CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP007715_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP007715_2                                                                                                                 
top
Strain :
Actinobacillus equuli subsp. equuli GCF_000801145
RefSeq :
NZ_CP007715 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP007715_2
DR consensus (28 bp) :
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
Number of repetitions :
28
Begin Position :
367628
End Position :
369276
367628
GGACTAAGCTACCTATACGGTAGTGAAG
TCATTTGTCGGGTGTGAGCAACTTAAATCTCT
367687
367688
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
GTGATATATCTGCGGCTAGTGGTACGTTTAGT
367747
367748
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
GCAGCGCAGACATTTGGCACAAACTCACTATG
367807
367808
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
ATATCACCCACTTGCAAGTCAAAATAAGCACT
367867
367868
TTTCTAAGTTGCCTATACGGCAGTGAAG
GCCAAGTCGGCGAAATTGGTGCGCACGTGCAA
367927
367928
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
GCACCATAATAATTTGCGACATTGGCAACTAA
367987
367988
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
ACACGATGACCGGTGTGCTGCACATTAAAGGT
368047
368048
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
AAAATACCAGCAAGTGTGGCTGGCGTGAAGGC
368107
368108
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
TGGATAGTAGCGGTAATGTTACGGCAAAAAAA
368167
368168
TTTCTAAGCTGCTTATACGGCAGTGAAG
TGTTCAAGGCAGATAGCCTGAATGCGTTTTTA
368227
368228
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
TCTAAGTGCGCTTCCAGCGCGTTCTCAAATGC
368287
368288
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
AAAAACCGTTTGAGTGCGTAGGGTTCCGCTGT
368347
368348
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
TTTAGATTTTTAGATAGAGCATTGAGTTTGGA
368407
368408
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
GCCAACTGCCACCGTTCCGCCCACCTTCACTT
368467
368468
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
TTTGTAAAGATTACTATTGTTTTGTTCTGCAG
368527
368528
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
GCTTAGATTTCATTTCAGCAAAATATTGGTAA
368587
368588
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
TATGGGTGGACAAGTTAAGAAATCGTGGAAAT
368647
368648
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
TTTCTTCAATATCCTAGAATATTTTGTAAAAA
368707
368708
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
CAAAAATTGTCATAATACCTTTAGGCGTACAA
368767
368768
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
AGGCTTTTGTCGCTCAGTTGCTTGGCATGACA
368827
368828
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
CTATTACCATATTTAGCTTGGGCGTTTTCGGT
368887
368888
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
CGATCACCGCTAAAGCGGAAAATGCGTTGTCA
368947
368948
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
GCCAGTTGTCACTTTGAGGATAATCACCTAAA
369007
369008
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
GAAGTAATGGTTCTGCTGCAAGTGGTTCGGGT
369067
369068
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
TTGAAGACCAACATCAATCTTAAATGCGGATA
369127
369128
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
TCATTACACCTTTCTTCATCTTGGGCAATAAA
369187
369188
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
AATTAAACTGACACATTCGGTATTATTTGTACT
369248
369249
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
369276
Left flanking sequence : Till position 367628 (length
bp)
TCTAAGTAATAAATATTCGCCCGTTTAGAATGTAAAATCGTTTTTAAATCCGAAGACGGAATATAAGGTG
TTTTTTTCATATTATTTCCTCTTATTTTGT
Right flanking sequence : From position 369276 (length
bp)
TCGTTATTTTACTTTAGAATGTCAGATATACCAAGTTGTTAAAGAGCTTTTAATCAAAAAATCCCTTTTT
TGAAAGGTTTTTATAACCCTTTGTTTCTAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp