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CRISPRs details
NZ_AHJQ01000001_2
Flanking alignement tool
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NZ_AHJQ01000001_2                                                                                                                 
top
Strain :
Sulfolobus islandicus M.16.40 GCF_000245215
RefSeq :
NZ_AHJQ01000001 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_AHJQ01000001_2
DR consensus (24 bp) :
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
Number of repetitions :
105
Begin Position :
872895
End Position :
879511
872895
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTTTCTAAAAGACGGTGAAGTTATTCTTGTATCAGAACA
872957
872958
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACTTGTGGAAGCATTAGGGCAAAGAGCCGTACACACTATA
873021
873022
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GCGTATCCCTGTGCAGATATCGTTATTCTCCCAGTAAT
873083
873084
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCCATGTGAAATCTTTAACGTTGTTTTTCCTATCAACATCAT
873149
873150
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTAAGATCCCCTCTTATTCTGTACGGATCATCGTTAAG
873212
873213
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AACATATGTGAGGCACAAATGGCCAAATTATTCGACACTA
873276
873277
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTCTGCAGCTTTCTCTTCTATTTTATTCAATAACAATT
873339
873340
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTTGAAATCCAACTAGCAGGGTCATCTAGGATAACTAT
873402
873403
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATCTTTTTATCAGAAATAGCGGTTTTAAATTTTTATAAA
873465
873466
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GATATTGAACCGCTTTTCTCGCGGAAAAGCTTTTATAGT
873528
873529
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTATTTGTTTTGGTCTCTTCAGCTTGAGGAATGGATGTAC
873592
873593
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACGACAGCCACAACAGCGCCACCTGCAGCGACTGAAGCG
873655
873656
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GGTTCATCACAACTTACTCCAATAAGTTCGTATACTT
873716
873717
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CCCTGATTATTAGGCATTTTATTCGCCCTCCTCTCTTAT
873779
873780
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTAGGATCGGTTGCAATAAGGAAATTGGTATCAAAAGGATAT
873845
873846
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TAGGATTTACTGCGTATGTTTCTTCTTTTACTTTCTCTACT
873910
873911
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TAGATTCATCATATTCATTAAGAATCTTCAAAACTTCGCTTT
873976
873977
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTGTTAGTTTGAGAGAATGCAACGTTACTTAGTAATAATGT
874041
874042
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGGGTTATATGAAATTGAAAGCCCTGGAGTAGCGTAAA
874103
874104
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAAAAATTGTTGGAGAGTTCAAAAAAAGAGGTGTCCGTT
874166
874167
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTAGACCATAGCGGTTTGTTAATTGATGAAGTAGCAGGGA
874230
874231
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCAATAAACGTAACCGTAACACCATCAGCAACTTCTGG
874292
874293
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACAGTATTGAGACTAACTAAAAATGGTATTACGTTATT
874354
874355
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTAATTCCATATGTGACCCAAGCACCAGTAACGTTTATGA
874418
874419
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GAATGAAGTCTATTGTGTCAAAGTTTACGCCTAGTTCCGC
874482
874483
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATCAGTTCAAGAATTGGGTGAGCGGGAATGGGTAGGAT
874544
874545
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TATTTCTCATGAAAAACGACCTGATTAAACTGATGAAG
874606
874607
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TACATATCTGCACTTGTAGCATATTGTTTTATAGCATTT
874669
874670
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TACTTCCGCGGTGCCGTTCGCTATAAATAGCCCAGAGCCGTTTA
874737
874738
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AATAACGTTCCAGCGAATTCAACTACAGGAGCTTTGATGCT
874802
874803
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TGTTTCTTCCCTCCAGATAAGGCGACTACTATTATTAG
874864
874865
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CCAATCCCAACCGCTCGAAAACCCAACCACTCCCGTT
874925
874926
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTATTTGGTACAATAGTGGTAACATTAGTTATGTTCACAG
874989
874990
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTGGTTTCAGCAAACGGCGTCACATCCTTTAACTTCTATT
875053
875054
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACAACACTACCACCGCTAACTAACGGCCCTCCTGAATCCCCCT
875120
875121
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GAAGTATCCCAATCTTCTTTATGTCTTCGCCAACCCTAA
875183
875184
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTAGAATCTATGAAGTTGAAGACGGAATAAGGGTCAAAA
875247
875248
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TATCTATTCCTTCCCAATATTTCTGTGTTTTACGCTCATATACT
875315
875316
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CATTCCACCAACATCGTCCATTGTTATCGATGGTGT
875375
875376
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CAGCACGCTGGAAGCTAGGGCGTCAGCCTAAATACA
875435
875436
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTCTAGTTTTTGTGCCCCGTTATTTTGCTATGAT
875493
875494
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTCTATTTCTTCTTCGAATTTCCCTTAGTGTGTAATCTTCA
875558
875559
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TACTAGAAATCCCGCCACTATTCCTATGAAATTAGTTAGCAA
875624
875625
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CAAACTCAGCGATAAGCAAAAGTTTAAAACAGCTGTTT
875686
875687
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATGTTTGGTAAGTTTAGCAAGGCAAGTTTGGTTCAGCAAG
875750
875751
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CATAGATTCTCATAGGCAATATAGCTACTTTGTCATCAT
875813
875814
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GAAAATAAAAAGCTTTTTAGAAATATACTTCTAAATA
875874
875875
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTATTATTGAGTTGTTTCAAGATGTTGGTATCATAG
875935
875936
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTGTATCTCCCCAATACGTCAATACACTTCCAGAAGACGT
875999
876000
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTTGTTTGAACTCCTCCAGTAATTTTTCTATCTCATCTT
876063
876064
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACAAATCCGTATCGGATCTAACACATCAGATCGTTCCAT
876126
876127
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTTCCGTCTCTATCTCTTCTATATTCGTAGTCTCA
876186
876187
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGCAGTTAGAGATATTTCAGCTGAAGGAAACGCTGAGAAAGATAT
876255
876256
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTCTGTTTATGCAGCGCAGTAACGAAGTTCACCATTCTG
876318
876319
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTAAGTTCATCTAGATGATATATAGTTTGTGCTTTT
876379
876380
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGAGCAGTTAGACCAATTGTACCACTCCATTCAAAAAAT
876442
876443
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CGATGATTTCCCCTACGTTCATGGTAAACATGTTCAAGC
876505
876506
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GGTTGTAAATACGCCACGTGAATTGGAGCGCTAGACGCGGG
876570
876571
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTGGCTGGAACCAGATATTGCTGAGGTAAGCTAGTTCC
876632
876633
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAATTACTAACCTTACTATCAATTTTTTAAGTAAATCTT
876695
876696
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACATCTTTGTGGCCGTGAACTTCCTCAGATATTTCGGGGCTA
876761
876762
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATACCAAGGCTGAATGGAGGCCTAGAGTAAACCCCCCA
876823
876824
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTCAATGTTAAAACTGGAATAAATGGTGTTGAATATCCT
876886
876887
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCTGATCTGTTATCAGGTCTAATGAGTATTTGGCCTTA
876948
876949
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTGCATAATCTTTTCTGAATCCTAATGCCATCTTTTCCTT
877012
877013
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACAATCCGCAATTAATTCTTTACATTCCTCCAAATATTTT
877076
877077
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTCTTGAGCTCATAAATCGGGCTGAGGTCCTCATAAT
877137
877138
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAAACCGGGATACGAACGTGTTCTCTACAGAGGTAATGTA
877201
877202
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATCTTTGAAAGATAATTAATAAGTAGCTCTAGATCCTTT
877264
877265
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTATATCTCCCTAAAACATCGATACATTTCCAGAAAAC
877326
877327
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTATATTATCAAGACCTTTAGGTGTTGTGTATGAGATA
877389
877390
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AATGATTGAACTACTAAAGTCAGTGGCGGAACTGCAGGCT
877453
877454
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AACGGTGAAAGTGCTACTTTATCATACGGGCAAGCATTAGA
877518
877519
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTAATACTCAAAGTGTTTATATAACACGTGAGACGCAA
877580
877581
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTAATGATGAACTTTACAAAATTCCTCATTGTATTAGCC
877643
877644
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGGTGTATAGGTGACATGTGATATCTGTTCCTCCTCCTGAT
877708
877709
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTCAAATCATTGTAGTCCCAAATAAAGGGTATTTTTG
877770
877771
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CGATACTCGAACGGTTGCGTACCCCAAGGACGTAATTCTA
877834
877835
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTTTCCATAAGATATCGCAGAATAAATGGCGGTAATGGTCT
877899
877900
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCTAATAATACTAATAATAATCAACAAACTCAGACTACAT
877963
877964
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TAATAATCTGTAACGCTTACAGTTATCTTAACTGGA
878023
878024
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CATAAAGTATATGTGCTGAAGTCTTCTTTGATCCGATA
878085
878086
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAGATAACACATTTATTTTCTACGTAGTACTTACATACT
878148
878149
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTTATTCCCGAATGATTTCTTCCTCCTATAGATTTCCTCAA
878213
878214
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAGACTTAGATCATGGTGTGATACATCAATATTTAGGA
878275
878276
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATACCCCTACACTGGTATATATTCAGCCGTATATAG
878335
878336
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GAAAGCGTAAAGATGAAGTTACTAGACGAAATCAAAAA
878397
878398
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATACCTTTTTAACGTCGGATACCATAATCATTAATCCCGC
878461
878462
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CCCATGATTTTCAATTCACCAATTGTACAAAAATATATTCTT
878527
878528
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AACGATGCTACCGCATTTGTTAATAAATTTCCTAAGTTTTGT
878593
878594
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CCTACCGTGACTGCGACATAATGGGGTATTATTGCATAAT
878657
878658
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CGCCGTCGCCGACGCGGGGGTATGTAGTCAGTATTACT
878719
878720
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTAGACGCTACTGCATTAGGCATAGGTGTTATAAACGT
878781
878782
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGATTTGTCATTTGAATTATATAACTATGAGTAAATGTTA
878845
878846
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GAAGGCAGTGCAATCTTATATGTGTTCCCTTTTTCTTTTG
878909
878910
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AATCAGGGGATGATACTAGTTTTCACATACAACGGACAGTCG
878975
878976
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GCTTTCTGCCGAACTTTTCAGCAGTCATTATAGCTCC
879036
879037
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGTGTTAGTATAAATCGCGAACAAAATAAGCGGATAAAGA
879100
879101
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTTACGGGTACTGTTTGTGTATAATATGAGGGGTAACTCAT
879165
879166
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TGTGGCAACACAAATATAGCTTCACAGATAACATCCCTTT
879229
879230
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TGGAAACCGCTCACGTAAACACTTATAAATCCATTCTCTT
879293
879294
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTAGTTTTATTAAATGATCCATCAATTCAAACTTTGACAT
879358
879359
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTGACTACATTCAAGCCACCAACGGTAACGATAAATTTAC
879423
879424
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTCATGTTTTTGTTATCATTCAATCCTTGGCAATTGAGT
879487
879488
GTTAATCTACTATAGAATTGAAAG
879511
Left flanking sequence : Till position 872895 (length
bp)
AGTGAAAGGATGAGGAGAAAAATTGAAAAGATAATACAGAGTAAAGCTTATAAATAACGAAGAGAGAACA
AGATATTAGATAAAAGTTAATAAACCCTCA
Right flanking sequence : From position 879511 (length
bp)
AAAATTAGTATAGACTAAATAATTTTTAAATAATATTAAAAATAGACAGTAAATATATATTTATTTAATG
TGTATTTAAAGGTTTTCCTTACTTCGGAAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp