Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP010888_7                                                                                                                 top


Strain : Clostridioides difficile GCF_001577795 RefSeq :NZ_CP010888 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP010888_7
DR consensus (29 bp) : GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGNumber of repetitions :12
Begin Position : 1823853 End Position : 1824606

1823853GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGCAATAAAACCTGCTATTCTTGGTAGAAATTCATTTG1823918
1823919GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTTGACGTGTTAAGTGATATAGATAGAAGAATATGTGA1823985
1823986GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTTGTTTCTCTGTAACATGATTATCATTCATAATTAAA1824052
1824053GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAGAGGATAAATTGTTTACATAGTACCAGTTGGGTCTT1824118
1824119GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTTGCACTTGAATAGTTCTGAAGAACTTAAGAACTATG1824184
1824185GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAGCTTTACAATATCAAAGAAAAATTGAAACATCTAT1824249
1824250GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGGAAAATTATGGGAAAAGTTTACAGATATCATGAGA1824314
1824315GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGTAAAAATAAACCTCCTAAACAAATATTTCACGCATA1824379
1824380GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGCTTGTAATCGCTGAATAAAGATTTCTAGCTTCGTTATT1824446
1824447GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGGACTCTGCCATCCCTGTAACGAACAGCCTTACAGCAA1824512
1824513GTTTTATATTAACTAAGTGGTATGTAAAGAACAAAAAAGATACATCTGTAACTAATTTTTATACT1824577
1824578GTTTTATATTAATTAAGTGGTATGTAAAG1824606
Left flanking sequence : Till position 1823853 (length bp)
GGTATATGATAAATATTATCATTTGCACTACTCGTGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAATTGTATAGATGT
AAGTGTTGGAAATACTCAATTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1824606 (length bp)
ACAGATATAATGTCAAAATAAGGTTAGGACTTTTAAAAGCATAGCCATATCAGTAAAAATTTAATTATCA
TTTAAAAAATAAATTTTTATTTAAAGAATA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp