Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_018521_2                                                                                                                 top


Strain : Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168-BN148 RefSeq :NC_018521 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_018521_2
DR consensus (36 bp) : GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATNumber of repetitions :5
Begin Position : 1455125 End Position : 1455424

1455125ATTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATTATGGCAGTTTTTAAAAGAGCTTGGCGGTT 1455190
1455191GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATTTTCCAAAGTTTCATTAGTTGAATTTAACT 1455256
1455257GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATCTACAAGAATGAGGATGATGATATTTTACA 1455322
1455323GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATATGAGTGTGCTAAAAAAAATGGACTTAAAT 1455388
1455389GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT1455424
Left flanking sequence : Till position 1455125 (length bp)
TTTCGATTTTAATCAACCCTAAATTTCAATAAGTTTCAAATTCGCAACCTCCTTTTAGTGGAGTAATTAG
CCCTAGTGGAGTTTCAATCCACTAGGGTTT
Right flanking sequence : From position 1455424 (length bp)
AGATATTTACCAGATAATGAAAATTTCGGGGTTTTTTCATGAAAAATAGCAAAAATTATGCTATAATCTC
ATAAGAAATTTAAAAAGGGACTAAAATAAA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp