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CRISPRs details
NZ_CP007040_4
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP007040_4                                                                                                                 
top
Strain :
Pasteurella multocida subsp. multocida str. HN07 GCF_001956795
RefSeq :
NZ_CP007040 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP007040_4
DR consensus (28 bp) :
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
Number of repetitions :
31
Begin Position :
1587681
End Position :
1589508
1587681
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
TGTAATCGATATAACGTGGAATGTGGAAGATA
1587740
1587741
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TTGCGGGAATTATCTGGTTTTTTGCTCGCAAA
1587800
1587801
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TTAGCACAACAGCCAAAGAAGTGAATATTAGT
1587860
1587861
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
ACAGGGCAAGAGTTCGAGACAATGGCGGCAAT
1587920
1587921
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TTTATTCCGTGGATTGAAGGTGTTCTCAAAAC
1587980
1587981
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TTAATAAAATGACGCTTTGCTCAGTAAAAAAC
1588040
1588041
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
CCATTTTCTGCGGTGGCGGTGCCGCAACAAAA
1588100
1588101
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GTCAACGCCAAGAGCTGGTGGAAAGCTTTGAA
1588160
1588161
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
CACCGCACAGCGACAATTAAACCCATTAGGTG
1588220
1588221
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AGAAAATAACCAATGAAAGAGTAAAAATCACA
1588280
1588281
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GAAGGTGGCATTCCGTCTGAATACGTTATTCA
1588340
1588341
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AATAAAGCATTTCGCTATACAGTTCTTCTGGT
1588400
1588401
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
ATCAGGATTTAAAAGACAATCCTGAGAAAAGA
1588460
1588461
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
ACGGTCGGTATTAAAACTGGCACATTGCAAAC
1588520
1588521
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TCTTCCTTGGTTTCGCTTGCTGCATAGTTAAA
1588580
1588581
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GATAGATTGGTGACCTAATTGTTTGTGCAAAA
1588640
1588641
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
CGAGTATTATTGCGACCAATTCACCCACATCA
1588700
1588701
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GTTTCATTTCTTCATGTTTAATATAACAACTT
1588760
1588761
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TCAAAACAGAAACAGGACGCCGACAGCGCAAA
1588820
1588821
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GTCCAACTCTTAGAGTTAAGTCTGGTTCACGT
1588880
1588881
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
CAACAGCAACTGTGGCGGTGATTTTATGTAGT
1588940
1588941
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TGATTAAGATCACAATCATGAAAGGAAAAGCA
1589000
1589001
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
ACCGCTTTAAAGTGAAAGAAGATGATCCAAAA
1589060
1589061
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GTTATTTCAATATTGTTAAAAGATAGCCATTT
1589120
1589121
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AAAAGTGGTGATGTCGTCGTGCTAGGGGGATT
1589180
1589181
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AATAAAAAATTTCAGTACAACGAGTAAAAAGA
1589240
1589241
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AAGATTTAATTCCAGATCTTTCTATGCCTGCT
1589300
1589301
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
CTGACAAAACGATCAGATTGAAAAAACAAGAG
1589360
1589361
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
CAGAAATGCGCCAATTCTTAGATAAAACTTGT
1589420
1589421
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AGCTACGGTGATTATCTTTTATCTTTTCACTT
1589480
1589481
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
1589508
Left flanking sequence : Till position 1587681 (length
bp)
ATCAAAGATTTCTAAGCTGCCTACGAATAAAACTCATAACGAATTAATCAAAGATTTCTAAGCTGCCTAC
GAATAAAACTCATAACGAATTAATCAAAGA
Right flanking sequence : From position 1589508 (length
bp)
TAAAACAGTCTAATCGACATCCCTTTATTCATCAAGTATGGAACCGATCAAACTGTTAAAAACCCTTTTT
CTAGACATAAAAATAACCCTTTGATCTTAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp