Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_020246_1                                                                                                                 top


Strain : Sulfolobus acidocaldarius N8 RefSeq :NC_020246 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_020246_1
DR consensus (24 bp) : GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACNumber of repetitions :133
Begin Position : 1650673 End Position : 1658598

1650673GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATCATTGGAATTGGGCTAGCCCTATTTTTCTTGATA 1650732
1650733GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGTTGGTAGTGGGCAGATATCTAGCCCTGACCACT 1650791
1650792GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTGATGTCGAATACCGGAGTCAAGATGTTGATGAAAA 1650851
1650852GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAATAACGAAGATTTAAGTGGTTTTGAACCAAGAGAA 1650912
1650913GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTGATCACATGTTTTATCGGTAGTACATAATGTAGAAA 1650973
1650974GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGAGGAGTTTGATAAACTTTTGGAATTTCTTGAGAG 1651032
1651033GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGAAATATAGCAAGAGTTCTGTGGTCGCTATATTA 1651090
1651091GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATCATTAGCACGATATTTCATCATCACTGCAGTAATC 1651151
1651152GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCTCAAAAATATAATGCGTAAGCTTAAATACCCAAC 1651210
1651211GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTTTTATTCTATATTTGAATAAAGCATAAAGTAATC 1651270
1651271GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCTAATATTAATGGCAGTAGAAGTCTCGAACAACAC 1651329
1651330GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTATCTCGCAATAAATGAGAGAGAGTCGGCGAGTGT 1651388
1651389GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTATGTTTGTTGTATTGCTAGCGTAATATTGTATTACA 1651449
1651450GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACACACAATATCTTAGTCATTACTGGAATGACTACAAC 1651509
1651510GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATCATTAGCACGATATTTCATCATCACTGCAGTAATC 1651570
1651571GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTGTAGTAAATTGATATAATCGGATTGAAGAGAGTG 1651629
1651630GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGGGATATCTGGAAGTAATACACCAGTACTATAC 1651687
1651688GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGCCATTCAACTCAAAACTTATAGAAGATTACGAAATA 1651748
1651749GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCCAAATGCTAAAAATAGAAAAGGTAGGAGAGTTATTA 1651809
1651810GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCGGTCTTCCAAAATTACTTAATGCTCTTGATAATAAA 1651870
1651871GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTGCTAAGGCTAATTTTGATCGATAAAGATGAAGAAGAAAG 1651931
1651932GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTATCTAACCCTCTCTTTTTCAACTCTTTGAAGATAAAA 1651993
1651994GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCCTCCCTGATATTCACCTTCTCCATTTCCTGTAGCAA 1652054
1652055GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACACCAACTCTCAATTACTCATAATATTCAAACTAAAT 1652114
1652115GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATTCCGACTTGCTTAAATTCAGCTTTTTTGTACAA 1652173
1652174GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACACAGTAGTAGCTCCGGCTGTCATTCCTAATAATAT 1652232
1652233GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAATGATATAAAAAATGAACAACAGAATATAAAA 1652290
1652291GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAACAAGAATTGATGAAGTATTCAAAAGAGCGATATGAA 1652352
1652353GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCTTTCAGAGGGCGAGATCGCAGAGTACTTGAGAATAGCG 1652415
1652416GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATTTCTGCAAATGTATAATACATCAATTTTATAAT 1652474
1652475GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGCATCAGCAATTATGGAAGTCGCTAGATATTACTA 1652533
1652534GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGGAATGTGTACAACAGCTATAAAAAAAGAAAGAATTGT 1652596
1652597GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTTGGAATATCTTGCGAGGCGAGGGTGAGTGAACCT 1652656
1652657GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAATAAAAGGAGATTTCATAGACTCTATTCTCAAAA 1652715
1652716GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTGTTCTAGAAGTGGCGCATTAAACGGCAGTTTTTG 1652775
1652776GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGAGAGACAAAATTTCCAAGTAAGTGACTCTGAAAATT 1652836
1652837GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAATATACGCTGCATAATATACGCTCTCTTACGCTAAG 1652897
1652898GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGAGTGGCATACCTTATTTGTTTTGTTGAGTTATGAAG 1652959
1652960GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTCCATTTTCTTCATAAGTAGCATCTCTCAACAAT 1653018
1653019GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATAACAATTGTCGGTAACTTATTTAGACGCTTA 1653075
1653076GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTTGATACGATTACAATAAAGTTCACTTAAAGTAGAC 1653136
1653137GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAAGTCTATTTTTATTTTATCTTTATCTATCAGC 1653194
1653195GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATTGGATAGTCAGTACCAAAAGGTACATTAAGCCACT 1653255
1653256GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATCATTAATAGAATACGAAAAGCTAAAAGCAAAAAA 1653315
1653316GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATGTAGATAACATCACTATATTGATAAAGAGACTCGT 1653376
1653377GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAAATCATTGAACTATAATGTAGATCTTGCAGTA 1653434
1653435GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTTCCAGCCCAGCCTCTTTGCAGCTTCTAGCCTAT 1653493
1653494GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATCTAGTGAGACAAAAAGAACCTCAGTCTCAGAGTT 1653553
1653554GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTCCTTATACACATCAAGTAACACAGGCGAGTTCATC 1653614
1653615GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTGCGGGATACTACTTCGCCCCAAGTTCTGTAAAGAC 1653674
1653675GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTGGTGAACTGGTACAGATACATCCTTATGAAGAA 1653732
1653733GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCCATTACTGGACAAAGACTATGTCATCACAGCTGGTG 1653793
1653794GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTAACACTGGTTGAATTCGCAAGGAAAGTGATAGGT 1653853
1653854GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGATATTTAGCGTTAAAACTGCAGGAGACAGGGGCAC 1653914
1653915GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAGTTTTTGATATCTGTCCCTGCAGTGTCTAGTG 1653972
1653973GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCTTCATACTCATACCAATTGTAAGTGTTTCCTTGTGTTGA 1654036
1654037GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTCTTGGAAAGACCTTAAAAAAAGGATTGATTTATT 1654095
1654096GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTCGCATGCCTTAAATCGATCGTTTTCTCTACATCT 1654154
1654155GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTACGCTCCATGCCCAGCTGTGCTCTCATCAACACATAG 1654216
1654217GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGCGAGAAAGACTTCTACTGGGGCGCCGAATTTAAC 1654275
1654276GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATCGCTGAGATCCTAGCGACTTTCTACCTGCCCGAT 1654335
1654336GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCGCTAAAGAACGCCCTAAGGGAAGCCTTCAAATA 1654393
1654394GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTATCGCCTCACGCCATCTCTTTGGCGTGGTATAAT 1654452
1654453GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAGTCGCAAAAGAACTGCTAGACAAATTTGACAGTGAA 1654514
1654515GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTGACTTATTTTTTGTCTTAACTTCACTACTCATTTTCT 1654576
1654577GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAAGAACTCATTATCTTTAAGGACAAAGTCAGGGGT 1654636
1654637GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTCCCCTGCGGATACTTCTGCCTCAATTTGGTCACA 1654696
1654697GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAACCTTTTCAGAGGCTTACCTCATCAATGTGGAA 1654755
1654756GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAAGAAAAAGAAAAGGCGGGGGCGAGGGCATGGA 1654813
1654814GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTCTGTGTAACGTATCAGCAATGCGCTTTGTTATAT 1654872
1654873GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGCGGATTTCCACTGTTTCCAGCCTGAGCTTGGGC 1654930
1654931GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGCAAATTTTTAACAAATGTATTCCATTCTTGAAGT 1654990
1654991GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAATTTTATAATGTCTGTAAAACTAAAACATTGTTTT 1655050
1655051GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAGGGATCTAGCCTGGCTAGAGAGCTTGCCGCTTTAATTAA 1655115
1655116GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATGGGTGCACCACCAGAAGTAGTAGAAGAGGTCGAG 1655175
1655176GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTGTATTGCCCACAATGTCCCGTTTTCGTTGTACAGG 1655235
1655236GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCAAGAGAAAGGAGCTAGGAAGAGGATCTTTTCCCT 1655294
1655295GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATTAGGACTCGAAAAATTTATATAAAAAAAGACATT 1655354
1655355GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTCTCATCAACATTTGCTGTACAAATTTCATAATCAT 1655415
1655416GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACACCAGTCTTACTCAACAAGTCAGCCCTTACTTATAAT 1655476
1655477GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCTCAGTCAGATACGTCTTCTTTAGCTGGCTTATGT 1655535
1655536GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATCGAGTGGAAGGCGTTAGACCCAGTAGCTGCCGC 1655594
1655595GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGCCTGGATCTGAAGAAACATAACCATGAGATAT 1655652
1655653GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGGTCAGGAATATAGATTATTCGTACTTTGCTAT 1655710
1655711GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAGTCTTCAGAAAATCATCAACACGCATATACTG 1655768
1655769GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTTGATTAAAATGGGTTGGTATGGCATAAAAAAT 1655826
1655827GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATCGGAATTATAGGCGGATTTTTAACAATATTCCTAACAT 1655890
1655891GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGGAGACAAAGTTTGTCTGTGCAATATATCCCAA 1655947
1655948GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGAAAGAGGAACATAAGGTCTAGATCTTACCCAA 1656005
1656006GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTAATTCATCTTTATAGTGTAACTTTTTGAAATAAA 1656064
1656065GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAACTAAGAAAAATTCAGTCAGCAGTATTAACTACTACTA 1656127
1656128GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTACACCAGTGAGAATGTCTTCCCGAAACTACAAGAA 1656187
1656188GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAATTGGCAACTAAGAAGTTTGTACAAATAACATAA 1656246
1656247GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGAATAGGGGATGCGATAAACCAGTTAGCACAACAA 1656305
1656306GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGGCATATAGAATTTTTCGCTTTGTTGCCTCTTTAA 1656364
1656365GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATTCAATTTTTTTCGTTTTGTCGGTGAAAATAAAA 1656423
1656424GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGCTTGTGGTAACTATTCCATCGTCATCAGCAATC 1656481
1656482GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAACGCATTATTGCTAATGCACGGTGCTAACAATCTAG 1656542
1656543GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGTTTAAAACGGTAAATAGATAAAACCAAGAAAATG 1656601
1656602GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACACGTCTTGTGCTGACTTGTAAACATCGCTGTTCTT 1656660
1656661GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAAGAAGTGCAAAAAAATGGCTACGGTGTACATT 1656718
1656719GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATGCATTCATTAAAGACTTAACAATTCAAGAGTT 1656776
1656777GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAGTTTCTTAATTTATTACAGTTATATGAACAGC 1656834
1656835GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACACAATAGCCCGCAAATGTCAGTATCATCACGTTGTT 1656894
1656895GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGATTTTATGAAACATTAACTATTTATTTTATCTAT 1656954
1656955GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATTAATCAGATAGAAACTAGCAGTGTTTTTTATGTT 1657014
1657015GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACACCTTCACTTATTGAAGATGGGGCTGAAACAACTTT 1657074
1657075GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTGGTTACTGATATTTTCTGAACTCCAGCAAATGT 1657133
1657134GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCGTTAAACAGACTAGGCTCAGGACAAGCATTCACT 1657192
1657193GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGCCCAAATCTGTTATCTCTTTAGAATGAAATTTT 1657251
1657252GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGAGTACCTTTACCTAACCAGAGCGTCGTATATTAT 1657311
1657312GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTGTAGTCTTGCGCAATACCTGCGCTCTTTAGCAGT 1657370
1657371GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGAAGCTATACAACGAGGCTATATAAATAAAATG 1657428
1657429GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGTGAAGATGTCGATAGTGACGATAGCTGAGATAGT 1657487
1657488GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAAGTAAGCCCGATAGTCCTTAGGTCAGGATCCCTTTA 1657549
1657550GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTATATTTGGTCAAGTGTTTCTACAGCATTTTAAT 1657607
1657608GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGCAGAGTCTTTCGCTACGTCTTTCAGCGTCTCAAA 1657666
1657667GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGATCACAGTAATGCGTTATATAAAAAGGCAGAATTCA 1657727
1657728GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCTTTGATCAATTACTAAATTCTGTAATTGTGCCTCTA 1657788
1657789GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGTAGAAAGTCATAACCCAAAACTTCATTTTTTTGTT 1657848
1657849GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACACAGGCTGTACCAAGCTGTTAGCGATGTAGTTAAT 1657907
1657908GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGCTCCCATTAAAATCACGACCACTCCAAATATCA 1657966
1657967GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGTTATAATCTATCTCCGGAACATTAAAATATTTTA 1658026
1658027GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATAGTTGGTGGGACGGAATGGAGAAACAGCTAAAA 1658085
1658086GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTATAAAAAAGCATTTGCACAGTCTTGGAAACCACTATTT 1658148
1658149GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATGCTCGCCCACCAGCACACCGGACAGATCGACATA 1658208
1658209GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAACTGAAGGAACCTTGTAGAGCGGTATGCTTTGCTTCTTCTC 1658274
1658275GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAACTGGAGCAACGTATTGTTGAATATAGCCCCTATGA 1658335
1658336GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAATGAGATATTCACTGAGGTCATGGAGCGTGAAA 1658393
1658394GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTTCCTTATTTTTTAACGAGGGAAATGGTCAGGCTAAAA 1658456
1658457GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTACGGTAAACTGGGGAGTTAACTCAGCATCCA 1658512
1658513GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCTTTCGCATACTTCCTCGCCCTCCTTGAGATATTTTCT 1658574
1658575GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTAC1658598
Left flanking sequence : Till position 1650673 (length bp)
ACCACACAAGGGACACGTTATAACCCTACATAAGCGATAACATTTGGGACGTAAAATTTTGCTTCAAAAT
TAATATATGTGTCATGATATTTTACATGGA
Right flanking sequence : From position 1658598 (length bp)
TGATCCTTGCCTCCATCAATTTTACATTCTTATTTCCTGGTTTATAAATATTTTCTCTCCTTCATTGTCA
ATTTTGTGCCCTTAGGTACGGAAGGGAGTT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp