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CRISPRs details
NZ_CP009792_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP009792_3                                                                                                                 
top
Strain :
Yersinia pseudotuberculosis YPIII GCF_000834375
RefSeq :
NZ_CP009792 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP009792_3
DR consensus (28 bp) :
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
Number of repetitions :
31
Begin Position :
3405597
End Position :
3407425
3405597
TTATTGGGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
AGCTCTCGTCTCCCTGGCCGTCCAGCGTGTAA
3405656
3405657
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAT
ATCCAGTGTCACTGCTGGGAAGGTTTCAAGTT
3405716
3405717
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
GTTTTTAATTTTCCGTCAGTCTCACCTTTAAT
3405776
3405777
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
ATTCAATTCGATTAGTGTTAAGGAACTTGCAG
3405836
3405837
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
GTTATCTGTGATTGATTTATATGATGTTAAAT
3405896
3405897
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAT
ATGGTTTCACCTGTATCTGGTAATAATCCCTT
3405956
3405957
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
ACCCTCTCCCTTGATTCGAATACCGGCAGTGC
3406016
3406017
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
TTGGAGTTAATAAGTTTGATATGTATACGATT
3406076
3406077
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
GTTGTTTTTCCATTAATATCGACAACTTTTTT
3406136
3406137
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
CCATCTATTTGATAAATTCCAGATTCATTTCT
3406196
3406197
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
AAACATCAGCGGTCCCGCTGGATGAATATGGT
3406256
3406257
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
ATTAAGTAAGCGTGATGTGTACGGCGGATTCT
3406316
3406317
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
TGTCATGGACGCAGCGAAGGCGGAGCAAGCAT
3406376
3406377
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
CCGTTACGCCGACTACTGGAACTGTTGCAGAA
3406436
3406437
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
ACTGGTTTGGTTCTTGCTCGGTCGGCTGAATT
3406496
3406497
TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
GATATTTCATTTGGTTGTTTATCTAGCTTGTC
3406556
3406557
TTTCTAAGCTACCTGTGCGGCAGTGAAC
GATTCATATTTCCGACACTCATTAAATAATCT
3406616
3406617
TTTCTAAGCTACCTGTGCGGCAGTGAAC
TCTTCATGATCGGCAGAGCTGGTTTGTTCGAT
3406676
3406677
TTTCTAAGCTACCTGTGCGGCAGTGAAC
TCAATATACATACAGAAATAGTCCTCGTAAA
3406735
3406736
TTTCTAAGCTACCTGTGCGGCAGTGAAC
GAAAACGTTCTACAGTTTATTGAGTCTGTTAA
3406795
3406796
TTTCTAAGCTACCTGTGCGGCAGTGAAC
GGGTTAGATTATATAATCAGACATTGGGTTTAG
3406856
3406857
TTTCTAAGCTACCTGTGCGGCAGTGAAC
ATTTACGCTGAGATTCTGCGGCGGCGCGGTAA
3406916
3406917
TTTCTAAGCTACCTGTGCGGCAGTGAAC
GTGCTGTTTGTTGATGTCCTGCTCGACGAGGC
3406976
3406977
TTTCTAAGCTACCTGTGCGGCAGTGAAC
AATGCGTTGATGTAAGCCTCTTTCACCGTGGCG
3407037
3407038
TTTCTAAGCTACCTGTGCGGCAGTGAAC
TTTTAGGGTCGTGTCTATCAGCCCCTTGATAC
3407097
3407098
TTTCTAAGCTACCTGTGCGGCAGTGAAC
ACCTTATTTAATTGGAATGGGTGGGGCTTCAT
3407157
3407158
TTTCTAAGCTACCTGTGCGGCAGTGAAC
TTTGACCTTGATAGCTCGATAGGCAATCAAGA
3407217
3407218
TTTCTAAGCTACCTGTGCGGCAGTGAAC
GAGCAATTTACATTAGAGCTAAAAGATATTGC
3407277
3407278
TTTCTAAGCTACCTGTGCGGCAGTGAAC
CCTTGCACACTACTAGCGTGATTAGCTAGCAC
3407337
3407338
TTTCTAAGCTACCTGTGCGGCAGTGAAC
ATCGGAACCCCTCGATGTTACTATCCGACATA
3407397
3407398
TTTCTAAGCTACCTGTGCGGCAGTGAAC
3407425
Left flanking sequence : Till position 3405597 (length
bp)
GACGATAAAGAGAAACTTGCGCTGCTAAAAGCGTTGTTTGAATATGCCAAGGGATTAGTGAGTTAATATT
TGCAGATAAAACGCCGCCAGAGAGCTGAGA
Right flanking sequence : From position 3407425 (length
bp)
AGTAAGATAATACGGATAACCCGATGTTTATCAATGAGCAATGGCGCAAAATGCGTAAAAATCCTTTTTT
TAGTGAAATACCTGAGTAGCATAAAAATCA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp