Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP007503_2                                                                                                                 top


Strain : Riemerella anatipestifer GCF_001051075 RefSeq :NZ_CP007503 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP007503_2
DR consensus (47 bp) : GTTGTGAATTGCTTTCAATTTTTACTATCTTTGTGATAGTTCGCAACNumber of repetitions :16
Begin Position : 846370 End Position : 847571

846370ATTATGAATTGCTTTCAATTTTCACTATCTTTGTGATAGTTCGCAACACATAGGAAGTATCGGAAAACTTTTAATAA846446
846447GTTGTGAATTGCTTTCAATTTTCACTATCTTTGTGATAATTCGCAACTATCTGCACAGGAGAAAATAGAGTCAATCA846523
846524GTTGTGAATTGCTTTCAATTTTCACTATCTTTGTGATAATTCGCAACGTCCGTTGTCGGTTCATCTGATACTATATC846600
846601GTTGTGAATTGCTTTCAATTTTCACTATCTTTGTGATAATTCGCAACAAATCAAGTGTTTTTAAACACTTCGATAGA846677
846678GTTGTGAATTGCTTTCAATTTTCACTATCTTTGTGATAATTCGCAACGTTTGTATCTGGATATTATAATCTCCATTA846754
846755GTTGTGAATTGCTTTCAATTTTCACTATCTTTGTGATAATTCGCAACTGGGATTTGACAAAACCTTACCTCAAAGAC846831
846832GTTGTGAATTGCTTTCAATTTTCACTATCTTTGTGATAATTCGCAACATTTTACACGAAGATAAAGAGATGTATCTA846908
846909GTTGTGAATTGCTTTCAATTTTTACTATCTTTGTGATAGTTCGCAACAACATTGCAATAAAACTAATAAACGAAGTA846985
846986GTTGTGAATTGCTTTCAATTTTTACTATCTTTGTGATAGTTCGCAACATAGACGAGATTGAGATATGACAACACCTC847062
847063GTTGTGAATTGCTTTCAATTTTTACTATCTTTGTGATAGTTCGCAACGATCCGAATCGTTTCGGATAGCAACCGAAA847139
847140GTTGTGAATTGCTTTCAATTTTTACTATCTTTGTGATAGTTCGCAACAATGGCATCTGGTATGTCACTGGCGCTGCG847216
847217GTTGTGAATTGCTTTCAATTTTTACTATCTTTGTGATAGTTCGCAACAGCCGCGAGCAGCAGGACGCCTTCGCCGCC847293
847294GTTGTGAATTGCTTTCAATTTTTACTATCTTTGTGATAGTTCGCAACTGACCAGGCGCTGCAGGGCGGCAGTGTCCA847370
847371GTTGTGAATTGCTTTCAATTTTTACTATCTTTGTGATAGTTCGCAACCAGAGGCCCAGACTCGTTGCCACCAACAGC847447
847448GTTGTGAATTGCTTTCAATTTTTACTATCTTTGTGATAGTTCGCAACCTGGGTGGCGTCAGCGGGGAGCACTTGGGT847524
847525GTTGTGAATTGCTTTCAATTTTTACTATCTTTGTGATAGTTCGCAAC847571
Left flanking sequence : Till position 846370 (length bp)
ATAGGGATTTTTAATTTAGTATCTAATTTAATTGTGTCGGTTTACATAATTGGAAGCGTGTTTTATATCT
TAAAAAATAAAACCAATAACAAACAGTAAT
Right flanking sequence : From position 847571 (length bp)
CTCAAAAAATAAACCCATTGTTTTTCAATGGGTTTTGCGTTTTTATAGGATTAGATTTTTTACTATTTCT
TCTCTATTTTTGTTTGATGTAAAGTCTTTT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp