Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_017992_1                                                                                                                 top


Strain : Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 RefSeq :NC_017992 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_017992_1
DR consensus (30 bp) : GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACNumber of repetitions :56
Begin Position : 421904 End Position : 425590

421904GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACAGCAGATTTACCTTCTTTATTAAGATTTCTAATCCA 421969
421970GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTTAGAAAAACTCAAGAATATGGAGGTGAAATAAAAA 422035
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422368GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTTTAAGAGAATGGATAAACATATTAGGCAAACCAT 422432
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423900GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCCTTTATTATAAAAAATAGCACAGGTCAAATAATGT 423965
423966GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTACAAATGATGAATTTAATACAAGAATAGAACTTGT 424031
424032GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTCTAAATTGTCATACAATTCATTAAATTTATATTTT 424097
424098GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACAAGACTAGTTGAAACTACAAACGAAGTAGGAGAAA 424162
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424297GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACCGTCTGTATCCCTGCAAACTGAGAATTCCAGTCTA 424361
424362GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACATTCCAACAATTCATATTCTCCTCCACTTTAATATAT 424428
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424494GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACACAATGAGGAATTTGGAGAATATATAGCATTTGTAGT 424560
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424631GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTAGATATGTTATTGCTAATTTTCCTATAAAGTATTC 424696
424697GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGCTAACTGAACAACAGCAGGAAATTCACTACCAATAT 424763
424764GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGAAGAAATATTAAAAGAATCACTTTCAAAAACATTTAT 424831
424832GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGCAAAATTAGGATTTATTAGCGAAAGATTGTAAGCTT 424898
424899GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACATAGTAGGCTCGGCGCAAAGCCGAGCTTTATTAGGT 424964
424965GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACAAAAACATGGAAGCTTGCTCAAGAATACCTTTCTAA 425030
425031GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGTTCCATCCAATTTATTATATTTTACAAGATATGTA 425096
425097GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACATATTGGCAGATAATGTACAAACATCGATAAAAAGC 425162
425163GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGGTATTTTAGCTCCTTTGGCATTATACAGAGGTCCAC 425229
425230GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACATTGCAGATGCAGATAAAGAAATTGTAAAAGAGGAT 425295
425296GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACGATGCAAATAATAAAAAAGTTTCAAAATATATAAAA 425361
425362GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTCTGTATTATGCATGGCTTTGTATCTTGAAAATAA 425426
425427GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTCGAATATTTTAAATTCGTAAAAGTCATTTAATTGTT 425493
425494GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAACTTGAGGTGAAATAAATGCCAAAGCCAAAGGGTTGGAG 425560
425561GTTTCAATTCCTTATAGGTAGGCTAAAAAC425590
Left flanking sequence : Till position 421904 (length bp)
TTATATACGGTACAGCATATACATTTACGAATAAAAACAATACAATTATACTGATAGATACCATTAATTT
GTATTTATTTCTAAACATAAGAATCCCTCC
Right flanking sequence : From position 425590 (length bp)
GCGTTAGAGCACAGAAAATTCAACACTTTTATCTTGCATAAAAGGTGTCTTTTGTAAAGCTTATGCCTTT
ATTATACCACAAATTGCCGAAAATTCAACT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp