CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_AHJO01000001_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_AHJO01000001_1                                                                                                                 
top
Strain :
Sulfolobus islandicus M.16.23 GCF_000245175
RefSeq :
NZ_AHJO01000001 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_AHJO01000001_1
DR consensus (25 bp) :
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
Number of repetitions :
62
Begin Position :
858006
End Position :
861905
858006
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTACTTTCTTCTCCACTATCTCCCATATGTCACGCTTC
858068
858069
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
ACAATAAGATAGAAGGGTCTCTCGCGATAACTCTGTAGT
858132
858133
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTCAGTAAGTAAGTTCGATTTTACTTATCGCCCATC
858193
858194
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
ATAGATATGATGAGATGGCAAACAATGTATACTAGGAAA
858257
858258
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
CTGACTGGTATCAAAGATAACGCTTTCTTAGGGTTCGTA
858321
858322
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
GCAGTTAGGAAAACCACCAGATTTGGCTAGTTATATAGCCCAG
858389
858390
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
ACAATACCATGTGCAGAATCAATAAACAATATGCTGT
858451
858452
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
ACTTGTATATCAGATATCATGTCTACTAACGGCAAATT
858514
858515
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TATCATCATTCTCCTTGATAAACCAGTCTCACTTTCT
858576
858577
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
AGTTATTTCGACGTGATTTAACGCACAGTAAGATTTATAA
858641
858642
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
CTTGTATGCGCACTTACGAAAAGCCAATAATACTCAAA
858704
858705
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TCAAAATATATATCGATGATTTCTTCAAGATCACTT
858765
858766
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
ATAATATTCTCTCTACTATTTCTTCTTTCAACTATTCA
858828
858829
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
CTAAATATTTCGTGTTTATATCAAATGCATATACTTT
858890
858891
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTATATGTAGTGACGGTAAGTAGTAGCATCTATAACTCT
858954
858955
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
GATTACTCTTCACAGATAAACATTCTTTAGGTAATTCT
859017
859018
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTTCGTTATCGTTCACGGAATTTATCAATGCAGTTAATT
859081
859082
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TATAAGAACCTAAAAGAATTAACTAAGAGTGTTGACGG
859144
859145
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTCATTTCCGGCTCACCCTAGCCAAATACTCTTTGAAT
859207
859208
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
GATATCCATTCCTCAGCACTCTTAAATCCGCTGAAATT
859270
859271
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TAGAATCTAGCAGTACTATGACCCATATAACCATATACA
859334
859335
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
CTTGTTAGTATATCTATTTTCATATTTATACACCCGAA
859397
859398
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
ATTAATTCTTTTACTGTATAGAAATATCTCATTTT
859457
859458
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TCCGTTTCTAACTTATTAAAGTATTCATATAATGC
859517
859518
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
GTATTAAGTCATCAGAATATCCTTCTAATGATAGAG
859578
859579
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
GCTATTAACATTATTAAGTTATAGACATTTTGTCCATATTCTACG
859648
859649
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
ATTGAAAAGACTTTACGAAGTATATACAAGTGCTCA
859709
859710
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
AAGTACACTTTATTAGCATTTTCTGGCAAACGATTA
859770
859771
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
GATATAATGATCTTGGATGAAAAAGCAAGAAAGGTGTTGG
859835
859836
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TGATTCTCATCTATCTCCTCCTCCAATTCCGCGAGGAC
859898
859899
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTATTAATAATTTTTCGGGTGTTTTCATGTTTGTGCC
859960
859961
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
AAAACTAATTGTATATTAGCAGGGTCACTTTGCACTCT
860023
860024
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
GTATGCTATGCAACAGTATTTTAATCTTATTTCTCGGATCCT
860090
860091
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
CTATATATTCGAGAAACAGGAATTTTCCCTGACTTATTT
860154
860155
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TATTAAAATACTTATTAGCAATCATTGCTGCACGTAC
860216
860217
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
ATTAAATTCCTTTTAACATCACATAATCTTTATTTCATATC
860282
860283
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
ATTAATACAATTAAGCTCCGTCTTTGCTAGACTCTTTTA
860346
860347
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
CTAATGAAACATAAGAGCGAAAAGAAGTTTAGTAGAGATTC
860412
860413
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
GCTTGTTTCTGATTGATGATATACCTTATTATTACTGGT
860476
860477
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
ACAAGATTCGTAACACTATTGACGAAGGTAAGAACGTTATTCTTG
860546
860547
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTTTACAATCAGATATATTGATAGTTGATTTCTGCTA
860608
860609
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TAATTTCATTTTCATTATTTCTCAACTCCCTTAATTAC
860671
860672
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TGATTCTCATCTATCTCCTCCTCCAATTCCGCGAGGAC
860734
860735
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
CTAACTAAAACACAACTAAATATAACACTATATAACACA
860798
860799
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
ATACTCTGTTCCTTGCTCCATCTTTAGTAATTTGCTAA
860861
860862
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
ACCTTACTTTCTCTTCTCCCTTTAGATTAAGTTTT
860921
860922
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TATAAATAAGCGGTAAAAATGAAGAAAAAAACGTTTCTAT
860986
860987
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
AGATATTATCCTTATATTCACCTACTTTTTGCAGATATTTC
861052
861053
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TAGAATATCAAGCAGATAAATTAGTAGTACAAGATGTGA
861116
861117
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TCTATTAATATTGTATGCAACATTATTTTAACTTTGC
861178
861179
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TAGACAGGTCAGTATAGGTCTTACCATCTAATAAAGCAAG
861243
861244
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
AAATTACTATCTTGAATAGAGATATTAGCGTTGTCTATTGCT
861310
861311
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
CTATATATGGGAAGGCTTATGATCACCTAGTAGAA
861370
861371
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
GATGAATATGAAGAATTTGCTACTATAATAGTGAAACTCC
861435
861436
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
CTCATCACCCCATGTTTCTTCAAATCCACCCAGATTCTC
861499
861500
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
AAGAATCCCCAAGGATAAACACTAGCATATCGACC
861559
861560
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTCCAAATACACGTTTATTCAATATGATATCCAGCAAC
861622
861623
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTATTATTTACAGTTATTCTTATCTTTGCCATCCTCACCAC
861688
861689
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TCAAAATGAGTAATTTTTTCTTCATGCAACATAATTCAC
861752
861753
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TCTTTCACATACGTTTCTATACGCTTCTTCTTTCCATC
861815
861816
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
AACATGCTCAAAGCAAGTGATGGGACGATTACTAACCTAC
861880
861881
GATCAATCCCAAAACGAATTGAAAG
861905
Left flanking sequence : Till position 858006 (length
bp)
AATTACAACTAGAATCGGTCACATGAGGAGTAAAGGATAATAATGAAGATTTATAAGCAAGAAAGGAGTA
AAGTAAGATAAGAAGTATAAAAACACAACA
Right flanking sequence : From position 861905 (length
bp)
TAATAAACGATTGTTTGACGACATTATTTACAGGGAGTGTTCTCGTGCAGTCATCTTATTCGAGAACATA
TAGTAAAATTATATCAGATTTTGTCTAATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp