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CRISPRs details
NZ_CP008878_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP008878_3                                                                                                                 
top
Strain :
Flavobacterium psychrophilum GCF_000831225
RefSeq :
NZ_CP008878 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP008878_3
DR consensus (46 bp) :
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
Number of repetitions :
21
Begin Position :
1585757
End Position :
1587317
1585757
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GCTAAATATTTCTTTTATTTTATTTTGCTT
1585832
1585833
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
TATTGAACAGCAATTTTCATCAGATGATGA
1585908
1585909
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
TACGGCATTCAAACCCCCCATCTATTACT
1585983
1585984
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
AAAGACTTATTTAAGTCTAAAGAAGTGCCT
1586059
1586060
GTTGGTAATTATAAGCTGAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GAATGCGTGCGCTGTATGTATTTCGTTTT
1586134
1586135
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
AATGTGTCTATTGTGAATACATTACCTACT
1586210
1586211
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ACGGAATAAACGGAAACGAGCAACTTATTA
1586286
1586287
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ATTACAGTTGCTTTAAATAAAAAGTAAAA
1586361
1586362
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
AAAACAATCATCTATGTTGCTAAATCTTTT
1586437
1586438
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GAACACATAACAGGACACAAGGCATTGGCT
1586513
1586514
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ACTTTGATATACGACATCTCGCTTACTGGA
1586589
1586590
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
TAAGTTTTCCTACTTAACCATTTTTTAAAA
1586665
1586666
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ATAGTACTTTGATTTCACGTGCGAAAACG
1586740
1586741
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GGTGGCAATGTGTATTCAAACACGGATATA
1586816
1586817
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GGAGCTGGTTCGGGTACAATTACATTAAAT
1586892
1586893
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ATTCTCTTTCAGTTTTTCGATATTGTTTTT
1586968
1586969
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
CTGTCGTACGCTCTAGTATTAGATATATCT
1587044
1587045
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
TAATATTTAGCATAAATTTATAATCGTCCT
1587120
1587121
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
AGTGCTACCTTCGATAATTAGCGCATTAAT
1587196
1587197
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
CACAAATGGGGAATTTGACGAAAACAAAA
1587271
1587272
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATAACCCGTTGGGTGTAATTAAATTA
1587317
Left flanking sequence : Till position 1585757 (length
bp)
ATATTAGACCTACCAGAATATCAACACACAAACAGAACTGTTTTTTAATTTCAAAATAAGCATATAACCA
CCAACATATCAAACGATTAACTCGCGGTAT
Right flanking sequence : From position 1587317 (length
bp)
TTTGATGACACTATCCCGCAAAGTTTTTATAGGGGTCAAAACACCATTTACTTTTATGATGTTTTACGTC
GACCTCAATTGCGATTTCCTGTGTTTGTGG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp