAAGTAGACGAACC
714179
714180
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
CATTATTAAACCCATGCTTTTTACCACACT
714245
714246
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
CATTATTAAACCCATGCTTTTTACCACACT
714311
714312
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
AGCCGATAGTTAAATCAACTGATTGTGGAT
714377
714378
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
CGTGCTACAAATCTCTTTACGACAATTTAG
714443
714444
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
TTTTTTTGATACATTTAAGGGCGCTTTCAT
714509
714510
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
ACGAGAGTCTTTCAGTCTATCCATTGCCTG
714575
714576
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
CATTTTCCGTTTTTTTTGTCTCTACCCCAT
714641
714642
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
AGCTGTGATAACACGAAGAGAACTCTAGA
714706
714707
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
AAACATTGATGAGTATTATTGAAAAACTTCA
714773
714774
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
GGGTCAAGGTATAAGATAGAGTTTTCTATA
714839
714840
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
TAGGTACTTTAACCTGACCAGATACAATC
714904
714905
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
CCTCAAAGCTTAAAATTGGGCTGAAGTAGA
714970
714971
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
AGGTTGTAACAAAAAAGATGCTAACAAGA
715035
715036
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAAC
TAATGCTACATCTCAAAGGATGATCCCAGA
715101
715102
GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAGT
715137
Left flanking sequence : Till position 712332 (length
bp)
AAGGAACTATTACATAAATTTTTAGAAAGTAATGATTGACAAGGACAGTTATTGATTTTATAATCACTAT
GTGGGTATGAAAATCTCAAAAATCATTTGA
Right flanking sequence : From position 715137 (length
bp)
TTGAGTCAACATAAAAAGCCAGTTCAATTGAACTTGGCTTTTTAAAATACACGATAAACATAAGGATTGT
CAGGCTGACTAACCTCTTTAACCTCAGTCA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp