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CRISPRs details
NC_017992_1
Flanking alignement tool
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NC_017992_1                                                                                                                 
top
Strain :
Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485
RefSeq :
NC_017992 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_017992_1
DR consensus (30 bp) :
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
Number of repetitions :
56
Begin Position :
421904
End Position :
425590
421904
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
AGCAGATTTACCTTCTTTATTAAGATTTCTAATCCA
421969
421970
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTAGAAAAACTCAAGAATATGGAGGTGAAATAAAAA
422035
422036
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GCAGAAAATTCACTACCAATATTAACATTATTATGAA
422102
422103
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTGCCATACACTTTATAACCGAATTTGTTTATAAG
422167
422168
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TGGAGGTGCTTAAGATGGAATATTGGCTAAGTTTCAA
422234
422235
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CCGTATTGTTTTGTGCTACGAATAATGTCATATTTG
422300
422301
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
ATGATGTCAATAAACCTTTCATAGCAATTTATCCAAA
422367
422368
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTTAAGAGAATGGATAAACATATTAGGCAAACCAT
422432
422433
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
AAAATTAGTAAAGGCAAAAGGCAGCATAGATAAAACAA
422500
422501
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CCAAGGTGCAGAGGATATATGGAATAGCTTGATTAAC
422567
422568
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TGGTCCAAGTATTGCAAATTCAATAAATTTTGTAAT
422633
422634
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
AATATGATATGTACTTTGTGAAATTACAAAATACAAG
422700
422701
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GAGTAATATTTGAACCATTTATTGCTGTAACTTTACCA
422768
422769
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TGTTCAAGAATTATATTTGCTTTCTCATCCATAGTCA
422835
422836
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
ACCCAATGAATAGTTGGGATAAAGCAGATAGTACATT
422902
422903
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
ACATCCCAAGGCAAACTAAAAGGAAACTTCTCAGTCAA
422970
422971
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TATGTTATTATATATATAGAGTTAAGGAAAGGAGTTAT
423038
423039
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CAGGTTAAGCCTGCTTTATTTTTTTGTTTATTTT
423102
423103
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TAACCTTATAAATTTTTGACTTTCCCAAATATCTAA
423168
423169
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTTTTCTTTTTTTATACTTTTGCTTATTTATTTCTTT
423235
423236
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TAATTTTAATTTAACTTAATTGTTTTAATTGCATTA
423301
423302
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CAAGGAAACTGCTTAAGCGAGGCAAAGCAAAAATAG
423367
423368
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TCTCAATTTCCGATATTGGTTAGCGATAGCATCCCAA
423434
423435
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CGTCGTCACTTGTGTTATATCAGGATAATTAAGCG
423499
423500
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTCTCTGGAACTAAATTTCCGCACTGTCTACAAAT
423564
423565
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
AGTTGTTGTTGTGTCACTCCTTGTTTTGTTTTAAGC
423630
423631
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
AAACTTCAAAAACGTGATAAATTAGCAAAGAAATTAAA
423698
423699
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
ATATCTGTTGCAAGGCCTTGAACTGCTTTTTGCACT
423764
423765
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
AGACAAGAAGTTTAATGTAGACAATACGCAAAGTCCTT
423832
423833
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TCAGGCAGCAGACGCAGTTGTTACAGTTCCTCATAAA
423899
423900
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CCTTTATTATAAAAAATAGCACAGGTCAAATAATGT
423965
423966
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TACAAATGATGAATTTAATACAAGAATAGAACTTGT
424031
424032
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TCTAAATTGTCATACAATTCATTAAATTTATATTTT
424097
424098
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
AAGACTAGTTGAAACTACAAACGAAGTAGGAGAAA
424162
424163
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
ATGCTTTTAAAGAAATTGCCATTGACCTTGATAATGT
424229
424230
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TGGTAAATTATACCTTCTACATCTGGGACATTTTCAT
424296
424297
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CGTCTGTATCCCTGCAAACTGAGAATTCCAGTCTA
424361
424362
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
ATTCCAACAATTCATATTCTCCTCCACTTTAATATAT
424428
424429
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GAATACTTCGCTTACTCCGGGTACTTGATATTTCG
424493
424494
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
ACAATGAGGAATTTGGAGAATATATAGCATTTGTAGT
424560
424561
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
CCAAATTATGCTCAAAAAATTGTAAGTGTCTATGATTCCA
424630
424631
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TAGATATGTTATTGCTAATTTTCCTATAAAGTATTC
424696
424697
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GCTAACTGAACAACAGCAGGAAATTCACTACCAATAT
424763
424764
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GAAGAAATATTAAAAGAATCACTTTCAAAAACATTTAT
424831
424832
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GCAAAATTAGGATTTATTAGCGAAAGATTGTAAGCTT
424898
424899
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
ATAGTAGGCTCGGCGCAAAGCCGAGCTTTATTAGGT
424964
424965
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
AAAAACATGGAAGCTTGCTCAAGAATACCTTTCTAA
425030
425031
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GTTCCATCCAATTTATTATATTTTACAAGATATGTA
425096
425097
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
ATATTGGCAGATAATGTACAAACATCGATAAAAAGC
425162
425163
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GGTATTTTAGCTCCTTTGGCATTATACAGAGGTCCAC
425229
425230
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
ATTGCAGATGCAGATAAAGAAATTGTAAAAGAGGAT
425295
425296
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
GATGCAAATAATAAAAAAGTTTCAAAATATATAAAA
425361
425362
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TCTGTATTATGCATGGCTTTGTATCTTGAAAATAA
425426
425427
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TCGAATATTTTAAATTCGTAAAAGTCATTTAATTGTT
425493
425494
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
TTGAGGTGAAATAAATGCCAAAGCCAAAGGGTTGGAG
425560
425561
GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC
425590
Left flanking sequence : Till position 421904 (length
bp)
TTATATACGGTACAGCATATACATTTACGAATAAAAACAATACAATTATACTGATAGATACCATTAATTT
GTATTTATTTCTAAACATAAGAATCCCTCC
Right flanking sequence : From position 425590 (length
bp)
GCGTTAGAGCACAGAAAATTCAACACTTTTATCTTGCATAAAAGGTGTCTTTTGTAAAGCTTATGCCTTT
ATTATACCACAAATTGCCGAAAATTCAACT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp