Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_017595_3                                                                                                                 top


Strain : Streptococcus salivarius JIM8777 RefSeq :NC_017595 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_017595_3
DR consensus (36 bp) : GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACNumber of repetitions :27
Begin Position : 713943 End Position : 715692

713943GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACAGACACATAGAATACATGGTAGTTATTGTC 714008
714009GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACCTGCCGCAAATTTATTTTGTTCTAAAACCT 714074
714075GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTTCACAGAGCAATTTCAATCAGGCAGTCGG 714140
714141GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACAAATCCGTCATCATCTGCCTCTAGGTTTAA 714206
714207GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTTAGTACCATTTTAAATGCGTATATAATAG 714272
714273GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTCATCTTCAATCAATGGTCGAGGGGATTTC 714338
714339GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACCTAGCGAAAATTTCTTGGTTTGTCTCTGTTC 714405
714406GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACAAAGAATTTTTGGTCACGTATCAGCACTTA 714471
714472GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTTGCCAGAATTGCACATCCCAGAGGAACCA 714537
714538GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACACTAAATCAAAATCAATACTATTTAACTCT 714603
714604GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACATTCGTGTCATTCTCAATGAGTTGCGATAC 714669
714670GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTGCCATATCAAGTTTTATTCCGTAAAACTC 714735
714736GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACGCAACAAGGTTTAAATACGACGAATTACAA 714801
714802GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACAAGCTGTGTGATTTGGACTTGATGAAGTTT 714867
714868GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACCCGACGCTACGTTTTGAAGCTAAACGTACG 714933
714934GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTAGGCGACTGTGTTCCGAATATTGCGAAG 714998
714999GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACGTTATCTGTATTGAGGTGAATATTCCCCCA 715064
715065GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACGACGCTGTAGACAGTTCTAATACCAACACC 715130
715131GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACAATGCGTGCAGGGAAACAAACAATTGATAT 715196
715197GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACATATACATGACTTCAGTACCCGAACTGAAC 715262
715263GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACAAGTATTTCTGAAAGCGTGAGAACGTCTCT 715328
715329GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTGATTTAAGTTTTTGGAAGTCGTCTTGACC 715394
715395GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTCAGACGCTTCACCGTCTCCCACTTCAATT 715460
715461GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACCAAGGCTTTATGCCTGCAAGCAGATATAG 715525
715526GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTCAGACGCTTCACCGTCTCCCACTTCAATT 715591
715592GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTTTGTTGGCGCAATTGACTTTTTCCAAGG 715656
715657TTTTTTGTACTCTTAAGATTTAAGTAACTGTACAGT715692
Left flanking sequence : Till position 713943 (length bp)
AAAACTTTTACAGAAATTTTTAGAAAGTAAGAATTGACAATGACAGTTATTGATTTTATAATCACTATGT
GGGTATAAAAACGTCAAAATTTCATTTGAG
Right flanking sequence : From position 715692 (length bp)
TTGATTCAACTTAAAAAGCCAGTTCAACTGAACTTGGCTTTTTAAAATACGCGATAAACATAGGGATTGT
CAGGCTGACCGACCTCTTTAACCTCAGTCA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp