Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_AHJT01000001_1                                                                                                                 top


Strain : Sulfolobus islandicus M.16.47 GCF_000245275 RefSeq :NZ_AHJT01000001 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_AHJT01000001_1
DR consensus (25 bp) : GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGNumber of repetitions :86
Begin Position : 853201 End Position : 858642

853201GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGATTATCAAACGGATGGGTAAACCTATATAAAACATCGCCT853265
853266GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGATAGTCTATTTATCGTCTTCTTACCCTACAGCGAATTCCA853330
853331GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTTTATACAATGAACATAATTCTTCATCGTTGTATTGTT853393
853394GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGATAATTATGAATAGATCAAATAATAAGAGAAACGATT853455
853456GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGAACGTACCGCATGTTCATATCCCTGTAAAGTATTTAGA853518
853519GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGCTATCTAGTTCCTCTCTAATATTTTTATTAATCTTAAGATA853584
853585GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTCTTCGGAGTAGTAAGGAACTCTTATTTACCTAAAAAAA853648
853649GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTCACTTATTTTCTTCATTATCTGAGTGTTGACAACGTCTTG853714
853715GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGACAATTCCTACGCCTGGGACTTTTACTTTCTCCTTCTCCT853779
853780GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTTCATGGGCGGGTCACCTCATCCTTTCCCTTTATTTCATT853844
853845GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGCCTTGTAACTTTACAGTAAGAAGCTGGATTAGGATTTC853907
853908GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGAAGAATTTTGCTAACTGTTCTTTATTCGCAAGAGTTAC853970
853971GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGATAGTCCAGTTTTAGCAGTACTTTATTCTTATGTATT854032
854033GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGACTTTAATTCTAGACCAGTCCGATAGGATATCTCTT854093
854094GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTAGATTAAACGAAGAGGAAAAGAGAATGCTAGAAGA854154
854155GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGGTACCAGCAAACGGTTATGGTCTGATTTATGCTTATTTTT854219
854220GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGACATAGATGATCTTATAACCCCTTAACGTCTCTTCCGGCAAC854286
854287GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGAACTCTAGTTTTATTGGTTTCTTTTCCCCCTTATTCTC854349
854350GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGAAATATTAAAGTTTTGCATTCTTTGTACGCGTCACCAAA854413
854414GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGATATTTTTAAGCTTCTTAGTAAAAGAAGGATATCTT854474
854475GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGATTGTTAAATCAGTTATTCTCGGTCTCATTATAAAATTCA854539
854540GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGCACTACTTGTTGTATATGCGTAACTATTAGAATTGATATT854604
854605GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTTCAAATACCCTAATTGTTCTCTCTACCTCATTTAGATC854668
854669GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTTAGTATATCATATGCTTCCTTCATCATGTCAATATC854730
854731GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGGGGCAACCACCCTTCACGGGGTGGTCGGGTAGCACCCACCTACCCGTTACCA854807
854808GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGATATTTTCAACTCTATAGCCGTTTTTCATGCATTCTTCTGAT854874
854875GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTCGTATATCTGTACAATCTTCAATTCGTTAAGTAGTTTC854938
854939GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGAATTCCTTTATCTTTGCTTCCAGCTCTTCTATCTTCTTT855002
855003GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTTAGCTAGATCAGCTGCTTCAGCTTCTCTCAGCGCTCTC855066
855067GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGCCGCCCTACTTGTTTTTATATTAAATGCTATTCCC855126
855127GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTTAAGTCCTTTGATGTGACAGATTATATCAAAATTGAT855189
855190GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTGATAATCTTCAACCTTAATAAATTCGAAATAAATATC855252
855253GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTTAGAACAAATCGTAAATGAGTATTATGATATGAAGTGCC855317
855318GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGACTTTATACTGTAGATATTTACCGGGTAGGACAAAGTAT855381
855382GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGCTTGAATAAGCACTTATAGAATTTTTATTAATAGCTTCAG855446
855447GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTCTTGTCTAGTTCATCTAACAATTTTAATAGCGTCTCGA855510
855511GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGATAGTCACGTATATTGGATACCCAAGCTTCTCATAATTA855574
855575GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGATCAGTATTGGGAAGTAGATTGCTTTGCCTTTATTCTCT855638
855639GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGCAATAATGTTTATGTCTTTTGTTTGCCTAAATTCTT855699
855700GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTTTTTCTTTCACCTCGATGTAAATATTTACTTCTTCAA855762
855763GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGCTAAACCTATCAGAGTTAGCAGAATATAGTAATATTGATATT855829
855830GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGAGGATCTCAAGACATATGGTAACAAGTTTGTTTTCTT855891
855892GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGATTTCGTACATCAAGTATTTTGATGACAGTAAGAAATATTG855957
855958GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGACCATATCTTTCCATGCATCAGTTTCTTGACTTCCATAC856021
856022GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGAAATCAATATATAGTGCTTCAGATAGTGGCACATAT856082
856083GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGATATATTTCTTTACTAGTTGCTGTGACGATTTAACGCTGCT856148
856149GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGCTAGTTATCCCTGCCCTACCGGTAAGTCTAACGAATATA856212
856213GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTCTTGTAGAAACTTTATCCACTTTACTTTTTCTTCGC856274
856275GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGATATTCTTGCAATTGCTTCTAAAGTTCCAATGCTTATTG856338
856339GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGAGGTAACTTCTAAGATAGTAAGGTAATGCTAAACGAACCAT856404
856405GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGGTTACAAAATTAGAATACTATTTAACAAACTTATCAAA856467
856468GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTTTAATTCTTTAATATAAGTAAGCTGTTCTACATAGAA856530
856531GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGGACTACAATTGGCAAAGATCATTCAGTTGGTAGTATAC856593
856594GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTATTCATATCTGCCAATGAGTAATGTATACTTCTAT856654
856655GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGGAAAGTTCTTTTTGCAGACGTTCGCCTAATCGAATAATAT856719
856720GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGGTAAAATACCAGGTTCCCTACTATAATCGTTACTGCC856781
856782GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGATATATAGGTTCCATGTCATTGCTCCCCAACCATAATC856844
856845GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGACGTTCAACTTTAGCGATTCATCTACTTTCTCTTCATT856907
856908GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTAAGCTTATCAGATATTCTACAGCTTTGTCAAATTCTTT856971
856972GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTCTTTTAGTGTTGAAAGATTTGCTTTATCATTTAAAAAT857035
857036GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTCGTGAGGGCAGAGATAGCAAAGAAGTCAAAGTATAATGC857100
857101GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGATAAGTTTAACGCCTAGGGTACTCCCTGCGTAAATTC857162
857163GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGGTTAAGCTCTATGTCCTGCAGGATAATACTTTTG857221
857222GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGAATCATATACTGTATCGTTCGTTACAATCACGTTATAT857284
857285GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTTGCTAATGATTCAACGTTAGTCTCTACTATTTCTT857345
857346GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTTCATGAAAACATCTCTGTCAAGTCTTTTTAATCCTAAA857409
857410GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTATTACTCTTAGCAGCTTGCTCATAATTTATACTAA857470
857471GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTATTTTGCCCAATAGGTCTTTCGGAGTTATACCTTTCT857533
857534GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTCTCATCTTTAGTGCTTCTTTCTAAGCTCTTCCCATTCCTTCCTTATCTCC857609
857610GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTCTCATCTTTAGCAATAAATCATGAGTTACTGGAA857669
857670GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGATTTTTATCGCCCCGTCAATCATCAGATCTTTAACG857730
857731GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGATAGATAGAAATTACTCTCTACTGGATCCGCAACTTC857792
857793GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTTAGGAAGAAGGGGGACTACTGTAGTGTGTGTTACAATA857856
857857GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGCATATATAGTGAATTTCTTTTGAGATAATAGATTAT857917
857918GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTAGACAGGTCAGTATAGGTCTTACCATCTAATAAAGCAAG857982
857983GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGATTACACTTAAGATTGTTGCTTTTTTACCTATTACTG858044
858045GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTTCTACACTTTCAGAGAACATAGTTTCTTTATTTACA858106
858107GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGATAACTCTACTACTATTTTCTCATGTAAATTCCTAGTGCAT858172
858173GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGCTGTTACTCAAATATTATTCACCTCCATCTTTTGT858232
858233GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTTTAATCTTATTTCTTATGTCTATGCCTTCTTCACGT858294
858295GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGATTTAAATTATATTTTAGGGCGTATCTGTCTAGCAGTTGTA858360
858361GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTTATTATTTACAGTTATTCTTATCTTTGCCATCCTCACCAC858426
858427GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTCAAAATGAGTAATTTTTCTTCATGCAACATAATTCAC858489
858490GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGTCTTTCACATACGTTTCTATACGCTTCTTCTTTCCATC858552
858553GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAGAACATGCTCAAAGCAAGTGATGGGACGATTACTAACCTAC858617
858618GATCAATCCCAAAACGAATTGAAAG858642
Left flanking sequence : Till position 853201 (length bp)
AATTACAACTAGAATCGGTCACATGAGGAGTAAAGGATAATAATGAAGATTTATAAGCAAGAAAGGAGTA
AAGTAAGATAAGAAGTATAAAAACACAACA
Right flanking sequence : From position 858642 (length bp)
TAATAAACGATTGTTTGACGACATTATTTACAGGGAGTGTTCTCGTGCAGTCATCTTATTCGAGAACATA
TAGTAAAATTATATCAGATTTTGTCTAATA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp