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CRISPRs details
NC_022084_5
Flanking alignement tool
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NC_022084_5                                                                                                                 
top
Strain :
Thermococcus litoralis DSM 5473
RefSeq :
NC_022084 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_022084_5
DR consensus (30 bp) :
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
Number of repetitions :
47
Begin Position :
861993
End Position :
865173
861993
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
TTGCCGTAATACATCCTTATGTTTGCGCTCCCGTTCCCTTGGATAA
862068
862069
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
GCGAAAGCGTTATTAAGATGTAGTGTCTTACCCTTCAT
862136
862137
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
GACAAAGTTTAGGGACACGGGAACAGTAGATATAATGGT
862205
862206
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
AGCATGGGTAAAGTCTGGAGTTGTAAAATACAAACAA
862272
862273
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
GCTTCAATTGTTATATCATCTTTTGAGCATGAAATTGA
862340
862341
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
TTGTTCTGGGCTTATCTTGTCAGTGACAAACTCCCAGAT
862409
862410
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
AGCATTAATGTACCACCCGGAGTAACGGAGTCAAAGAG
862477
862478
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
TCAAAAGTCTTAAACAATTATTTACCTATTCAATTTT
862544
862545
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
ACGCTGAAAGCGACATTCGCACGTGCAGACGGGCAATATT
862614
862615
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
AGGTGGTTTCGTCCCGATATCGTACACTTTCGACTAC
862681
862682
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
TCCGAGTTTTTCTGCAACAATAAGTGTAGTCCCAGCCC
862749
862750
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
TGGGAGGTTAAACATAGCAGGGACAAACTTTGATATT
862816
862817
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
CTTCCAGCCATCCTGAGTTTCAACAAAATCAAAAACTTT
862885
862886
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
TCCCGCTAAGGGACAGTTACCAGTACGAAATCTACTTG
862953
862954
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
GTACATTAATGCTGTTTGTTTCTGTACTGCTTGTATTTA
863022
863023
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
TTAGGGGAGATACGGATAGGGTGTTCGCCGAGTTTA
863088
863089
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
ATAGTCGAATATGAGGGATACCAAGTTGGAGCTATTGCTTC
863159
863160
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
CCTTTATCGTCAAATACGGGCGTATTCCTATAAAATC
863226
863227
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
CCAGAGTTCAGCAACAATTATCGATGAGTTCAAGCTC
863293
863294
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
TACGAAAGACACTTTAGCACAGCTTTTAATATAACCGA
863361
863362
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
TTAGTTGCGCTCACGTTCAAGGTGATGGTCTCGTTGTA
863429
863430
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
CTCGAAGTGATCAAGAAGTTGAAAGTGCGCTATGCAA
863496
863497
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
CGCTAACCACTACGTAAACTCTTGATGGTTCTACTGAT
863564
863565
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
GAAATAGCCCATACGGCTAAACCAAAAACGGAAACTGT
863632
863633
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
GGAATTCCTAAAAATCCGCGACCACCAAAAGGTAAATGAA
863702
863703
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
CTCTAAATTAAGCGTTTTGTCTGGGGGGGTTTTAGAAA
863770
863771
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
TTCAAGAAAAACGGAAATAACTACGATATTTATATAAA
863838
863839
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
TCACTACCAGCTGGTTATTCTCAAATAACCGGGTTTTAT
863907
863908
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
GTTTCGGGGTTCATTATGTCCCTTAGCTTAAAGTATAGC
863976
863977
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
GTCCGAGCTTAACGCATGGGCTAAAGCACTAGAAAAGA
864044
864045
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
ATACGGGGGCGGGTACGAATGAGCGAAAAGCTAGCGAA
864112
864113
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
AAACCTTGAAGGTTTTCGGGCTTATCGGCCGTTCTGG
864179
864180
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
TTACCACCTAGAGAAATAGCCGAAGAAAGAAAAGAATA
864247
864248
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
ACGATTCCTTGGGCTTTTAATTCGTGTTCGAAAATTCTA
864316
864317
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
CATTTATTAAAGTCTACGGCGCGGATAGGGTTACAATAG
864385
864386
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
TTGAAAGCCGGTATATAGAGACGGTTAGGGTCATCCGGGGCG
864457
864458
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
ACTACCCCCAATTATTTAATTAAAGGAGATGGTGATAAA
864526
864527
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
CGGACTTAGACGGTGAACGCGTCCCTTTAGACCG
864590
864591
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
TTTCTGCACGGTTTAACACCTTTTCGAAGGCCTTAATAG
864659
864660
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
TAACGAAGCGAATACTACAAAATAAGCCGTACCATTTTCTAGCGA
864734
864735
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
CGGTGTTTATGGCTTTAGCTAGGCCGTCGACGATATTA
864802
864803
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
ATAACACTTGGGTTCATACTAACATTTCATGAAGCAG
864869
864870
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
GTTGAAGACTTTGTTGATGTAGTGCTTGCTGTTTGTT
864936
864937
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
ATTGGGAAGCTCTACTTAGGTCGCACTAGATTTATTTG
865004
865005
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
GGGCGCCGAAGGCGCCCACTTTGTTGATTTTCCCCTAAAGCGT
865077
865078
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
TCTTCGATGATTTAAAATCAGTTTTTCATTTTATTT
865143
865144
CTTTCAATTCTTTTAAAGTCTTATTGGAAC
865173
Left flanking sequence : Till position 861993 (length
bp)
TCCTCCTCAGAGTCAAATACTGTTTAAATAACAGGGGGTGAAACTAAACACGCCCTTGGAACAATTTCAA
GAGTTTTGACAATTTGCCCACCATAATAAT
Right flanking sequence : From position 865173 (length
bp)
AGGGACGAATTTTCCTCTAAACTCCCTATAAAGTAATTAGAGAGCTTGAAATTTATAAGCCTTTCCACAA
AGGGTCAATAAAACAGCCATAAGAAGGCTC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp