CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP010888_7
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP010888_7                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridioides difficile GCF_001577795
RefSeq :
NZ_CP010888 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP010888_7
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
Number of repetitions :
12
Begin Position :
1823853
End Position :
1824606
1823853
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
GCAATAAAACCTGCTATTCTTGGTAGAAATTCATTTG
1823918
1823919
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TTTGACGTGTTAAGTGATATAGATAGAAGAATATGTGA
1823985
1823986
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TTTGTTTCTCTGTAACATGATTATCATTCATAATTAAA
1824052
1824053
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AGAGGATAAATTGTTTACATAGTACCAGTTGGGTCTT
1824118
1824119
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TTGCACTTGAATAGTTCTGAAGAACTTAAGAACTATG
1824184
1824185
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AGCTTTACAATATCAAAGAAAAATTGAAACATCTAT
1824249
1824250
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
GGAAAATTATGGGAAAAGTTTACAGATATCATGAGA
1824314
1824315
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
TAAAAATAAACCTCCTAAACAAATATTTCACGCATA
1824379
1824380
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
CTTGTAATCGCTGAATAAAGATTTCTAGCTTCGTTATT
1824446
1824447
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
GACTCTGCCATCCCTGTAACGAACAGCCTTACAGCAA
1824512
1824513
GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAG
AACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACT
1824577
1824578
GTTTTATATTAATTAAGTGGTATGTAAAG
1824606
Left flanking sequence : Till position 1823853 (length
bp)
GGTATATGATAAATATTATCATTTGCACTACTCGTGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAATTGTATAGATGT
AAGTGTTGGAAATACTCAATTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1824606 (length
bp)
ACAGATATAATGTCAAAATAAGGTTAGGACTTTTAAAAGCATAGCCATATCAGTAAAAATTTAATTATCA
TTTAAAAAATAAATTTTTATTTAAAGAATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp