Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP008810_1                                                                                                                 top


Strain : Campylobacter fetus subsp. venerealis 97/608 GCF_000759515 RefSeq :NZ_CP008810 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP008810_1
DR consensus (30 bp) : GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACNumber of repetitions :26
Begin Position : 688725 End Position : 690400

688725GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACCCGTAAGCTACATTGTAAGCTAAGTCTTCAAAGACT688790
688791GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACTATAAAGGGACCTACGAACTAAGCTAGAACCCTTTT688856
688857GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACGTGTAAGCAAGATGGCAAGAGACTATCTCCTGTTGT688922
688923GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACCGGGGAGCAACGTTAGCAATCTCATTTCCGTCCAT688987
688988GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACTGGGGATTCGATGAAATTTTTAACTATATAGCATTC689053
689054GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACTTTTTATAAGGCTCATTTTTGAAGATATTATGCTGC689119
689120GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACCGGGGAGCAACGTTAGCAATCTCATTTCCGTCCAT689184
689185GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACTGGGGATTCGATGAAATTTTTAACTATATAGCATTC689250
689251GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACTTTTTATAAGGCTCATTTTTGAAGATATTATGCTGC689316
689317GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACTCCAGAGCTAATAAGGGATTTAGAGCAGCTAAAAACT689383
689384GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACCGCAAAAAGAGTTGAAATATATAGATAATAGGTTAA689449
689450GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACAATCCAACTTAACAAAAATGTTATATAAAATCACC689514
689515GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACTAAACTATTTCGTTATCCTGGTTGATACCGCTTAAA689580
689581GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACATGAGTTTAAATTTGATAGATCTGAAAAGATTATTC689646
689647GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACCTTGATACTTTTTGCTTGATTAGCTTTGCATTTTTA689712
689713GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACTCCCCGTTATCTACCTCTGGCGCCATGCTCTCTCCG689778
689779GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACCCTTCTGCGATATATTTGATGAAAAAACAGAAAGG689843
689844GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACTTTGAAGTGCACGACGCTATAACTAGAACACGGATC689909
689910GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACATTAAAGCCGAATTACTCCCATTTTTTTTGACTTGG689975
689976GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACTGTATGTTGGTAGCTTTTATGGTTACTTTACATAAC690041
690042GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACAATCCAACTTAACAAAAATGTTATATAAAATCACC690106
690107GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACTAAGCAAGGCTTATAAGCTCTTTACAATGCATTTTT690172
690173GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACAGAACTGTTTTAACCTCACTTCCATCAATCTCTTTT690238
690239GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTTAAACCAGTATGCCATTTGATTCTAGTTCGCCTATAGCTCT690304
690305GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAACCATCCTCCTTTTAATTTATTACATTTAAACAATTTA690370
690371GTTTGCTAATGACAATGTTTGTGTTGAAAC690400
Left flanking sequence : Till position 688725 (length bp)
TAACAAATAATCTATTTTTAATAGTTTTAGATAATATCTTTTAATTTATTTTTTATCTTAATTGCTTTTT
TAAATTTACTTAGATGATGAGTTTATTATA
Right flanking sequence : From position 690400 (length bp)
AAGAGCAAACATGGCAGAGACCTTAAAAGAGAAGTTTAAAGGCGTACTAAGTGCAAATACTAGCTATTTT
GAAGGAGTGAGCGACCACATTATAAGTCAG
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp