CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP006976_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP006976_3                                                                                                                 
top
Strain :
Pasteurella multocida subsp. multocida HB01 GCF_001663095
RefSeq :
NZ_CP006976 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP006976_3
DR consensus (28 bp) :
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
Number of repetitions :
20
Begin Position :
1610631
End Position :
1611798
1610631
AATTGAAACTGCCTATACGGCAGTTAAC
ACCAATCTGATAATCGAGCCAAGATCGCTTTA
1610690
1610691
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
AAGAGCAGAAAACAGAAGAATTGGAAGATGAC
1610750
1610751
TTTCTAAGCTACCTACACGGCAGTTAAC
AGTGTAATTCCGCTCCGTTGCTTAAAATAATC
1610810
1610811
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
GTATGAGTTCGGCATTTGCAGAGCTTAAAGCT
1610870
1610871
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
TTGATCCTTTTACGCGTAAACAGAATGCTTTT
1610930
1610931
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TATTCAGAATCAAAACGAATACCCAAAATTGC
1610990
1610991
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
ATTCCTTTTCTTTTCAGAATTGATACCGCTTC
1611050
1611051
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
ATCTGTAGCCGATGATGTAATTCAATCTTTTG
1611110
1611111
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TCGCAAATTTTTGCGCTGGTGTAAGAGCTGTT
1611170
1611171
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TAAAAAAATTGGTATTTCGCGCAAACGATCAA
1611230
1611231
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GCCCCGAAAGTTTCAAGCCAACACTTTCAAGC
1611290
1611291
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GGTTGCAACAAATGCGTGATGAGCATTCAAAA
1611350
1611351
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
ATTCAATCCCCCCAACACCTGAAAGAAATAAT
1611410
1611411
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AAAAATATAACTTTTTTAACCGCTTATACAGC
1611470
1611471
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GTATTGAAAGTGACAATTTTGTAGCGGCCAAC
1611530
1611531
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TTGATTTCTTGCTCACCACGTTGAATTGCAAC
1611590
1611591
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TTGAGCGGTTACAGTTACTGACACAAGTCCAA
1611650
1611651
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
CAGTCACTGTTGCTGTACGTTCGCTTGAAACA
1611710
1611711
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TGATCAGCTTGTCTTTACAGCAAAAGAAAAAT
1611770
1611771
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
1611798
Left flanking sequence : Till position 1610631 (length
bp)
TGAAATTTTCCAAAAATTGACCGCACTTTTATCGTTAAACACGATATAAGCTAACAGACCGATCCCCATA
TCCAACTGTTTTAGTAATATACCAACAGTC
Right flanking sequence : From position 1611798 (length
bp)
TAAAACAGTCTAATCGACATCCCTTTATTCAGCAAGTATGGCGCCTATCAAACTGTTAAAAACCCTTTTT
CTAGACATAGAAATAACCCTTTGATCTTAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp